[發明專利]一種基于CcmK2纖維狀蛋白的亞精胺合成多酶復合體的構建方法及其應用有效
| 申請號: | 202210672219.0 | 申請日: | 2022-06-14 |
| 公開(公告)號: | CN114958894B | 公開(公告)日: | 2023-05-30 |
| 發明(設計)人: | 王昕;胡鑫峰;陳可泉;劉逸;王靖;周彩蓮 | 申請(專利權)人: | 南京工業大學 |
| 主分類號: | C12N15/70 | 分類號: | C12N15/70;C12N15/31;C12N15/54;C12N15/60;C12P13/00 |
| 代理公司: | 南京擎天知識產權代理事務所(普通合伙) 32465 | 代理人: | 藍霞 |
| 地址: | 210000 江蘇省南京市*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 ccmk2 纖維狀 蛋白 精胺 合成 復合體 構建 方法 及其 應用 | ||
1.一種基于CcmK2纖維狀蛋白的亞精胺合成多酶復合體的構建方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟1、蛋白支架CcmK2-linker-SpyCatcher的構建
將纖維狀蛋白CcmK2的C端和結合蛋白SpyCatcher融合表達,構建蛋白支架CcmK2-linker-SpyCatcher,其中,編碼纖維狀蛋白CcmK2的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示,編碼結合蛋白SpyCatcher的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.2所示,在CcmK2的C端融合結合蛋白SpyCatcher,連接兩種蛋白的linker氨基酸序列為:GSGSGSGSGSGS;
步驟2、SpeE-linkerⅠ-CohⅡ-linkerⅡ-SpyTag的構建
將亞精胺合酶SpeE的C端融合粘連蛋白CohesinⅡ形成SpeE-linkerⅠ-CohⅡ,再將SpeE-linkerⅠ-CohⅡ的C端融合結合分子肽SpyTag形成SpeE-linkerⅠ-CohⅡ-linkerⅡ-SpyTag,其中,編碼亞精胺合酶SpeE的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.3所示,編碼粘連蛋白CohesinⅡ的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.4所示,編碼結合分子肽SpyTag的核苷酸序列如SEQID?NO.5所示,連接SpeE和CohesinⅡ兩種蛋白的linkerⅠ氨基酸序列為:GGGGSGGGGS,連接SpeE-linkerⅠ-CohⅡ和SpyTag兩種蛋白的linkerⅡ氨基酸序列為:GSGGSGVD;
步驟3、SpeD-linker-DocⅡ的構建
將S-腺苷蛋氨酸脫羧酶SpeD的C端融合錨定蛋白DockerinⅡ形成SpeD-linker-DocⅡ,其中,編碼S-腺苷蛋氨酸脫羧酶SpeD的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.6所示,編碼錨定蛋白DockerinⅡ的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.7所示,融合SpeD和DockerinⅡ所用的linker氨基酸序列為:GGGGSGGGGS;
步驟4、亞精胺合成多酶復合體的胞外自組裝
首先將純化得到的SpeE-linkerⅠ-CohⅡ-linkerⅡ-SpyTag和SpeD-linker-DocⅡ體外自組裝形成SpeE-SpeD雙酶結合體,再將SpeE-SpeD雙酶結合體和蛋白支架CcmK2-linker-SpyCatcher結合形成亞精胺合成多酶復合體。
2.根據權利要求1所述的一種基于CcmK2纖維狀蛋白的亞精胺合成多酶復合體的構建方法,其特征在于,步驟1中纖維狀蛋白CcmK2的基因片段用PCR擴增引物的核苷酸序列為EcoRⅠ-CcmK2-F和CcmK2-linker-R,分別如SEQ?ID?NO.8和SEQ?ID?NO.9所示;結合蛋白SpyCatcher的基因片段用PCR擴增引物的核苷酸序列為linker-SpyCatcher-F和SpyCatcher-HindⅢ-R,分別如SEQ?ID?NO.10和SEQ?ID?NO.11所示;纖維狀蛋白CcmK2的基因片段和結合蛋白SpyCatcher的基因片段用Overlap-PCR技術融合擴增,融合擴增引物的核苷酸序列為EcoRⅠ-CcmK2-F和SpyCatcher-HindⅢ-R,分別如SEQ?ID?NO.8和SEQ?IDNO.11所示。
3.根據權利要求1所述的一種基于CcmK2纖維狀蛋白的亞精胺合成多酶復合體的構建方法,其特征在于,步驟2中亞精胺合酶SpeE的基因片段用PCR擴增引物的核苷酸序列為EcoRⅠ-SpeE-F和SpeE-linkerⅠ-R,分別如SEQ?ID?NO.12和SEQ?ID?NO.13所示;粘連蛋白CohesinⅡ的基因片段用PCR擴增引物的核苷酸序列為linkerⅠ-CohⅡ-F和CohⅡ-linkerⅡ-R,分別如SEQ?ID?NO.14和SEQ?ID?NO.15所示;結合分子肽SpyTag的基因片段用PCR擴增引物的核苷酸序列為linkerⅡ-SpyTag-F和SpyTag-HindⅢ-R,分別如SEQ?ID?NO.16和SEQID?NO.17所示;亞精胺合酶SpeE的基因片段、粘連蛋白CohesinⅡ的基因片段和結合分子肽SpyTag的基因片段用Overlap-PCR技術融合擴增,融合擴增引物的核苷酸序列為EcoRⅠ-SpeE-F和SpyTag-HindⅢ-R,分別如SEQ?ID?NO.12和SEQ?ID?NO.17所示。
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