[發明專利]一種用于檢測頭頸鱗癌的核酸產品、試劑盒及應用

在審

• 申請號: 202310332504.2
• 申請日: 2023-03-30
• 公開（公告）號: CN116516005A
• 公開（公告）日: 2023-08-01
• 發明（設計）人: 周諦晗;張良祿;董蘭蘭;周俊;萬慧;阮彥添
• 申請（專利權）人: 武漢艾米森生命科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 武漢華之喻知識產權代理有限公司 42267
• 代理人: 曹葆青;方放

本發明屬于生物醫學領域，更具體地，涉及一種用于檢測頭頸鱗癌的核酸產品、試劑盒及應用。本發明提供的檢測頭頸鱗癌的核酸產品，通過檢測樣本中TRH基因上的靶區域的甲基化水平，能夠有效區分頭頸鱗癌患者和非癌患者，可用于檢測不同類型的頭頸鱗癌，包括喉癌、口腔癌和鼻咽癌。本發明提供的試劑盒通過檢測樣本中TRH基因上的任一靶區域的甲基化水平，對頭頸鱗癌組織樣本和血漿樣本均具有較高的檢測靈敏度和特異性。

技術領域

本發明屬于生物醫學領域，更具體地，涉及一種用于檢測頭頸鱗癌的核酸產品、試劑盒及應用。

背景技術

大多數頭頸部癌癥起源于口腔、咽部和喉部的黏膜上皮細胞，這些頭頸部癌癥被統稱為頭頸部鱗狀細胞癌(HNSCC)?？谇话┖秃戆┩ǔＥc吸煙、酗酒有關，而咽癌則越來越多地歸因于人乳頭瘤病毒(HPV)的感染，尤其是HPV-16。因此，HNSCC通?？梢苑譃镠PV陽性或HPV陰性兩大類。據統計，在2018年，全球范圍內有89萬HNSCC新發病例和45萬死亡病例，且其發病率持續上升，預計到2030年其發病率將上浮30％(即每年約有108萬新發病例)。盡管侵襲性HNSCC的組織學進展是從細胞非典型性增生(atypia)到細胞異型增生(dysplasia)再進展為癌的，但是大多數患者在確診HNSCC時，疾病已經進入晚期且他們在臨床上并沒有明顯的癌前病變，這給HNSCC患者的早診早治療帶來了極大的困難。然而，在HNSCC的早期(即腫瘤細胞尚未發生轉移時)確診，可以顯著提高患者的預后。因此，目前急需高靈敏度、高特異性的HNSCC的早期診斷方法，以改善患者的生存質量和生命周期。

異常的基因甲基化與癌癥有著密切的關系，如抑癌基因啟動子區域的高度甲基化會導致抑癌基因轉錄沉默，進而導致癌癥發生和發展。因此，HNSCC中發生甲基化水平改變的基因可能作為其早期診斷的分子標志物，若可以通過液體活檢的方法檢測腫瘤細胞釋放到體液中的表觀遺傳信息的變化，則可以對高危患者進行無創或微創診斷、從而提高早期HNSCC的檢出率，進而提高患者的生存率。

目前臨床上尚未有明確的可用于頭頸鱗癌診斷的分子標志物，現有技術公開的一些用于診斷頭頸鱗癌患者體液樣本的分子標志物，其診斷性能仍需要進一步優化。因此，高靈敏度、高特異性的用于頭頸鱗癌診斷的分子標志物仍然是急需的。

發明內容

針對現有技術的缺陷，本發明的目的在于提供一種用于檢測頭頸鱗癌的核酸產品、試劑盒及應用，以解決現有技術對于頭頸鱗癌診斷的侵入性操作，診斷性能較差，尤其是對頭頸鱗癌血漿樣本的檢測靈敏度和特異性較低，缺乏對喉癌、口腔癌、鼻咽癌等不同類型的頭頸鱗癌的檢測等問題。

為實現上述目的，本發明提供了一種用于檢測頭頸鱗癌的核酸產品，其為用于檢測樣本中TRH基因CpG島上的靶區域的甲基化水平的核酸產品；

以GRCh38.p14為參考基因組，所述靶區域包括Chr3:129974443-129974790負鏈的全長區域或部分區域中的至少一個。

優選地，所述Chr3:129974443-129974790負鏈的部分區域包括Chr3:129974631-129974785、Chr3:129974657-129974765、Chr3:129974646-129974737、Chr3:129974512-129974676、Chr3:129974540-129974662和Chr3:129974443-129974616。

優選地，所述核酸產品包括用于檢測所述靶區域的甲基化水平的引物對，可選地，還包括檢測探針。

優選地，所述核酸產品包括用于檢測所述Chr3:129974443-129974790負鏈的全長區域的甲基化水平的甲基化引物對和非甲基化引物對；進一步優選地，所述甲基化引物對的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.16～17所示，所述非甲基化引物對的核苷酸序列如SEQ?IDNO.18～19所示。