[發明專利]肉瘤預后制劑、基因組合標志物及其檢測試劑的應用

在審

• 申請號: 202211290220.3
• 申請日: 2022-10-21
• 公開（公告）號: CN115612741A
• 公開（公告）日: 2023-01-17
• 發明（設計）人: 楊眉;黎志宏;王嘉杰
• 申請（專利權）人: 中南大學湘雅二醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/6869;G16B30/00;G16B40/00;G16B25/10;G16B50/30
• 代理公司: 長沙市融智專利事務所(普通合伙) 43114
• 代理人: 袁靖

本發明公開了肉瘤預后制劑、基因組合標志物及其檢測試劑的應用。本發明發現了SRPK1、DHRS12、TARDBP、LRRC1、HNMT、DCAF13、ALDH1A1、NETO2、CHD7、SLC19A1、GREM2、CCDC69、HMGN1、DPF3，14個基因組合標記物能用于肉瘤預后。本發明構建統計分析模型，通過檢測14個與肉瘤相關的基因，預測肉瘤預后，幫助臨床醫生進行用藥指導，實現精準醫療，以提高肉瘤患者的生存率。經驗證，本發明試劑盒能準確預測肉瘤預后，其適用范圍廣，準確率高，實驗周期短，對患者進行精準治療具有重要的臨床意義。

技術領域

本發明屬于生物醫藥領域，具體涉及肉瘤預后制劑、基因組合標志物及其檢測試劑的應用。

背景技術

肉瘤是來源于間葉組織的惡性腫瘤，多發生于皮膚、皮下、骨膜及長骨兩端。據統計，在美國每年約有11000位新發肉瘤患者，其中約3800人死于這種疾病，而全世界每年新發病例約為200000名。肉瘤可以發生于任何年齡，好發年齡在30-50歲，男性略多于女性，約60％發生在肢體部位，19％發生在軀干部位，其他部位還有腹膜后、頸部等。目前，已有100多種不同的亞型，表現出其組織學的多樣性。同樣他們的生物學行為也是多變的，從惰性、高度侵襲到遠處轉移。易復發是肉瘤的特征之一，并對預后有著深遠的影響，復發性肉瘤的組織學形態可隨著時間的進展發生相應的改變，如核分裂數的增加、組織學的異形性。

目前，肉瘤的診斷是臨床、影像、病理三者相結合，所有疑似肉瘤的標準診斷步驟包括：體檢、原發病灶的影像學檢查(X線平片、局部MRI和/或增強CT掃描)、胸部影像學檢查(胸部CT)、淋巴結B超、活檢等。其中，病理診斷和分類依據是腫瘤的分化特征，而不是腫瘤來源，病理形態學評估仍然是肉瘤診斷的金標準。完整地病理報告應該包括腫瘤的診斷、部位、深度、大小、組織學分級、壞死情況、切緣情況、病理核分裂情況、脈管癌栓、淋巴結狀態等。免疫組化、細胞病理及分子病理可用于輔助診斷和鑒別診斷。然而，不同類型的肉瘤愈后治療有所不同，但不同來源的肉瘤往往在臨床上有相似的表現，僅靠傳統的病理學檢測無法進行有效的區分。

基因診斷對于肉瘤的診斷和預后判斷有一定的價值，有利于識別預后較差的患者，對指導治療有很大幫助。隨著包括三代測序技術在內的基因測序技術的發展，對腫瘤發生和發展的認識越來越深入。除了DNA突變外，基因表達水平或相應的調控機制也會影響腫瘤的治療和預后。因此，高敏感度、高特異性的分子診斷方法的開發，成為肉瘤領域的重要課題。

發明內容

本申請的首要目的是克服現有技術中缺乏高敏感度、高特異性的肉瘤分子預后方法的缺陷，提供一種能夠用于肉瘤預后的基因組合標志物；

包括：

SRPK1、DHRS12、TARDBP、LRRC1、HNMT、DCAF13、ALDH1A1、NETO2、CHD7、SLC19A1、GREM2、CCDC69、HMGN1、DPF3中的至少一個。

本申請的基因組合標志物，還包括了各基因標志物中的任意長度的片段，也就是說，來自本發明涉及的以上14個基因中各自任意一個片段(該片段可以為任意長度)組合，均落入本申請的保護范圍中。

本發明的第二個目的是提供所述的基因組合標志物的檢測試劑在制備肉瘤預后制劑中的應用，所述基因標志物為：

SRPK1、DHRS12、TARDBP、LRRC1、HNMT、DCAF13、ALDH1A1、NETO2、CHD7、SLC19A1、GREM2、CCDC69、HMGN1、DPF3中的至少一個。

所述的檢測試劑為基因表達量檢測試劑。

可以通過檢測上述基因的表達量，來單獨或者綜合對肉瘤進行預后判斷。

根據圖2中的p值結果確定在肉瘤高危組和低危組之間有顯著差異的基因(p值小于0.05)，可以用于單獨或者綜合起來預后。