[發明專利]g.55904G＞A、g.55993T＞C和g.56067G＞A在湖羊分子標記輔助育種中的應用

在審

• 申請號: 202310064521.2
• 申請日: 2023-01-16
• 公開（公告）號: CN116219033A
• 公開（公告）日: 2023-06-06
• 發明（設計）人: 單慧麗;姜俊芳;黃新;鄭開之;曹陽
• 申請（專利權）人: 浙江省農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 杭州恒翌專利代理事務所(特殊普通合伙) 33298
• 代理人: 王從友

1.一種與湖羊胸圍和/或初生重顯著相關的SNPs分子標記，其特征在于，該分子標記定位為g.55904G＞A、g.55993T＞C和/或g.56067G＞A；其中：

g.55904G＞A與胸圍，初生重顯著相關，AA個體的胸圍顯著高于GA，GG個體，GG個體的初生重顯著高于AA與GA個體；

g.55993T＞C與胸圍顯著相關，CC基因型顯著高于TT個體，與TC相比差異不顯著，TT與TC相比差異不顯著；

g.56067G＞A與胸圍，初生重顯著相關，AA基因型的胸圍顯著高于GA與GG個體，GG與GA相比差異不顯著，GG個體的初生重顯著高于GA，AA個體，GA與AA相比差異不顯著。

2.一種用于檢測權利要求1中所述SNPs分子標記的引物對。

3.權利要求2所述的引物對擴增獲得的擴增產物，該擴增產物的序列如SEQ?ID?NO:1或SEQ?ID?NO:2所示。

4.一種用于擴增權利要求3所述的擴增產物的引物對。

5.根據權利要求4所述的引物對，其特征在于，

擴增如SEQ?ID?NO:1序列的產物，引物對的序列如SEQ?ID?NO:3?和SEQ?ID?NO:4所示；

擴增如SEQ?ID?NO:2序列的產物，引物對的序列如SEQ?ID?NO:5和SEQ?ID?NO:6所示。

6.一種包含權利要求2或4或5所述引物對的試劑盒。

7.權利要求1所述的SNPs分子標記、權利要求2或4或5所述的引物對和權利要求6所述的試劑盒在篩選胸圍和/或初生重性狀和湖羊分子標記育種中的應用；其中：

g.55904G＞A與胸圍，初生重顯著相關，AA個體的胸圍顯著高于GA，GG個體，GG個體的初生重顯著高于AA與GA個體；

g.55993T＞C與胸圍顯著相關，CC基因型顯著高于TT個體，與TC相比差異不顯著，TT與TC相比差異不顯著；

g.56067G＞A與胸圍，初生重顯著相關，AA基因型的胸圍顯著高于GA與GG個體，GG與GA相比差異不顯著，GG個體的初生重顯著高于GA，AA個體，GA與AA相比差異不顯著。

8.一種篩選湖羊胸圍和/或初生重性狀的方法，其特征在于，該方法包括以下步驟：提取湖羊外周血基因組DNA，采用權利要求2或4或5所述的引物對進行PCR擴增，對擴增產物中權利要求1所述的SNPs分子標記進行檢測，從而篩選出湖羊的胸圍和/或初生重性狀；其中：

g.55904G＞A與胸圍，初生重顯著相關，AA個體的胸圍顯著高于GA，GG個體，GG個體的初生重顯著高于AA與GA個體；

g.55993T＞C與胸圍顯著相關，CC基因型顯著高于TT個體，與TC相比差異不顯著，TT與TC相比差異不顯著；

g.56067G＞A與胸圍，初生重顯著相關，AA基因型的胸圍顯著高于GA與GG個體，GG與GA相比差異不顯著，GG個體的初生重顯著高于GA，AA個體，GA與AA相比差異不顯著。

9.根據權利要求8所述的方法，其特征在于，PCR?反應體系為25?μL，KOD?OneTM?PCRMaster?Mix12.5?μL，全血模板1μL，上下游引物各0.2?μL，ddH2O?11.1?μL；反應程序為：98℃變性10?s，?退火30?s，68?℃延伸30?s，擴增?34?個循環，PCR?結束后4?℃保存。

10.權利要求8過9所述的方法在湖羊分子標記育種中的應用。