[發明專利]一種用于富集mRNA的磁珠復合物及其應用在審
| 申請號: | 202210550512.X | 申請日: | 2022-05-18 |
| 公開(公告)號: | CN114854827A | 公開(公告)日: | 2022-08-05 |
| 發明(設計)人: | 雍軍;范靜彥;包仁艷 | 申請(專利權)人: | 蘇州極客基因科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6806 | 分類號: | C12Q1/6806;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 北京三聚陽光知識產權代理有限公司 11250 | 代理人: | 周淑歌 |
| 地址: | 215163 江蘇省蘇州*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 富集 mrna 復合物 及其 應用 | ||
1.一種用于富集mRNA的磁珠復合物,其特征在于,所述用于富集mRNA的磁珠復合物包括磁珠、間臂、引物以及oligodT;所述引物通過間臂偶聯在磁珠上;所述oligodT通過引物與間臂相連;所述間臂為C鏈和/或堿基T;所述引物用于擴增目標mRNA經過反轉錄后結合在磁珠上的cDNA;所述oligodT能夠與目標mRNA特異性結合。
2.如權利要求1所述的用于富集mRNA的磁珠復合物,其特征在于,所述間臂為長度2~30的碳鏈C和/或長度2~30的堿基T。
3.如權利要求1或2所述的用于富集mRNA的磁珠復合物,其特征在于,所述引物的長度為12~70個堿基。
4.如權利要求1~3任一項所述的用于富集mRNA的磁珠復合物,其特征在于,所述oligodT的長度為12~70個堿基T。
5.一種制備權利要求1~4任一項所述的用于富集mRNA的磁珠復合物的方法,其特征在于,所述方法為:合成間臂、引物和oligodT,并將間臂、引物和oligodT依次相連,得到磁珠連接序列;將磁珠和磁珠連接序列混合后進行偶聯反應,得到權利要求1~4任一項所述的用于富集mRNA的磁珠復合物。
6.一種用于富集mRNA的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包含權利要求1~4任一項所述的用于富集mRNA的磁珠復合物。
7.如權利要求6所述的用于富集mRNA的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包含裂解緩沖液;所述裂解緩沖液的成分包含1%Triton X-100 2μL和4M鹽酸胍/異硫氰酸胍2μL;或者,所述裂解緩沖液的成分包含1%Triton X-1002μL、40U/μL RNase inhibitor 0.1μL、2MLiCl 1μL和DEPC H2O 1μL;或者,所述裂解緩沖液的成分包含1%Triton X-100 2μL、40U/μL RNase inhibitor 0.1μL、2M LiCl 0.5μL和DEPC H2O 1μL;或者,所述裂解緩沖液的成分包含1%Triton X-100 2μL、40U/μL RNase inhibitor 0.1μL、2M LiCl 0.5μL、DEPC H2O 1μL和1%β巰基乙醇0.04μL;或者,所述裂解緩沖液的成分包含1%Triton X-100 2μL、40U/μL RNase inhibitor 0.1μL、2M LiCl 0.5μL、DEPC H2O 1μL和1%二硫蘇糖醇0.04μL。
8.如權利要求6或7所述的用于富集mRNA的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包含雜交緩沖液;所述雜交緩沖液為添加有1.0M LiCl、2mM EDTA、5mM DTT以及10%甲酰胺的20mM、pH 7.5的Tris-HCl緩沖液。
9.一種單細胞/少量細胞轉錄組擴增及測序方法,其特征在于,所述方法為:使用權利要求1~4任一項所述的用于富集mRNA的磁珠復合物或權利要求6~8任一項所述的用于富集mRNA的試劑盒對單細胞/少量細胞中的目標mRNA進行捕獲和擴增。
10.權利要求1~4任一項所述的用于富集mRNA的磁珠復合物或權利要求6~8任一項所述的用于富集mRNA的試劑盒或權利要求9所述的單細胞/少量細胞轉錄組擴增及測序方法在單細胞/少量細胞轉錄組擴增及測序中的應用。
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