[發(fā)明專利]基于m6

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210751818.1
• 申請日: 2022-06-28
• 公開（公告）號: CN115029442A9
• 公開（公告）日: 2023-08-01
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 郭剛強;葉樂樂;粘澤愷;薛向陽;馮詩雨;湯桑桑
• 申請（專利權(quán)）人: 溫州醫(yī)科大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G16H50/30;G16H50/50;G16H50/70;G16B50/00
• 代理公司: 北京祺和祺知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11501
• 代理人: 陳瑤瑤

本發(fā)明公開了一種基于msupgt;6/supgt;A相關(guān)lncRNA的漿液性卵巢癌預后模型的構(gòu)建及其臨床應(yīng)用。本發(fā)明基于TCGA數(shù)據(jù)庫SOC患者(n＝375)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及臨床信息，通過皮爾遜相關(guān)分析，單/多變量/lasso?cox回歸分析獲得6條與SOC患者預后顯著相關(guān)的msupgt;6/supgt;A修飾調(diào)節(jié)因子相關(guān)lncRNAs。通過人群的測試和驗證，并通過臨床特征分層分析、主成分分析及結(jié)合TP53突變信息評估了模型的分辨能力和預測能力。建立了nomogram并進一步評估了模型的預后價值。綜上所述，本發(fā)明建立了一個可靠的預測SOC患者預后的風險模型，基于所述標記物的漿液性卵巢癌預后評估模型的應(yīng)用如下：(1)作為評估患者預后危險度的分子標記物；(2)應(yīng)用于漿液性卵巢癌中以評估患者的預后危險度。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物醫(yī)學技術(shù)領(lǐng)域，更具體地說，它涉及一種基于m⁶A相關(guān)?lncRNA的漿液性卵巢癌預后模型的構(gòu)建及其臨床應(yīng)用。

背景技術(shù)

卵巢癌(Ovarian?carcinoma,OC)是全球女性癌癥中死亡率最高的腫瘤。?90％的OC是上皮性卵巢癌，而75％的上皮性卵巢癌是漿液性卵巢癌(Serous?ovarian?carcinoma,SOC)。由于卵巢解剖位置的隱蔽以及早期沒有明顯或特定的臨床癥狀，大部分患者確診時已是晚期。不僅如此，復發(fā)率高、耐藥等原因，使得SOC患者的預后差。隨著手術(shù)方式、化學療法和免疫療法的不斷發(fā)展和改進，SOC患者的總體生存率得到了提高，然而，SOC患者的預后仍不理想，迫切需要有效的生物標志物進行預后及治療反應(yīng)的預測和監(jiān)測。

長鏈非編碼RNA(Long?non-coding?RNAs,lncRNA)廣泛存在，是一類長度大于200個核苷酸，不具備或僅具備有限蛋白質(zhì)編碼能力的分子。lncRNA參與了多種生物學過程調(diào)控，包括腫瘤增殖、凋亡、轉(zhuǎn)移和耐藥等，其異常表達與包括SOC在內(nèi)的多種癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)；已經(jīng)有研究表明lncRNA?AB073614和HOTAIR可以作為OC患者潛在的診斷和預后生物標志物。

m⁶A修飾是真核生物RNA中最常見的化學修飾之一，這是一種動態(tài)且可逆的轉(zhuǎn)錄后修飾。其可作為臨床上有效的生物標志物和潛在的治療靶點。此外，m⁶A?修飾受調(diào)節(jié)因子調(diào)控，主要由甲基化酶(METTL3/14,WTAP,RBM15/15B?and?KIAA1429等,又稱為writers)、去甲基化酶(FTO?and?ALKBH5等,稱為erasers)和m⁶A結(jié)合蛋白(YTHDF1/2/3,IGF2BP1?and?HNRNPA2B1等,稱為?readers)組成。多項研究表明，m⁶A修飾及其調(diào)節(jié)因子是推動包括SOC在內(nèi)的多種癌癥發(fā)生發(fā)展的主要因素之一，它們在細胞死亡和增殖失調(diào)、免疫調(diào)節(jié)異常和腫瘤惡性進展等生物學過程中發(fā)揮重要作用。

越來越多的研究發(fā)現(xiàn)，m⁶A修飾與lncRNA之間存在明顯的相互作用。一方面，m⁶A修飾及其調(diào)節(jié)因子參與了lncRNA的富集和調(diào)控，從而在lncRNA的生物學過程中發(fā)揮重要作用，繼而介導多種癌癥的發(fā)生發(fā)展。例如，m⁶A修飾可以通過reader的結(jié)合位點調(diào)節(jié)lncRNA的結(jié)構(gòu)進而影響了lncRNA的生理功能。另一方面，在癌癥中，m⁶A修飾調(diào)節(jié)因子的功能也受到lncRNA的調(diào)控。例如有研究發(fā)現(xiàn)，lncRNA?LINC00470與PTEN?mRNA結(jié)合，通過與METTL3的相互作用抑制?PTEN?mRNA的穩(wěn)定性，從而發(fā)揮促進胃癌進展的作用。因此，對m⁶A修飾與lncRNA?相互作用的進一步研究，將有助于我們更好地理解它們在SOC中的生物學作用。