[發(fā)明專利]一種基于脂質代謝相關基因的風險模型及其構建方法

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• 申請日: 2023-05-15
• 公開（公告）號: CN116344057A
• 公開（公告）日: 2023-06-27
• 發(fā)明（設計）人: 徐韶華;葉穎君;徐芳芳
• 申請（專利權）人: 上海市第一婦嬰保健院
• 主分類號: G16H50/30
• 分類號: G16H50/30;C12Q1/6886;G16B20/00;G06F17/18;G16B25/10
• 代理公司: 上海卓陽知識產(chǎn)權代理事務所(普通合伙) 31262
• 代理人: 巫蓓麗

1.一種基于脂質代謝相關基因的風險模型的構建方法，其特征在于，包括以下步驟：

S1：收集患者轉錄組數(shù)據(jù)和臨床信息，以1：1的比例隨機分為訓練集和測試集；

S2：進行COX單因素回歸分析并確定關鍵基因；

S3：進行COX多因素回歸分析，然后輸出風險評分，根據(jù)脂代謝基因的表達數(shù)據(jù)，按照以下公式計算風險評分：風險評分＝表達系數(shù)×基因1+表達系數(shù)×基因2+表達系數(shù)×基因n系數(shù)；

S4：以風險評分將患者劃分為不同的風險集群。

2.根據(jù)權利要求1所述的構建方法，其特征在于，所述構建方法還包括步驟S5：驗證模型的有效性；所述驗證是通過ROC曲線、Kaplan-Meier生存分析驗證模型的準確性。

3.一種基于脂質代謝相關基因的宮頸癌預后風險模型，其特征在于，所述的風險模型基于權利要求1-2任一所述的方法構建獲得。

4.根據(jù)權利要求3所述的風險模型，其特征在于，所述的脂質代謝相關基因為以下8個基因的組合：ABHD3、ECH1、ALDH3A2、ACLY、AIG1、PLA2G4A、MSMO1和SGPL1。

5.根據(jù)權利要求3所述的風險模型，其特征在于，所述的風險模型包括風險評分，所述風險評分的風險分數(shù)＝＝-0.300121165035544*ABHD3表達量-0.011716176379551*ECH1表達量-0.12097107405999*ALDH3A2表達量+0.0506236801151428*ACLY表達量+0.174471467737777*AIG1表達量+0.0921835684010294*PLA2G4A表達量+0.0336185612202126*MSMO1表達量+0.10891144858713*SGPL1表達量。

6.根據(jù)權利要求5所述的風險模型，其特征在于，所述風險評分以中位數(shù)作為閾值將宮頸癌患者分為高風險組和低風險組。

7.權利要求3-6任一所述的風險模型在制備預測宮頸癌預后模型的試劑盒中的應用。

8.根據(jù)權利要求7所述的應用，其特征在于，所述的宮頸癌預后包括風險評估以及免疫治療療效評估。

9.檢測脂代謝基因表達量的試劑在制備預測宮頸癌免疫治療預后模型的試劑盒中的應用。

10.一種預測宮頸癌預后風險的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包括檢測脂質代謝相關基因表達量的試劑和脂代謝特征風險評分，所述的脂質代謝相關基因為以下8個基因的組合：ABHD3、ECH1、ALDH3A2、ACLY、AIG1、PLA2G4A、MSMO1和SGPL1；所述的脂質代謝相關基因為以下8個基因的組合：ABHD3、ECH1、ALDH3A2、ACLY、AIG1、PLA2G4A、MSMO1和SGPL1。