[發明專利]一種基于DNAzyme變構調節的DNA四面體樣納米機器、miRNA檢測方法及應用在審
| 申請號: | 202210636366.2 | 申請日: | 2022-06-07 |
| 公開(公告)號: | CN114934099A | 公開(公告)日: | 2022-08-23 |
| 發明(設計)人: | 陽莎;余戀雨;陳鳴;唱凱;詹新宇;羅潔;陳志國;王彬潘;趙爽;湯曉琦 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍陸軍軍醫大學第一附屬醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/6825 | 分類號: | C12Q1/6825;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京高沃律師事務所 11569 | 代理人: | 黃明光 |
| 地址: | 400038 重*** | 國省代碼: | 重慶;50 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 dnazyme 調節 dna 四面體 納米 機器 mirna 檢測 方法 應用 | ||
1.一種基于DNAzyme變構調節的DNA四面體樣納米機器,其特征在于,所述納米機器由寡核苷酸鏈P1-P5和一條抑制劑鏈組成,所述寡核苷酸鏈P5與抑制劑鏈互補,所述抑制劑鏈含有DNA識別序列,所述DNA識別序列能夠與待測miRNA結合。
2.根據權利要求1所述的DNA四面體樣納米機器,其特征在于,所述寡核苷酸鏈P1、P2、P4、P3部分序列、P5部分序列構成所述DNA四面體的主框架;所述P5鏈的中間部分為E6型DNAzyme。
3.根據權利要求1所述的DNA四面體樣納米機器,其特征在于,所述寡核苷酸鏈P1、P2、P4構成所述DNA四面體的框架P124,所述寡核苷酸鏈P5和抑制劑鏈構成鎖定的變構DNAzymeP5I;所述抑制劑鏈的5'和3'末端分別設計兩個腳趾區域。
4.根據權利要求1或2所述的DNA四面體樣納米機器,其特征在于,所述P3鏈的5'端第10位堿基為RNA修飾的底物,所述第10位堿基為核糖核苷酸;所述P3鏈中的第24位堿基可以替換為淬滅基團。
5.根據權利要求1所述的DNA四面體樣納米機器,其特征在于,所述寡核苷酸鏈P1-P5的序列如SEQ ID NO.1-5所示,所述抑制劑鏈的序列選自SEQ ID NO.6-9所示序列中的一種。
6.權利要求1-5任意一項所述DNA四面體樣納米機器的制備方法,其特征在于,所述方法包括如下步驟:
將寡核苷酸鏈P1、P2、P4與緩沖液混合,經第一反應得到DNA四面體的框架P124;寡核苷酸鏈P5、抑制劑鏈與緩沖液混合,經第二反應得到鎖定的變構DNAzyme P5I;
將P124、P5I、P3與緩沖液混合,經第三反應即得所述的DNA四面體樣納米機器。
7.根據權利要求6所述的制備方法,其特征在于,所述緩沖液的組成為:10mM HEPES、100mM NaCl和50mM MgCl2,pH 6.0。
8.一種miRNA的檢測方法,其特征在于,所述方法包括如下步驟:
將權利要求1或5任意一項所述的DNA四面體樣納米機器與靶miRNA混合孵育,所得產物經凝膠電泳以及熒光檢測即可檢測靶miRNA。
9.根據權利要求8所述的檢測方法,其特征在于,所述孵育的溫度為20-40℃,所述孵育的時間為0.5-10h。
10.權利要求1-5任意一項所述的DNA四面體樣納米機器或權利要求8-9任意一項所述的檢測方法在miRNA檢測或調節中的應用。
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