[發明專利]基于m6 在審
| 申請號: | 202210751818.1 | 申請日: | 2022-06-28 |
| 公開(公告)號: | CN115029442A9 | 公開(公告)日: | 2023-08-01 |
| 發明(設計)人: | 郭剛強;葉樂樂;粘澤愷;薛向陽;馮詩雨;湯桑桑 | 申請(專利權)人: | 溫州醫科大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;G16H50/30;G16H50/50;G16H50/70;G16B50/00 |
| 代理公司: | 北京祺和祺知識產權代理有限公司 11501 | 代理人: | 陳瑤瑤 |
| 地址: | 325035 浙江省溫*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 base sup | ||
1.一種預測SOC預后的標記物,其特征在于,所述預后標記物為AL513211.1,LINC02384,RP11-508M8.1,AC138761.4,MYCNOS和AC07206.3六條lncRNA的組合。
2.基于權利要求1所述標記物的風險模型,其特征在于,風險評分=系數(lncRNA1)×表達水平(lncRNA1)+系數(lncRNA2)×表達水平(lncRNA2)+…+系數(lncRNAn)×表達水平(lncRNAn);其中n表示第n個非零系數的lncRNA。
3.如權利要求2所述的預測SOC預后的預測模型,其特征在于,具體模型構建方法包括以下步驟:
(1)從癌癥基因組圖譜TCGA數據庫下載漿液性卵巢癌全轉錄組數據以及相應患者的臨床信息;
(2)從相關報道中篩選m6A修飾調節因子,獲得相關的m6A基因集;
(3)根據皮爾遜相關分析篩選出與m6A修飾調節因子相關的lncRNA(m6A-lncRNAs);
(4)結合乘積極限法(Kaplan-Meier,KM),也叫KM生存分析以及單變量Cox回歸分析,計算每個m6A-lncRNAs與患者生存是否存在關系,篩選出與SOC預后相關lncRNA;
(5)利用Lasso?Cox回歸進一步篩選lncRNA,篩選出其中13個lncRNAs,并使用受試者工作特征曲線分析評估進行模型自評;
(6)最后通過多變量Cox回歸分析,剔除混雜因素,獲得6個風險因素相關lncRNA的風險權重系數,并構建風險公式。
4.根據權利要求3所述的SOC預后的預測模型,其特征在于,該方法具體包括RNA的獲取,lncRNA篩選,模型的構建和風險評分的計算,根據計算的風險評分將患者劃分為高危和低危兩組,判斷患者預后。
5.一種基于漿液性卵巢癌預后模型的應用,其特征是:(1)作為評估患者預后危險度和療效的分子標記物;(2)應用于漿液性卵巢癌中以評估患者的預后危險度和療效。
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