[發(fā)明專利]g.55904G＞A、g.55993T＞C和g.56067G＞A在湖羊分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202310064521.2
• 申請(qǐng)日: 2023-01-16
• 公開（公告）號(hào): CN116219033A
• 公開（公告）日: 2023-06-06
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 單慧麗;姜俊芳;黃新;鄭開之;曹陽(yáng)
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 杭州恒翌專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 33298
• 代理人: 王從友

本發(fā)明屬于湖羊分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及SNPs分子標(biāo)記g.55904G＞A、g.55993T＞C和g.56067G＞A在湖羊分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用。該分子標(biāo)記定位為g.55904G＞A、g.55993T＞C和/或g.56067G＞A；其中：g.55904G＞A與胸圍，初生重顯著相關(guān)，AA個(gè)體的胸圍顯著高于GA，GG個(gè)體，GG個(gè)體的初生重顯著高于AA與GA個(gè)體；g.55993T＞C與胸圍顯著相關(guān)，CC基因型顯著高于TT個(gè)體，與TC相比差異不顯著，TT與TC相比差異不顯著；g.56067G＞A與胸圍，初生重顯著相關(guān)，AA基因型的胸圍顯著高于GA與GG個(gè)體，GG與GA相比差異不顯著，GG個(gè)體的初生重顯著高于GA，AA個(gè)體，GA與AA相比差異不顯著。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于湖羊分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及SNPs分子標(biāo)記g.55904G＞A、g.55993T＞C和g.56067G＞A在湖羊分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用。

背景技術(shù)

湖羊是我國(guó)珍稀的綿羊品種，原產(chǎn)于太湖流，所產(chǎn)羔皮花紋美觀而著稱，是我國(guó)特有的羔皮用綿羊品種，也是目前世界上少有的白色羔皮品種，在國(guó)際市場(chǎng)上享有很高的聲譽(yù)，有“軟寶石”之稱。湖羊肉質(zhì)鮮美湖羊體型大產(chǎn)肉量高，且肉質(zhì)鮮美，營(yíng)養(yǎng)豐富。湖羊肉與其他肉類相比,具有高蛋白、低脂肪、低膽固醇的優(yōu)點(diǎn),多汁、膻味小。但湖羊產(chǎn)在肉性能方面與杜泊羊、德國(guó)美利奴羊等國(guó)外肉用綿羊品種還存在較大差異。因此，非常有必要對(duì)湖羊生長(zhǎng)性能進(jìn)行選育，提高湖羊的產(chǎn)肉性能。

本申請(qǐng)人已有授權(quán)中國(guó)發(fā)明專利(公開號(hào)：CN109251986A、CN109182553A、CN109251987A、CN109251985A、CN109182554A和CN109055579A)公開了利用GWAS技術(shù)篩選的湖羊體尺性狀候選功能基因及SNPs，并通過SNPs的群體驗(yàn)證，獲得了可用于分子標(biāo)記輔助育種的SNPs，可用于湖羊肉用性狀分子標(biāo)記輔助育種和湖羊肉用系核心群個(gè)體的早期選育。

前期，本申請(qǐng)人還申請(qǐng)了中國(guó)發(fā)明專利申請(qǐng)(CN114381531A、CN114438232A、CN114574596A、CN114480676A)公開了在ARHGAP24基因內(nèi)含子1部分區(qū)內(nèi)有15個(gè)SNPs,其中與湖羊體重、體尺性狀顯著相關(guān)的SNPs位點(diǎn)有4個(gè)：1.g.43756G＞A與湖羊體長(zhǎng)顯著相關(guān)，AA型個(gè)體的體長(zhǎng)顯著高于GA型個(gè)體(P＜0.05)，GG型個(gè)體與GA，AA型個(gè)體相比差異不顯著(P＞0.05)。2.g.43815G＞A與湖羊體高顯著相關(guān)，AA型個(gè)體的體高顯著高于GG型個(gè)體(P＜0.05)，GA型個(gè)體與GG，AA型個(gè)體相比差異不顯著(P＞0.05)。3.g.43851G＞A與湖羊體長(zhǎng)顯著相關(guān)，AA型個(gè)體的體長(zhǎng)顯著高于GA型個(gè)體(P＜0.05)，GG型個(gè)體與GA，AA型個(gè)體相比差異不顯著(P＞0.05)。4.g.43917A＞G與湖羊體長(zhǎng)和日增重顯著相關(guān)，AA與GG型個(gè)體的體長(zhǎng)顯著高于AG型個(gè)體(P＜0.05)，AA與GG相比差異不顯著(P＞0.05)，GG型個(gè)體斷奶到六月齡日增重顯著高于AA型個(gè)體，AG型個(gè)體與AA，GG相比差異不顯著。

鈣蛋白酶(Calpain,CAPN)，是一類存在于脊椎動(dòng)物細(xì)胞質(zhì)中的鈣依賴性半胱氨酸中性蛋白水解酶，與鈣蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin,CAST)和鈣蛋白酶激活蛋白(CalpainActivator)構(gòu)成依賴于鈣離子的蛋白水解酶系統(tǒng)，對(duì)動(dòng)物宰后肌肉成熟嫩化過程有重要作用。CAPN3(Calpain3)也稱為p94，是鈣蛋白酶基因家族的成員之一，骨骼肌中特異性表達(dá)的鈣蛋白酶。CAPN3的結(jié)構(gòu)與CAPN1和CAPN2的大亞基相似，有四個(gè)結(jié)構(gòu)域；I、II、III和IV，三個(gè)CAPN3的特殊序列，分別是NS、IS1和IS2，位于N端、DII蛋白酶結(jié)構(gòu)域和DIII與DIV?Ca2-D之間、DIII和DIV位于Ca2t結(jié)合域之間。在人體中CAPN3基因缺陷可引起人的2A型肢帶型肌營(yíng)養(yǎng)不良。