[發明專利]一種妊娠期并發癥風險預測模型及其應用

在審

• 申請號: 202211655279.8
• 申請日: 2022-12-21
• 公開（公告）號: CN115831367A
• 公開（公告）日: 2023-03-21
• 發明（設計）人: 翟兵兵;劉建紅;鄧濤;李佳欣;魏瑗;陶源;孫立超
• 申請（專利權）人: 北京博奧醫學檢驗所有限公司
• 主分類號: G16H50/30
• 分類號: G16H50/30;G16B25/00;G16B30/00;C12Q1/6883;G01N33/68
• 代理公司: 北京預立生科知識產權代理有限公司 11736
• 代理人: 李紅偉;高倩倩

本發明提供了一種妊娠期并發癥風險預測模型及其應用，涉及ABHD17A、CFAP157、CTNNBIP1、CTR9、FAM227A、LILRA5、NPTN、NSD1、OBP2B、OR10H4、PAQR9、PLK3、PRSS58、SLC45A1、SP140L、SSR3、STAT1、STK31、TLE1、TMEM238基因及年齡、孕周、ffDNA、T21、T18、T13、BMI、受孕方式、無創指征、不良孕產史、是否多產、既往剖宮產數量臨床指征。本發明提供的模型可以高效快速的預測妊娠期并發癥，具有廣闊的應用前景。

技術領域

本發明屬于生物醫藥領域，具體涉及一種妊娠期并發癥風險預測模型及其應用。

背景技術

正常妊娠時，胚胎著床在宮腔的適當部位并繼續生長直至足月臨產。若胚胎種植在宮腔以外，或胚胎或胎兒在宮腔生長發育的時間過短或過長，或母體出現各種妊娠特有的臟器損害，即為妊娠并發癥。

妊娠期并發癥又稱妊娠期合并癥，是在未孕之前或妊娠期間發生的非妊娠直接引起的疾病，妊娠終止也不一定消失。妊娠期并發癥包括妊娠期高血壓、子癇前期、妊娠期糖尿病、前置胎盤、早產等，妊娠期并發癥會對孕婦產生非常嚴重的后果，故在孕早期進行風險預測評估是非常有必要的。

研究表明，妊娠期并發癥的發病與孕婦年齡、孕周等臨床指征和一系列生化指標有關。現在對于妊娠期并發癥例如子癇前期的預測，常使用一系列的生理生化指標、臨床指征數據、易感基因表達或者特異性蛋白檢測，這些方法大多因為指標或者易感基因受多方面的影響，導致結果不盡如人意。

因此彌補目前妊娠期并發癥在妊娠早期階段預測的不足，實現高效快速的妊娠期并發癥風險預測是亟待解決的問題。

發明內容

為彌補現有技術的不足，本發明提供了一種預測妊娠期并發癥風險的風險預測模型及其構建方法。

為實現上述目的，本發明采用如下技術方案：

本發明的第一方面提供了一種妊娠期并發癥風險預測模型的構建方法，所述方法包括以下步驟：

(1)獲取基因表達的biomaker；

(2)獲取臨床指征信息；

(3)將差異基因TSS信息與獲取的臨床指征信息聯合構建預測模型。

進一步，步驟(1)包括篩選差異基因TSS。

進一步，步驟(1)利用獲取的TSS的區域深度信息篩選差異基因TSS。

進一步，通過將獲取的TSS的區域深度信息轉換為rpkm來篩選差異基因TSS。

進一步，將TSS的區域深度信息轉換為rpkm的公式為rpkm＝read counts/(mappedreads(Millions)*TSS length(KB)。

進一步，TSS的區域深度信息指的是轉錄組起始位點上下游1000bp區域內的深度信息。

進一步，差異基因篩選標準為|log₂FC|＝1且FDR0.1。

進一步，步驟(1)還包括對篩選的差異基因TSS進一步通過特征選擇法篩選。

進一步，所述特征選擇法為遞歸特征消除法。

進一步，步驟(1)進一步包括計算通過遞歸特征消除法篩選的差異基因TSS的閾值。

進一步，所述閾值為約登指數。

進一步，依據得到的閾值對差異基因TSS進行二值化處理。

進一步，步驟(3)中通過邏輯回歸方法構建預測模型。

進一步，所述妊娠期并發癥為子癇前期。