[發明專利]一種鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記及其應用

在審

• 申請號: 202211069355.7
• 申請日: 2022-09-02
• 公開（公告）號: CN116064829A
• 公開（公告）日: 2023-05-05
• 發明（設計）人: 王志秀;趙寧;白皓;畢瑜林;江勇;陳國宏;常國斌
• 申請（專利權）人: 揚州大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/6869
• 代理公司: 揚州蘇中專利事務所(普通合伙) 32222
• 代理人: 許必元

本發明提供一種鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記及其應用，屬于畜牧學、分子生物學技術領域，從青腳雞與黃腳雞的血液中提取基因組DNA；檢測MC1R_SNP1?3位點的單倍型組合；選擇MC1R_SNP1?3位點的單倍型組合為TCA/TCA、TCA/CCA的個體；其中檢測MC1R_SNP1?3位點的單倍型組合通過引物MC1R?F和MC1R?R進行PCR擴增以及測序檢測MC1R_SNP1?3位點上基因型，用軟件由MC1R_SNP1?3位點的基因型計算出單倍型；通過使用分子標記技術篩選出的位點和單倍型可以實現對雞青腳性狀的快速鑒定，操作簡便且結果可靠，對雞青腳性狀選擇提供科學依據。

技術領域

本發明涉及一種鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記及其應用，屬于畜牧學、分子生物學技術領域。

背景技術

對于雞而言，腳色一直是育種中的重要性狀之一。我國地域遼闊,因各地自然條件及飲食文化的差異,青腳性狀受到我國云、貴、川等地消費者的關注。根據市場消費需求，培育出消費者喜愛的腳色的雞品種，對養雞業中發揮重要作用。以往對雞青腳性狀的研究大都集中在不完全顯性的伴性遺傳上，而當前利用分子標記進行準確、高效的選育，有利于雞青腳性狀遺傳資源的保護。

因此，需要一種能夠鑒定雞青腳的方法，為雞青腳性狀選擇提供科學依據。

發明內容

本發明的目的在于解決現有技術中的不足，提供一種鑒別雞青腳的特異性分子標記，具體是一種采用SNP分子標記技術篩選出青腳性狀相關SNP位點精確區分青腳雞與黃腳雞的方法，利用分子標記對雞遺傳資源進行特異性鑒定。本發明的第二個目的在于提供MC1R的單倍型組合TCA/TCA、TCA/CCA，該單倍型組合主要分布在青腳雞中。

為了達到上述目的，本發明是通過以下技術方案實現的：一種鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記，所述SNP分子標記的核苷酸序列如SEQ?ID?NO：1所示，SNP分子標記位于雞基因組的11號染色體上，所述SNP分子標記位于MC1R基因第370、513、575處有C/T、T/C、G/A的三個突變，分別標記為MC1R_SNP1、MC1R_SNP2、MC1R_SNP3。

MC1R_SNP1代表MC1R_SNP1(C-370-T)；MC1R_SNP2代表MC1R_SNP2(T-513-C)；MC1R_SNP3代表MC1R_SNP3(G-575-A)。

SEQ?ID?NO：1：GCTTTGTAGGTGCTGCAGTTGTGCTCGGGGCCACGGCCTCCAGCCAGGGGGTCCCTGGGGGCTGAGGCCGGGGCCATGTCGATGCTGGCCCCCCTGCGCCTGCTGCGCGAGCCCTGGAACGCCAGTGAGGGCAACCAGAGCAATGCCACGGCCGGGGCCGGAGGTGCCTGGTGCCAGGGGCTGGACATCCCCAATGAGCTCTTCCTGACGCTGGGGCTGGTGAGCCTGGTGGAGAACCTGCTGGTGGTGGCCGCCATCCTCAAGAACAGGAATCTGCACTCGCCCACGTACTACTTCATCTGCTGCCTGGCCGTCTCCGACATGCTGGTGAGCGTCAGCAACCTGGCCAAGACGCTCTTCATGCTGCTGATGGAGCACGGCGTGC。

擴增所述的鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記的引物對，所述引物對序列如SEQ?IDNO：2和SEQ?ID?NO：3所示。

一種利用所述的鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記在鑒別雞青腳性狀的應用。

所述的鑒別雞青腳性狀的應用，所述應用的方法如下：

步驟1)：提取雞的基因組DNA；

步驟2)：針對MC1R基因選擇特異性擴增引物MC1R-F和MC1R-R，再以步驟1)的DNA為模板進行PCR擴增反應，獲得PCR產物；