[發明專利]一種同時檢測引起低色素性貧血STEAP3基因突變和eSNP的試劑盒

在審

• 申請號: 202210984149.2
• 申請日: 2022-08-17
• 公開（公告）號: CN116064766A
• 公開（公告）日: 2023-05-05
• 發明（設計）人: 劉頓;陳創奇;吳遠菲;易升;方萍;董云巧;張曦倩;劉風華
• 申請（專利權）人: 廣東省婦幼保健院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/686
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 姜磊

本發明屬于分子診斷領域，具體涉及一種同時檢測引起低色素性貧血STEAP3基因突變和eSNP的試劑盒。該試劑盒中包含由引物對1?7組成的引物組，所述引物對1?7的上下游引物核苷酸序列分別如SEQ?ID?NO:1?14所示。該試劑盒可針對STEAP3基因編碼區所有未知突變進行篩查，并同時可對STEAP3基因的eSNP進行分型，具有通量高、操作簡單、速度快、成本低、閉管操作、靈敏度高且特異性強的優勢。

技術領域

本發明屬于分子診斷領域，具體涉及一種同時檢測引起低色素性貧血STEAP3基因突變和eSNP的試劑盒。

背景技術

研究表明在中國南部地區，最為常見的導致先天性小細胞低色素貧血的遺傳學因素為地中海貧血，其主要病因為HBA基因和/或HBB基因突變。但在臨床診斷過程中，如果排除了地中海貧血基因突變，則還需要考慮其它基因變異所導致的低色素性貧血。

STEAP3基因是STEAP基因家族的成員之一，位于人類2號染色體上(2q14.2)，全長約42kb，在體內最常表達的轉錄本(NM_018234)所編碼的mRNA全長為3915bp，分為6個外顯子，前兩個外顯子和第三個外顯子的前8bp共同剪接成5'UTR區，編碼區由4個外顯子(外顯子3,4,5,6)組成，長1467bp，編碼的肽鏈含488個氨基酸。STEAP3是紅細胞內鐵和銅離子的主要還原酶，并參與細胞對二者的攝入，鐵離子攝入不足、代謝異常以及STEAP3基因功能性突變均可導致缺鐵性貧血(缺鐵性貧血屬于低色素性貧血的常見類型)。例如，2005年Ohgami等人(Nature?Genet.2005；37:1264-1269)通過Steap3基因敲出的小鼠證明Steap3基因的缺失可以導致小鼠低色素性貧血。2011年Grandchamp等人(Blood.2011；118:6660-6666)首次報道了一個巴基斯坦家系中的一個先天性低色素貧血患者，是由一個STEAP3無義突變(p.Cys100Ter)合并一個STEAP3低表達單倍體所導致，說明人類STEAP3基因的表達不足和突變可以導致鐵過載型的低色素性貧血(OMIM：615234)。

已有研究表明STEAP3基因上的一些無義突變和錯義突變可使STEAP3活性發生不同程度的下降，且STEAP3基因下游還存在一個單核苷酸多態性與STEAP3基因表達高低相關(eSNP：rs6721852)(Science.2015；348:648-660.http://www.gtexportal.org/home/gene/STEAP3)，rs6721852的TT/TC/CC三種基因型分別對應STEAP3基因表達的高/中/低。

由于目前仍缺乏有效的臨床檢測方法同時對STEAP3基因進行突變篩查和eSNP進行分型，難以對低色素性貧血的患病風險進行預測。因此，本發明希望提出一種能同時檢測STEAP3基因突變和eSNP的試劑盒，以滿足實際需求。

發明內容

本發明旨在至少解決上述現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明提出一種同時檢測引起低色素性貧血STEAP3基因突變和eSNP的試劑盒。該試劑盒可針對STEAP3基因編碼區所有未知突變進行篩查，并同時可對STEAP3基因的eSNP進行分型，具有通量高、操作簡單、速度快、成本低、閉管操作、靈敏度高且特異性強的優勢。

本發明提出一種同時檢測引起低色素性貧血STEAP3基因突變和eSNP的引物組，包括引物對1-7；

所述引物對1的上下游引物核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1-2所示；所述引物對2的上下游引物核苷酸序列如SEQ?ID?NO:3-4所示；所述引物對3的上下游引物核苷酸序列如SEQID?NO:5-6所示；所述引物對4的上下游引物核苷酸序列如SEQ?ID?NO:7-8所示；所述引物對5的上下游引物核苷酸序列如SEQ?ID?NO:9-10所示；所述引物對6的上下游引物核苷酸序列如SEQ?ID?NO:11-12所示；所述引物對7的上下游引物核苷酸序列如SEQ?ID?NO:13-14所示。