[發明專利]與鑒定母豬殺嬰行為相關的SNP分子標記及其在遺傳育種中的應用

在審

• 申請號: 202310145148.3
• 申請日: 2023-02-21
• 公開（公告）號: CN116042861A
• 公開（公告）日: 2023-05-02
• 發明（設計）人: 劉欣;王立賢;顏華
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

本發明公開了與鑒定母豬殺嬰行為頻率相關的SNP分子標記及其在遺傳育種中的應用。本發明所要解決的問題是如何鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為的頻率。本發明涉及分子生物學及遺傳育種技術領域，尤其涉及與鑒定母豬殺嬰行為相關的SNP分子標記及其在遺傳育種中的應用。該SNP為豬3號染色體上的一個位點，其核苷酸種類為T或C，為序列表中序列3的第89位核苷酸。該SNP的基因型為TT或CC的待測母豬個體發生殺嬰行為的頻率低于或候選低于基因型為TC的待測豬。本發明可用于輔助鑒定母豬殺嬰行為的頻率，可以對豬品種進行早期篩選，提高仔豬存活率，可與其他的母豬殺嬰行為頻率相關的分子標記結合輔助進行豬育種。

技術領域

本發明涉及分子生物學及遺傳育種技術領域，尤其涉及與鑒定母豬殺嬰行為相關的SNP分子標記及其在遺傳育種中的應用。

背景技術

母豬母性行為的好壞對仔豬的存活、生長發育及福利都有著重要的影響。母豬殺嬰行為是指母豬在分娩期間或仔豬出生后24小時之內咬傷甚至咬死新生仔豬的行為，也被稱為母豬的咬仔行為。母豬的這種異常行為是極端惡劣的母性行為。有研究報道，商業母豬群體中，母豬的殺嬰行為頻率達到7-12％，初產母豬發生頻率更高，對生產造成重大損失。

母豬殺嬰行為受到神經和內分泌的調控。大腦的神經系統調控激素分泌，從而調控行為的發生。YWHAG基因被研究報道通在大腦中高度表達，調節多種細胞信號通路。并發現該基因的突變導致發育性腦病、癲癇疾病和發育遲緩或退化的發生。因此我們對母豬YWHAG基因與母豬母性行為進行關聯研究，并發現顯著關聯位點，通過利用分子生物學手段，為早期鑒定母豬殺嬰行為提供有效手段。

發明內容

本發明所要解決的問題是如何鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為的頻率。

為了解決以上技術問題，本發明首先提供了檢測豬基因組中SNP的多態性或基因型的物質的應用。

本發明所提供的應用為檢測豬基因組中SNP的多態性或基因型的物質在如下任一種中的應用，

(1)檢測與母豬殺嬰行為頻率相關的單核苷酸多態性或基因型的產品；

(2)鑒定或輔助鑒定與母豬殺嬰行為頻率相關的產品；

(3)用于豬育種的產品；

(4)制備鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率的產品；

(5)制備篩選或選育母豬殺嬰行為頻率低的豬品種的產品；

所述SNP為豬3號染色體上的一個位點，其核苷酸種類為T或C，為序列表中序列3的第89位核苷酸。

以豬基因組序列(10.2版本(http://asia.ensembl.org/Sus_scrofa/Info/Index))為參考基因組，所述SNP為豬3號染色體上9907599bp處(具體為序列表中序列3第89位)。

本發明還提供了鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率的方法。

本發明所提供的鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率的方法包括檢測待測豬基因組中前文所述SNP的基因型，根據所述待測豬的所述SNP的基因型鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率高低：所述SNP為豬3號染色體上的一個位點，其核苷酸種類為T或C，為序列表中序列3的第89位核苷酸；基因型為TT、TC或CC，所述基因型TT是所述SNP為T的純合型，所述基因型CC是所述SNP為C的純合型，所述基因型TC是所述SNP為T和C的雜合型；

所述鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率的方法具體為如下：

1)前文所述SNP的基因型為TT或CC的待測豬為或候選為母豬殺嬰行為頻率低的豬品種；

2)前文所述SNP的基因型為TC的待測豬為或候選為母豬殺嬰行為頻率高的豬品種；