[發明專利]小麥最大根長QTL QMrl.sau-3D連鎖的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202210657907.X
• 申請日: 2022-06-10
• 公開（公告）號: CN114807429B
• 公開（公告）日: 2023-02-14
• 發明（設計）人: 馬建;陳黃鑫;周界光;玄其京;曾照勇;唐華蘋;江千濤;蔣云峰;魏育明;鄭有良;蘭秀錦
• 申請（專利權）人: 四川農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方盛凡知識產權代理有限公司 11562
• 代理人: 菅士騰

1.一種與小麥最大根長QTL QMrl.sau-3D連鎖的SNP分子標記在調控小麥最大根長性狀中的應用，其特征在于，所述SNP分子標記與QMrl.sau-3D共定位于小麥基因組的3D染色體長臂上，所述SNP分子標記的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示，所述SNP分子標記的36bp處存在C/T突變。

2.一種擴增與小麥最大根長QTL QMrl.sau-3D連鎖的SNP分子標記的引物組合，其特征在于，所述引物組合包括如SEQ ID NO.1-2所示的兩條特異性上游引物和如SEQ ID NO.3所示的一條通用下游引物；

所述SNP分子標記與QMrl.sau-3D共定位于小麥基因組的3D染色體長臂上，所述SNP分子標記的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示，所述SNP分子標記的36bp處存在C/T突變。

3.一種如權利要求2所述的引物組合在制備鑒定小麥基因或其基因片段的芯片中的應用。

4.一種如權利要求2所述的引物組合在制備鑒定小麥基因或其基因片段的試劑盒中的應用。

5.一種鑒定小麥基因或其基因片段的芯片，其特征在于，包含權利要求2所述的引物組合。

6.一種鑒定小麥基因或其基因片段的試劑盒，其特征在于，包含權利要求2所述的引物組合。

7.一種如權利要求2所述的引物組合、權利要求5所述的芯片或權利要求6所述的試劑盒在調控小麥最大根長性狀中的應用。

8.一種篩選含有最大根長QTL QMrl.sau-3D的小麥株系的方法，其特征在于，以待測植株樣品的基因組DNA作為模板，利用權利要求2所述的引物組合進行熒光定量PCR擴增，利用擴增結果進行基因型分型；將能夠讀取到SEQ ID NO.2所標記的熒光基團的植株鑒定為含有小麥最大根長QTL QMrl.sau-3D的植株。

9.根據權利要求8所述的方法，其特征在于，所述熒光定量PCR擴增的反應體系為：5μLMaster Mix，5ng模板DNA，1.4μL混合引物，ddH₂O加至總量為10μL，所述混合引物由120μL10ng/μL的SEQ ID NO.1所示的特異性上游引物、120μL 10ng/μL的SEQ ID NO.2所示的特異性上游引物和300μL 10ng/μL的SEQ ID NO.3所示的通用下游引物，添加460μLddH₂O進行混合得到。

10.根據權利要求8所述的方法，其特征在于，所述熒光定量PCR擴增的反應程序為：94℃預變性15min；94℃變性20s，61℃復性/延伸60s，共10個循環；94℃變性20s，55℃復性/延伸60s，共26個循環。