[發(fā)明專利]肉瘤預(yù)后制劑、基因組合標(biāo)志物及其檢測試劑的應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202211290220.3
• 申請日: 2022-10-21
• 公開（公告）號: CN115612741A
• 公開（公告）日: 2023-01-17
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 楊眉;黎志宏;王嘉杰
• 申請（專利權(quán)）人: 中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/6869;G16B30/00;G16B40/00;G16B25/10;G16B50/30
• 代理公司: 長沙市融智專利事務(wù)所(普通合伙) 43114
• 代理人: 袁靖

1.用于肉瘤預(yù)后的基因組合標(biāo)志物，其特征在于，包括：

SRPK1、DHRS12、TARDBP、LRRC1、HNMT、DCAF13、ALDH1A1、NETO2、CHD7、SLC19A1、GREM2、CCDC69、HMGN1、DPF3中的至少一個。

2.權(quán)利要求1所述的基因組合標(biāo)志物的檢測試劑在制備肉瘤預(yù)后制劑中的應(yīng)用，其特征在于，所述的基因組合標(biāo)志物包括：

SRPK1、DHRS12、TARDBP、LRRC1、HNMT、DCAF13、ALDH1A1、NETO2、CHD7、SLC19A1、GREM2、CCDC69、HMGN1、DPF3中的至少一個。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于，將基因標(biāo)志物的表達(dá)量歸一化處理后的FPKM值代入模型公式，計算每個樣本的風(fēng)險評分；

其中，所述模型公式為RS＝(2.528×FPKM SRPK1)+(-21.670×FPKM DHRS12)+(8.429×FPKM TARDBP)+(12.166×FPKM LRRC1)+(-2.991×FPKM HNMT)+(3.846×FPKM DCAF13)+(-5.367×FPKM ALDH1A1)+(10.015×FPKM NETO2)+(2.433×FPKM CHD7)+(4.264×FPKMSLC19A1)+(-3.433×FPKM GREM2)+(-0.670×FPKM CCDC69)+(13.340×FPKM HMGN1)+(2.412×FPKM DPF3)；

將納入模型的基因代入公式為每個樣本計算風(fēng)險評分，按各隊列風(fēng)險評分中位數(shù)進(jìn)行分組。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用，其特征在于，當(dāng)RS≤69.501時，將樣本劃分為低危組，當(dāng)RS69.501時，將樣本劃分為高危組。

5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于，所述檢測試劑為二代測序技術(shù)。

6.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于，所述檢測試劑針對的待測樣本選自原發(fā)性肉瘤組織和/或細(xì)胞。

7.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于，所述肉瘤包括：尤文肉瘤、平滑肌軟組織肉瘤、骨肉瘤、脂肪肉瘤、纖維肉瘤、肌肉瘤、神經(jīng)鞘瘤、滑膜肉瘤。

8.一種肉瘤預(yù)后制劑，其特征在于，包括權(quán)利要求2-7任一項中所述的檢測試劑。