[發明專利]同步檢測5種柑橘病毒的DPO RT-PCR引物組、檢測方法、試劑盒及其應用在審
| 申請號: | 202210476485.6 | 申請日: | 2022-04-29 |
| 公開(公告)號: | CN114790496A | 公開(公告)日: | 2022-07-26 |
| 發明(設計)人: | 李戰彪;莫翠萍;謝慧婷;崔麗賢;陳錦清;林林;羅婉笛;李金哲;蔡健和;秦碧霞 | 申請(專利權)人: | 廣西壯族自治區農業科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/94 |
| 代理公司: | 南寧頌博遠信知識產權代理事務所(普通合伙) 45141 | 代理人: | 蘭亞君 |
| 地址: | 530007 廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 同步 檢測 柑橘 病毒 dpo rt pcr 引物 方法 試劑盒 及其 應用 | ||
1.一種同步檢測5種柑橘病毒的OPO RT-PCR引物組,其特征在于,包括以下引物:
2條柑橘衰退病毒特異性引物:
DPO-CTV-F:5’-TGGCTCGTAGACACCIIIIICGTTCTCCGG-3’,如SEQ ID NO.1所示;
DPO-CTV-R:5’-CTAAGGAGAACTTCTTIIIIICACGCATACG-3’,如SEQ ID NO.2所示;
2條柑橘碎葉病毒特異性引物:
DPO-CTLV-F:5’-TGCTTCAACAAGCGAGGCIIIIICGGGTAGGAG-3’,如SEQ ID NO.3所示;
DPO-CTLV-R:5’-GTATAAAGGCAGGCATGTCAIIIIICAAGACCGCG-3’,如SEQ ID NO.4所示;
2條柑橘裂皮病毒的特異性引物:
DPO-CEV-F:5’-CGGGATCTTTCTTGAGIIIIIIGTGGTGCT-3’,如SEQ ID NO.5所示;
DPO-CEV-R:5’-GCTCCTGTTTCTCCGCTGGIIIIIAGTGATCC-3’,如SEQ ID NO.6所示;
2條柑橘黃化脈明病毒特異性引物:
DPO-CYVCV-F:5’-TCCATTGTCGACGAGTIIIIICTAAGCCAG-3’,如SEQ ID NO.7所示;
DPO-CYVCV-R:5’-GGATAGCTGCGGTAGAGAGGGTIIIIGTAGTCGAAG-3’,如SEQ ID NO.8所示;
2條柑橘葉斑駁病毒的特異性引物,具體如下:
DPO-CLBV-F:5’-GGATTATGTGTCTCATGTIIIIIIAGAGACGG-3’,如SEQ ID NO.9所示;
DPO-CLBV-R:5’-TGCAGCTTTGAGTGACIIIIICAATTCTTC-3’,如SEQ ID NO.10所示;
其中,I為次黃嘌呤。
2.一種檢測試劑或試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑或試劑盒包含權利要求1所述的OPO RT-PCR引物組。
3.一種同步檢測柑橘衰退病毒、柑橘碎葉病毒、柑橘裂皮病毒、柑橘黃化脈明病毒、柑橘葉斑駁病毒的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)取待測樣品,提取其總RNA,反轉錄為cDNA;
(2)采用權利要求1所述的OPO RT-PCR引物組,以待測樣品的cDNA為模板進行PCR反應,獲得擴增產物;
(3)使用瓊脂糖電泳檢測PCR擴增產物:如擴增到416bp大小的條帶,表明樣品中含有柑橘衰退病毒;如擴增到716bp大小的條帶,表明樣品中含有柑橘碎葉病毒;如擴增到187bp大小的條帶,表明樣品中含有柑橘裂皮病毒;如擴增到938bp大小的條帶,表明樣品中含有柑橘黃化脈明病毒;如擴增到576bp大小的條帶,表明樣品中含有柑橘葉斑駁病毒。
4.按照權利要求3所述的方法,其特征在于,所述PCR反應的反應體系為20μL,各引物的濃度為:引物DPO-CTV-F和引物DPO-CTV-R的濃度均為0.2μM,引物DPO-CTLV-F和引物DPO-CTLV-R的濃度均為0.1μM,引物DPO-CEV-F和引物DPO-CEV-R的濃度均為0.5μM,引物DPO-CYVCV-F和引物DPO-CYVCV-R的濃度均為0.3μM,引物DPO-CLBV-F和引物DPO-CLBV-R的濃度均為0.3μM。
5.按照權利要求4所述的方法,其特征在于,所述PCR反應的反應程序為:50℃30min,94℃5min;30個循環參數為:94℃變性30s,56℃退火30s,72℃延伸2min;最后72℃延伸10min。
6.權利要求1所述的OPO RT-PCR引物組在同步檢測柑橘衰退病毒、柑橘碎葉病毒、柑橘裂皮病毒、柑橘黃化脈明病毒、柑橘葉斑駁病毒中的應用。
7.權利要求2所述的檢測試劑或試劑盒在同步檢測柑橘衰退病毒、柑橘碎葉病毒、柑橘裂皮病毒、柑橘黃化脈明病毒、柑橘葉斑駁病毒中的應用。
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