[發(fā)明專利]一種潛在的關(guān)鍵自噬相關(guān)基因及其在哮喘中的臨床應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202310008149.3 | 申請日: | 2023-01-04 |
| 公開(公告)號: | CN115831229A | 公開(公告)日: | 2023-03-21 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 梁玉婷;張勝;喬龍威;邱駿 | 申請(專利權(quán))人: | 蘇州大學(xué)附屬第一醫(yī)院 |
| 主分類號: | G16B25/10 | 分類號: | G16B25/10;G16B40/00;G16B50/00 |
| 代理公司: | 南通毅帆知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 32386 | 代理人: | 孫燁 |
| 地址: | 215006 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 潛在 關(guān)鍵 相關(guān) 基因 及其 哮喘 中的 臨床 應(yīng)用 | ||
本發(fā)明涉及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體涉及一種潛在的關(guān)鍵自噬相關(guān)基因及其在哮喘中的臨床應(yīng)用。本發(fā)明公開了一種哮喘中自噬相關(guān)差異表達(dá)基因,包括上調(diào)基因和/或下調(diào)基因,所述上調(diào)基因選自下組中的至少一種:VEGFA、ATG2A、DNAJB1、ERN1、DDIT3、HIF1A、BNIP3、ATG16L2、SPHK1、PPP1R15A;所述下調(diào)基因選自下組中的至少一種:DAPK1、MAPK8、TUSC1、HSPB8、GAA、PEX14、GOPC。本發(fā)明通過生物信息學(xué)分析,確定了與哮喘相關(guān)的自噬相關(guān)DEGs,發(fā)現(xiàn)了ERN1基因具有無創(chuàng)診斷價值,可作為治療哮喘的潛在靶點,為哮喘患者帶來了福音。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體涉及一種潛在的關(guān)鍵自噬相關(guān)基因及其在哮喘中的臨床應(yīng)用。
背景技術(shù)
哮喘是一種臨床慢性異質(zhì)性肺部疾病,其特征是慢性炎癥、氣道高反應(yīng)性、粘液分泌過多、氣道重塑和氣道狹窄,影響著全球超過3億人。哮喘患者有典型的呼吸系統(tǒng)癥狀,包括呼吸困難、喘息、胸悶和咳嗽,但緩解期可無任何體征;臨床常采用血細(xì)胞分析技術(shù)、肺功能檢查及過敏原檢測等輔助檢查手段,但實際應(yīng)用過程中影響因素較多,同時也缺乏敏感性與特異性,無法較精準(zhǔn)無創(chuàng)診斷。現(xiàn)階段研究顯示許多基因,包括一些自噬相關(guān)基因,參與并調(diào)節(jié)哮喘的發(fā)病機(jī)制,越來越多的證據(jù)表明,自噬在包括哮喘在內(nèi)的多種呼吸道疾病的發(fā)病機(jī)制中起著至關(guān)重要的作用。早期研究報道自噬相關(guān)基因與哮喘患者氣道重塑和呼吸系統(tǒng)機(jī)械損傷相關(guān)。然而,自噬最終調(diào)節(jié)哮喘發(fā)作的機(jī)制仍有待闡明。盡管已有研究表明自噬和哮喘之間存在遺傳關(guān)系,但許多與哮喘相關(guān)的自噬相關(guān)基因仍未確定,特別是與嚴(yán)重過敏性哮喘相關(guān)的基因。
發(fā)明內(nèi)容
在本發(fā)明中,申請人通過分析基因表達(dá)綜合(Gene Expression Omnibus, GEO)數(shù)據(jù)庫中的GSE76262數(shù)據(jù)集,探索哮喘中自噬相關(guān)差異表達(dá)基因(DEGs),采用受試者工作特征(ROC)曲線單因素分析評價自噬相關(guān)生物標(biāo)志物在哮喘中的診斷價值。通過目前的生物信息學(xué)分析,申請人確定了17種與哮喘相關(guān)的潛在自噬相關(guān)DEGs。結(jié)果提示,關(guān)鍵基因ERN1可能通過調(diào)節(jié)自噬作用影響哮喘的發(fā)生發(fā)展,提示該基因可能具有無創(chuàng)診斷價值。本發(fā)明的結(jié)果可能會加深申請人對自噬在哮喘中作用的認(rèn)識,并為通過靶向自噬治療哮喘性氣道炎癥提供新的途徑,特別是靶向抑制ERN1可能在哮喘的治療中有用。
具體的,本發(fā)明的技術(shù)方案如下:
本發(fā)明第一個方面公開了一種哮喘中自噬相關(guān)差異表達(dá)基因,包括上調(diào)基因和/或下調(diào)基因,所述上調(diào)基因選自下組中的至少一種:VEGFA、ATG2A、DNAJB1、ERN1、DDIT3、HIF1A、BNIP3、ATG16L2、SPHK1、 PPP1R15A;
所述下調(diào)基因選自下組中的至少一種:DAPK1、MAPK8、TUSC1、HSPB8、GAA、PEX14、GOPC;
所述VEGFA、ATG2A、DNAJB1、ERN1、DDIT3、HIF1A、BNIP3、ATG16L2、SPHK1、PPP1R15A、DAPK1、MAPK8、TUSC1、HSPB8、GAA、PEX14、GOPC的核苷酸序列分別如SEQ ID NO:1-17所示。
本發(fā)明第二個方面公開了一種自噬相關(guān)差異表達(dá)基因相關(guān)的生物標(biāo)志物,所述生物標(biāo)志物選自下組中的至少一種:VEGFA、ATG2A、DNAJB1、ERN1、DDIT3、HIF1A、BNIP3、ATG16L2、SPHK1、 PPP1R15A、DAPK1、MAPK8、TUSC1、HSPB8、GAA、PEX14、GOPC。
優(yōu)選的,所述生物標(biāo)志物為HIF1A、ERN1或DNAJB1。
更優(yōu)選的,所述生物標(biāo)志物為ERN1。
本發(fā)明第三個方面公開了一種用于哮喘的無創(chuàng)診斷標(biāo)志物,所述標(biāo)志物包括上述的生物標(biāo)志物。
本發(fā)明第三個方面公開了一種用于治療哮喘的藥物,所述藥物靶向抑制ERN1基因。
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