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[發明專利]基于FRET的DNA損傷檢測方法及功能蛋白在審

專利信息
申請號: 202210657900.8 申請日: 2022-06-12
公開(公告)號: CN115046973A 公開(公告)日: 2022-09-13
發明(設計)人: 華躍進;鐘世通;陸慧智;宋爽;王梁燕 申請(專利權)人: 浙江大學
主分類號: G01N21/64 分類號: G01N21/64;C07K19/00;C12N9/50
代理公司: 杭州求是專利事務所有限公司 33200 代理人: 林松海
地址: 310058 浙江*** 國省代碼: 浙江;33
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 基于 fret dna 損傷 檢測 方法 功能 蛋白
【權利要求書】:

1.一種基于FRET的DNA損傷檢測方法,其特征在于,步驟如下:

1)配制反應溶液,包括:PprI-D91A、YDC、待測樣品、Buffer;37℃反應30 min;

2)反應完成后吸取反應溶液加入到黑色386孔板中,利用多功能酶標儀,以440 nm波長的光為激發光,掃描460 nm ~ 600 nm波長的發射光,求得530 nm與480 nm發射光的比值R530/480

3)將樣品的R530/480與空白對照的R530/480作比得到rR530/480,根據標準曲線方程,得到待測樣品中所含的ssDNA量,據此來評估待測樣品中DNA的損傷程度;

所述的YDC含有eYFP、DdrO和eCFP三個結構區域;氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示;

所述的PprI-D91A,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。

2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟如下:

1)配制反應溶液:PprI-D91A,終濃度0.10 μM;YDC,終濃度3.0 μM;待測樣品10 μL;2mM MnCl2 10 μL;65.7 μL Buffer;ddH2O補齊反應溶液到100 μL,37℃反應30 min;

所述的Buffer:250 mM NaCl、5%甘油、20 mM Tris-HCl pH 7.5;

2)反應完成后吸取70 μL反應溶液加入到黑色386孔板中,利用多功能酶標儀,以440nm波長的光為激發光,掃描460 nm ~ 600 nm波長的發射光,求得530 nm與480 nm發射光的比值R530/480

3)將樣品的R530/480與空白對照的R530/480作比得到rR530/480,根據標準曲線方程,得到待測樣品中所含的ssDNA量,據此來評估待測樣品中DNA的損傷程度。

3.一種具有熒光能量轉移特性的功能蛋白YDC,其特征在于,所述功能蛋白YDC含有eYFP、DdrO和eCFP三個結構區域;氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。

4.一種蛋白酶PprI-D91A,其特征在于,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。

5. 一種基于FRET的功能蛋白組合,其特征在于,包括PprI-D91A和YDC;所述的PprI-D91A,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示;

所述的YDC含有eYFP、DdrO和eCFP三個結構區域;氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示;

PprI-D91A能夠準確識別功能蛋白YDC的特定序列并對其進行酶切,酶切反應后YDC的熒光能量轉移效率降低,ssDNA的加入促進酶切過程的進行。

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