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[發明專利]用于預測腫瘤進展及預后的基因標志物組合、試劑盒及系統有效

專利信息
申請號: 202211094688.5 申請日: 2022-09-03
公開(公告)號: CN115747329B 公開(公告)日: 2023-10-17
發明(設計)人: 吳玲祥;吳維 申請(專利權)人: 昂凱生命科技(蘇州)有限公司
主分類號: C12Q1/6886 分類號: C12Q1/6886;G16B20/30;G16B25/10;G16B25/20;G16H10/60
代理公司: 杭州信與義專利代理有限公司 33450 代理人: 萬景旺
地址: 215004 江蘇省蘇*** 國省代碼: 江蘇;32
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摘要:
搜索關鍵詞: 用于 預測 腫瘤 進展 預后 基因 標志 組合 試劑盒 系統
【權利要求書】:

1.一種基因標志物組合,其特征在于,所述基因標志物組合包括S100A10、FOSL2、SPP1、CAV1、ANXA1、VIM、CD44、SERPINH1、LGALS3、CEBPB、ATF5和LGALS1中的至少一個基因。

2.根據權利要求1所述的基因標志物組合,其特征在于,所述基因標志物組合包括S100A10、FOSL2、SPP1、CAV1、ANXA1、VIM、CD44、SERPINH1、LGALS3、CEBPB、ATF5和LGALS1。

3.權利要求1所述的基因標志物組合的表達水平檢測試劑在制備用于預測腫瘤進展和/或預后的試劑盒中的應用。

4.根據權利要求2所述的應用,其特征在于,所述基因標志物組合的表達水平檢測試劑為引物和/或探針。

5.一種預測腫瘤進展和/或預后的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求1所述的基因標志物組合的表達水平檢測試劑。

6.一種預測腫瘤進展和/或預后的系統,其特征在于,包括:

數據輸入模塊,用于獲得權利要求1所述基因標志物組合中各基因的表達水平;

預測模塊,與所述數據輸入模塊連接,用于根據所述各基因的表達水平,利用單樣本基因集富集分析方法預測腫瘤進展和/預后。

7.根據權利要求6所述的系統,其特征在于,所述預測模塊中,利用單樣本基因集富集分析方法獲得所述基因標志物組合的富集分數,富集分數越高,腫瘤進展越晚期,預后越差。

8.根據權利要求6所述的系統,其特征在于,所述各基因的表達水平是基于RNA樣本通過選自包括轉錄組測序、捕獲測序和qRT-PCR的組中的至少一種方法獲得的。

9.根據權利要求6所述的系統,其特征在于,還包括參數存儲模塊,與所述預測模塊連接,用于存儲所述富集分數參考值,所述富集分數參考值是利用群體樣本得到的。

10.根據權利要求9所述的系統,其特征在于,所述參數存儲模塊中的富集分數參考值根據所述預測模塊中的預測結果進行更新。

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