[發(fā)明專利]一種與甜瓜單果重性狀主效QTL-sfw2.2緊密連鎖的分子標(biāo)記及其應(yīng)用

在審

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• 申請日: 2022-07-29
• 公開（公告）號: CN115961068A
• 公開（公告）日: 2023-04-14
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 紀(jì)鵬;張帆;盛云燕;戴冬洋;薩日娜;王嶺
• 申請（專利權(quán)）人: 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 哈爾濱龍科專利代理有限公司 23206
• 代理人: 王新雨

一種與甜瓜單果重性狀主效QTL?sfw2.2緊密連鎖的分子標(biāo)記及其應(yīng)用，屬于植物分子遺傳育種研究領(lǐng)域。將該分子標(biāo)記在若干個甜瓜自然群體中進行單果重性狀檢測，用待選材料DNA為模板，分子標(biāo)記BCYIndel13的引物對其進行PCR擴增，將擴增產(chǎn)物進行聚丙烯酰胺凝膠電泳并結(jié)合田間性狀分析，分子標(biāo)記苗期鑒定準(zhǔn)確率為90.0％。本發(fā)明分子標(biāo)記在甜瓜生產(chǎn)實踐、育種中具有非常重要的價值。操作方法簡便，穩(wěn)定性高，快速且準(zhǔn)確，為甜瓜分子育種提供了輔助選擇的新方法。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于植物分子遺傳育種研究領(lǐng)域，具體涉及一種與甜瓜單果重性狀主效QTL-sfw2.2緊密連鎖的分子標(biāo)記及其應(yīng)用，可用于甜瓜單果重性狀苗期分子標(biāo)記輔助育種。

背景技術(shù)

甜瓜(Cucumis?melo?L.)是葫蘆科主要的經(jīng)濟植物，富含多種營養(yǎng)元素，在中國各地和世界溫帶至熱帶地區(qū)被廣泛栽培。農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上的甜瓜，其果實大小是連續(xù)變化的，它的生長發(fā)育程度易受到光照、土壤等生理環(huán)境的影響，并且后代會出現(xiàn)不同于親本大小的情況。果實過小會導(dǎo)致甜瓜產(chǎn)量減少，影響生產(chǎn)者的收益和消費者的消費體驗；果實過大會導(dǎo)致采收時投入的人力物力加大，銷售時運輸困難，人們購買后食用不完而造成浪費。通過對甜瓜單果重性狀的研究，不僅能培育出既保證生產(chǎn)者收益不被影響又能適合消費者需求的甜瓜新品種，還可以篩選出現(xiàn)有甜瓜果型過重或過輕的品種，達(dá)到種植單果重適中的甜瓜品種的目的，減少農(nóng)民的生產(chǎn)成本，提高產(chǎn)量和經(jīng)濟效益，因此通過構(gòu)建遺傳連鎖圖譜對甜瓜單果重性狀基因進行定位，獲得單果重相關(guān)性狀連鎖的分子標(biāo)記，為甜瓜苗期分子標(biāo)記輔助選擇育種提供理論依據(jù)，為與甜瓜單果重相關(guān)的基因挖掘和功能分析提供基礎(chǔ)。

國內(nèi)外研究學(xué)者圍繞作物單果重性狀的遺傳分析和QTL定位做了大量研究，傳統(tǒng)遺傳學(xué)研究結(jié)果表明，作物單果重性狀是由多基因遺傳控制的數(shù)量性狀，受環(huán)境因素的影響較大。早期由于技術(shù)的不完善，只對少數(shù)定位的單果重性狀QTL進行了解析，后來隨著分子標(biāo)記技術(shù)、QTL定位方法及相關(guān)物種基因組測序的發(fā)展，進一步加速了作物單果重性狀QTL的解析。Indel(Insertion-deletion)標(biāo)記是一種以PCR技術(shù)為手段擴增的分子標(biāo)記，它的本質(zhì)是一種長度多態(tài)標(biāo)記。在分布上，Indel標(biāo)記的分布強度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過SSR標(biāo)記，且具有穩(wěn)定性好、多態(tài)性高、分布廣泛、容易識別和分類等特點。目前，Indel分子標(biāo)記已被廣泛的應(yīng)用于作物遺傳特性分析和植物分子育種。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種高效鑒定甜瓜單果重性狀的分子標(biāo)記，所述分子標(biāo)記能夠用于甜瓜重果型或過輕品種的快速鑒定，分子標(biāo)記苗期鑒定準(zhǔn)確率為90.0％。

本發(fā)明的目的是通過以下技術(shù)方案實現(xiàn)的：

一種與甜瓜單果重性狀主效QTL-sfw2.2緊密連鎖的分子標(biāo)記，其引物序列為：

BCYIndel13F：TGCTTTTCTAAAGACCCTTAGTACA，

BCYIndel13R：ATCCCTATCCACCACTACATTTACT。

一種上述的分子標(biāo)記BCYIndel13的應(yīng)用，所述分子標(biāo)記BCYIndel13用于甜瓜苗期分子標(biāo)記輔助育種。

進一步地，所述應(yīng)用為：將該分子標(biāo)記在若干個甜瓜自然群體中進行單果重性狀檢測，用待選材料DNA為模板，分子標(biāo)記BCYIndel13的引物對其進行PCR擴增，將擴增產(chǎn)物進行聚丙烯酰胺凝膠電泳并結(jié)合田間性狀分析，分子標(biāo)記苗期鑒定準(zhǔn)確率為90.0％。

BCYIndel13的引物與DNA堿基結(jié)合，并且應(yīng)該在特定的位點結(jié)合，說明具有控制該性狀的潛在基因型；能夠結(jié)合，或者結(jié)合之后不在特定的位點，都沒有控制單果重(大或者小)的基因，(或者該基因不表達(dá))，均不具有這個性狀。

進一步地，所述分子標(biāo)記方法為：