[發明專利]一種SH3TC2基因致病突變體及其在制備腓骨肌萎縮癥4C型診斷試劑盒中的應用在審
| 申請號: | 202211039435.8 | 申請日: | 2022-08-29 |
| 公開(公告)號: | CN115927354A | 公開(公告)日: | 2023-04-07 |
| 發明(設計)人: | 曾橋;鄧亞蘭;吳偉娟;王維 | 申請(專利權)人: | 湖南家輝生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/12 | 分類號: | C12N15/12;C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京高沃律師事務所 11569 | 代理人: | 蘇士瑩 |
| 地址: | 410205 湖南*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 sh3tc2 基因 致病 突變體 及其 制備 腓骨 萎縮 診斷 試劑盒 中的 應用 | ||
1.一種SH3TC2致病突變基因,其特征在于,所述SH3TC2致病突變基因包括c.590_591insAATG;
所述c.590_591insAATG在登錄號為NM_024577.4的6號外顯子的第590位和591位間存在AATG插入突變。
2.一種SH3TC2基因致病突變體,其特征在于,所述SH3TC2基因致病突變體為復合雜合突變,包括c.590_591insAATG和c.3733_3734delGG;
所述c.590_591insAATG在登錄號為NM_024577.4的6號外顯子的第590位和591位間存在AATG插入突變;
所述c.3733_3734delGG在登錄號為NM_024577.4的17號外顯子的第3733位和3734位存在GG缺失突變。
3.擴增權利要求2所述SH3TC2基因致病突變體的引物組,其特征在于,所述引物組包括:引物對1和引物對2;
所述引物對1包括SH3TC2-1F和SH3TC2-1R;
所述引物對2包括SH3TC2-2F和SH3TC2-2R;
所述SH3TC2-1F的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示;
所述SH3TC2-1R的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.2所示;
所述SH3TC2-2F的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.3所示;
所述SH3TC2-2R的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.4所示。
4.利用權利要求1所述SH3TC2致病突變基因或利用權利要求2所述的SH3TC2基因致病突變體或權利要求3所述的引物組在制備腓骨肌萎縮癥4C型診斷試劑或試劑盒中的應用。
5.一種腓骨肌萎縮癥4C型的診斷試劑盒,其特征在于,所述診斷試劑盒包括權利要求3所述的引物組。
6.根據權利要求5所述的診斷試劑盒,其特征在于,所述診斷試劑盒還包括測序引物;所述測序引物包括:引物對3和引物對4;
所述引物對3包括SH3TC2-Seq1F和SH3TC2-Seq1R;
所述引物對4包括SH3TC2-Seq2F和SH3TC2-Seq2R;
所述SH3TC2-Seq1F的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.5所示;
所述SH3TC2-Seq1R的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.6所示;
所述SH3TC2-Seq2F的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.7所示;
所述SH3TC2-Seq2R的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.8所示。
7.根據權利要求5或6所述的診斷試劑盒,其特征在于,所述診斷試劑盒還包括c.3733_3734delGG位點陽性突變參考品DNA1和c.590_591insAATG位點陽性突變參考品DNA2;
所述DNA1的單鏈核苷酸序列如SEQ?ID?NO.9所示;
所述DNA2的單鏈核苷酸序列如SEQ?ID?NO.10所示。
8.一種鑒定權利要求2所述SH3TC2基因致病突變體的基因型的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:
以待測樣品DNA為模板,利用權利要求3所述引物組進行PCR擴增,得到擴增產物;
將擴增產物進行測序,確定SH3TC2基因致病突變體的基因型。
9.根據權利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR擴增的反應體系以20μL計,包括10×PCR緩沖液2μL、dNTPs0.4μL、SH3TC2-1F或SH3TC2-2F0.5μL、SH3TC2-1R或SH3TC2-2R0.5μL、模板1μL、Taq酶0.2μL和余量的ddH2O。
10.根據權利要求8所述的方法,其特征在于,所述PCR擴增的反應進程包括:95℃預變性5min;95℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸60s,30個循環;72℃反應7min。
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