[發明專利]與谷子籽粒蛋白質含量性狀相關的SNP標記及其檢測引物和應用

在審

• 申請號: 202310276652.7
• 申請日: 2023-03-20
• 公開（公告）號: CN116334284A
• 公開（公告）日: 2023-06-27
• 發明（設計）人: 王海崗;黃蕊;穆志新;秦慧彬;陳宏運;劉心;劉歡
• 申請（專利權）人: 山西農業大學農業基因資源研究中心;深圳華大生命科學研究院;深圳華大萬物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京正華智誠專利代理事務所(普通合伙) 11870
• 代理人: 呂春艷

1.一種與谷子籽粒蛋白質含量性狀相關的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記為GPC-09-404標記，位于谷子第9染色體第51549836位，其核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1或SEQ?IDNO.2所示。

2.用于檢測權利要求1所述的SNP標記的引物組合物，其特征在于，包括PrimerX、PrimerY和通用引物，其序列如下：

PrimerX：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’；

PrimerY：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’；

通用引物：5’-ACTGGTGCCCGCTCTTCC-3’。

3.一種檢測谷子籽粒蛋白質含量的方法，其特征在于，包括以下步驟：

提取待測谷子樣品的基因組DNA；

以提取的基因組DNA為模板，利用權利要求2所述引物組合物對其進行PCR擴增，若擴增產物只檢測到引物PrimerX對應的熒光信號，則檢測位點為堿基A，判定待測谷子樣品籽粒蛋白質含量為低蛋白；

若擴增產物只檢測到引物PrimerY對應的熒光信號，則檢測位點為堿基C，判定待測谷子樣品籽粒蛋白質含量為高蛋白。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，PCR擴增體系包括：HiGeno2x?Probe?Mix、SNP-Specific?Primers、DNA模板和無菌水。

5.根據權利要求3或4所述的方法，其特征在于，PCR擴增程序為：程序1：95℃預變性10-15min，1個循環；

程序2：95℃變性20secs，61-55℃退火/延伸40secs，10個循環；

程序3：95℃變性20secs，55℃退火/延伸40secs，28-34個循環。

6.權利要求1所述的與谷子籽粒蛋白質含量性狀相關的SNP標記在谷子籽粒蛋白質含量測定或分子篩選育種中的應用。

7.權利要求3-5任一項所述的檢測谷子籽粒蛋白質含量的方法在谷子分子篩選育種中的應用。

8.一種篩選或輔助篩選具有高/低籽粒蛋白質含量的性狀的谷子的方法，其特征在于，包括：按照權利要求3-5任一項所述的方法檢測谷子籽粒蛋白質含量，然后根據檢測結果篩選或輔助篩選具有高/低籽粒蛋白質含量的性狀的谷子。

9.一種谷子育種方法，其特征在于，包括：將權利要求8篩選得到的具有高籽粒蛋白質含量的性狀的谷子作為育種材料進行育種。

10.一種檢測谷子籽粒蛋白質含量的試劑盒，其特征在于，包括權利要求2所述引物組合物。