[發明專利]一種鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記及其應用

在審

• 申請號: 202211069355.7
• 申請日: 2022-09-02
• 公開（公告）號: CN116064829A
• 公開（公告）日: 2023-05-05
• 發明（設計）人: 王志秀;趙寧;白皓;畢瑜林;江勇;陳國宏;常國斌
• 申請（專利權）人: 揚州大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/6869
• 代理公司: 揚州蘇中專利事務所(普通合伙) 32222
• 代理人: 許必元

1.一種鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記，其特征在于：所述SNP分子標記的核苷酸序列如SEQ?ID?NO：1所示，SNP分子標記位于雞基因組的11號染色體上，所述SNP分子標記位于MC1R基因第370、513、575處有C/T、T/C、G/A的三個突變，分別標記為MC1R_SNP1、MC1R_SNP2、MC1R_SNP3。

2.擴增如權利要求1所述的鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記的引物對，其特征在于：所述引物對序列如SEQ?ID?NO：2和SEQ?ID?NO：3所示。

3.一種利用權利要求1所述的鑒別雞青腳性狀的SNP分子標記在鑒別雞青腳性狀的應用。

4.根據權利要求3所述的鑒別雞青腳性狀的應用，其特征在于：所述應用的方法如下：

步驟1)：提取雞的基因組DNA；

步驟2)：針對MC1R基因選擇特異性擴增引物MC1R-F和MC1R-R，再以步驟1)的DNA為模板進行PCR擴增反應，獲得PCR產物；

步驟3)：將步驟2)得到的PCR產物進行基因序列測序，通過基因測序序列和峰圖判定雞腳色基因型；

步驟4)：將步驟3)得到的基因型輸入軟件計算得到個體單倍型。

5.根據權利要求4所述的鑒別雞青腳性狀的應用，其特征在于：所述步驟1)中提取雞的基因組DNA為雞翅下靜脈血樣基因組DNA。

6.根據權利要求4所述的鑒別雞青腳性狀的應用，其特征在于：所述步驟2)中所選用特異性擴增引物MC1R-F的序列如SEQ?ID?NO：2所示，引物MC1R-R的序列為SEQ?ID?NO：3所示。

7.根據權利要求4所述的鑒別雞青腳性狀的應用，其特征在于：所述步驟3)中獲得的測序結果，判定雞腳色的對應基因型：

MC1R_SNP1：若基因型為TT，表示受測個體為青腳純合基因型；若基因型為CT，表示受測個體為黃腳雜合基因型；若基因型為CC，表示受測個體為黃腳純合基因型；

MC1R_SNP2：若基因型為CC，表示受測個體為青腳純合基因型；若基因型為CT，表示受測個體為黃腳雜合基因型；若基因型為TT，表示受測個體為黃腳純合基因型；

MC1R_SNP3：若基因型為AA，表示受測個體為青腳純合基因型；若基因型為AG，表示受測個體為黃腳雜合基因型；若基因型為GG，表示受測個體為黃腳純合基因型。

8.根據權利要求4所述的鑒別雞青腳性狀的應用，其特征在于：所述步驟4)統計得到的單倍型，選擇單倍型組合為TCA/TCA、TCA/CCA的個體。