[發明專利]一種基于脂質代謝相關基因的風險模型及其構建方法

在審

• 申請號: 202310543393.X
• 申請日: 2023-05-15
• 公開（公告）號: CN116344057A
• 公開（公告）日: 2023-06-27
• 發明（設計）人: 徐韶華;葉穎君;徐芳芳
• 申請（專利權）人: 上海市第一婦嬰保健院
• 主分類號: G16H50/30
• 分類號: G16H50/30;C12Q1/6886;G16B20/00;G06F17/18;G16B25/10
• 代理公司: 上海卓陽知識產權代理事務所(普通合伙) 31262
• 代理人: 巫蓓麗

本發明涉及一種基于脂質代謝相關基因的風險模型及其構建方法。本發明篩選出評估宮頸癌患者預后風險的生物標志物，基于宮頸癌免疫微環境設計新分型，并挖掘相關預后基因，進一步設計宮頸癌預后模型，對于篩選免疫治療獲益人群、發展新型免疫干預策略、指導精準醫療以及進一步改善宮頸癌患者預后具有重要意義。同時，本發明能對宮頸癌患者進行有效的風險評估以及免疫治療療效評估，可以為臨床醫生提供有價值的決策指導，進一步增加患者治療獲益，減少重復治療帶來的資源耗費，經濟層面上優化醫療資源分配，進一步提升宮頸癌患者預后及生活質量，具有重要的經濟效益與社會作用。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體地說，是關于一種基于脂質代謝相關基因的風險模型及其構建方法。

背景技術

宮頸癌是世界上第四常見的癌癥，宮頸癌患者的治療效果取決于診斷時的疾病進展，目前臨床上對宮頸癌患者的生存預測主要通過國際婦產科聯盟(FIGO)分期。盡管目前手術、放化療和免疫療法已極大改善了宮頸癌患者預后，但是晚期患者的預后仍然不容樂觀，因此探索更加有效的預后生物標志物對于臨床決策至關重要。

脂肪酸是能量代謝的重要組成部分，是生物膜信號轉導網絡的重要組成部分。從頭合成脂肪酸是癌細胞中普遍存在的特殊代謝表型之一，現有的基于脂肪酸代謝相關基因的宮頸癌預后模型是通過LASSO-COX分析構建的，能對宮頸癌患者進行危險度分層以預測宮頸癌患者預后、評估不同危險度宮頸癌患者腫瘤免疫微環境的特征，為臨床個性化治療提供了理論依據。而現有技術著重于分析不同危險度宮頸癌患者免疫微環境特征差異，卻未闡明不同危險度患者對免疫治療反應的差異，對于指導宮頸癌患者免疫治療欠缺證據，所以亟需一種基于脂質代謝相關基因的風險模型以評估預測宮頸癌患者的預后風險、不同危險度宮頸癌患者的免疫微環境特征差異以及不同風險度患者對免疫治療反應的差異。

中文專利CN108611416A，公開日2018.10.02，公開了一種基于多基因表達特征譜的宮頸癌個性化預后評估方法，包括以下步驟：獲取宮頸癌預后風險基因列表與基因權重；利用宮頸癌患者腫瘤組織轉錄組和生存數據構建預后評估模型；根據宮頸癌患者腫瘤組織的基因表達譜計算患者的風險得分；根據患者的風險得分計算患者每年的生存概率。而目前關于如本發明的一種基于脂質代謝相關基因的風險模型及其構建方法還未見報道。

發明內容

本發明的第一個目的是，針對現有技術中的不足，提供一種風險模型的構建方法。

本發明的第二個目的是，提供一種風險模型。

本發明的第三個目的是，提供風險模型的應用。

本發明的第四個目的是，提供一種試劑盒。

為實現上述第一個目的，本發明采取的技術方案是：

一種基于脂質代謝相關基因的風險模型的構建方法，包括以下步驟：

S1：收集患者轉錄組數據和臨床信息，以1：1的比例隨機分為訓練集和測試集；

S2：進行COX單因素回歸分析并確定關鍵基因；

S3：進行COX多因素回歸分析，然后輸出風險評分，根據脂代謝基因的表達數據，按照以下公式計算風險評分：風險評分＝表達系數×基因1+表達系數×基因2+表達系數×基因n系數。

S4：以風險評分將患者劃分為不同的風險集群。

作為一個優選例，所述構建方法還包括步驟S5：驗證模型的有效性；所述驗證是通過ROC曲線、Kaplan-Meier生存分析驗證模型的準確性。

為實現上述第二個目的，本發明采取的技術方案是：

一種基于脂質代謝相關基因的宮頸癌預后風險模型，所述的風險模型基于上述任一所述的方法構建獲得。