[發(fā)明專利]與鑒定母豬殺嬰行為相關的SNP分子標記及其在遺傳育種中的應用

在審

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• 申請日: 2023-02-21
• 公開（公告）號: CN116042861A
• 公開（公告）日: 2023-05-02
• 發(fā)明（設計）人: 劉欣;王立賢;顏華
• 申請（專利權）人: 中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

1.檢測豬基因組中SNP的多態(tài)性或基因型的物質在如下任一種中的應用：

(1)檢測與母豬殺嬰行為頻率相關的單核苷酸多態(tài)性或基因型的產品；

(2)鑒定或輔助鑒定與母豬殺嬰行為頻率相關的產品；

(3)用于豬育種的產品；

(4)制備鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率的產品；

(5)制備篩選或選育母豬殺嬰行為頻率低的豬品種的產品；

所述SNP為豬3號染色體上的一個位點，其核苷酸種類為T或C，為序列表中序列3的第89位核苷酸。

2.鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率的方法，其特征在于：包括檢測待測豬基因組中權利要求1中所述SNP的基因型，根據(jù)所述待測豬的所述SNP的基因型鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率高低：所述SNP為豬3號染色體上的一個位點，其核苷酸種類為T或C，為序列表中序列3的第89位核苷酸；基因型為TT、TC或CC，所述基因型TT是所述SNP為T的純合型，所述基因型CC是所述SNP為C的純合型，所述基因型TC是所述SNP為T和C的雜合型；

所述鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率高低的方法具體為如下：

1)權利要求1中所述SNP的基因型為TT或CC的待測豬為或候選為母豬殺嬰行為頻率低的豬品種；

2)權利要求1中所述SNP的基因型為TC的待測豬為或候選為母豬殺嬰行為頻率高的豬品種；

3)權利要求1中所述SNP的基因型為TT或CC的待測母豬個體發(fā)生殺嬰行為的頻率低于或候選低于所述SNP的基因型為TC的待測豬。

3.權利要求2所述的方法在豬育種中的應用。

4.豬育種的方法，其特征在于：所述方法包括檢測豬基因組中權利要求1中所述SNP位點的基因型，選擇所述SNP的基因型為TT或CC的豬作為親本進行育種，所述TT基因型是所述SNP為T的純合型，所述CC基因型是所述SNP為C的純合型，所述方法的育種目的包括選育母豬殺嬰行為頻率低的豬。

5.根據(jù)權利要求1或3所述的應用、權利要求2或4中所述的方法，其特征在于：所述豬育種為培育母豬殺嬰行為頻率低的豬品種。

6.產品，其特征在于：所述產品為含有權利要求1中所述檢測豬基因組SNP的多態(tài)性或基因型的物質的產品，且可為下述G1)-G5)中的任一種：

G1)檢測母豬殺嬰行為頻率相關的單核苷酸多態(tài)性或基因型的產品；

G2)鑒定或輔助鑒定母豬殺嬰行為頻率的產品；

G3)用于豬育種的產品；

C4)篩選或選育母豬殺嬰行為頻率低的豬品種的產品；

C5)制備篩選或選育母豬殺嬰行為頻率低的豬品種的產品。

7.根據(jù)權利要求1所述的應用或權利要求6所述的產品，其特征在于：所述物質為如下D1)、D2)或D3)：

D1)所述物質為擴增包含權利要求1所述SNP的豬基因組DNA片段的引物組合物；

D2)所述物質為含有D1)所述引物組合物的PCR試劑；

D3)所述物質為含有D1)所述引物組合物或D2)所述PCR試劑的試劑盒。

8.根據(jù)權利要求7所述的應用或產品，其特征在于：所述引物組合物由引物U和引物D組成；所述引物U為核苷酸序列是序列表中序列1的單鏈DNA分子；所述引物D為核苷酸序列是序列表中序列2的單鏈DNA分子。

9.DNA分子，其特征在于：所述DNA分子的核苷酸序列是序列表中的序列3。

10.用于母豬殺嬰行為頻率篩查的設備，包括：

測序裝置，所述測序裝置用于對待測豬的基因組中包括權利要求1所述SNP的DNA片段進行測序，獲得測序結果；

比對裝置，所述比對裝置與所述測序裝置相連，且用于基于所述測序結果，確定所述SNP的基因型；

分析裝置，所述分析裝置與所述比對裝置相連，且用于基于所述基因型確定母豬殺嬰行為的頻率。