[發(fā)明專利]一種基于核心區(qū)二級結(jié)構(gòu)改造提高啟動(dòng)子活性的方法和應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210473176.3
• 申請日: 2022-04-29
• 公開（公告）號: CN114645049A
• 公開（公告）日: 2022-06-21
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 陳守文;饒憶;蔡冬波;王佳琪;楊新愿
• 申請（專利權(quán)）人: 湖北大學(xué)
• 主分類號: C12N15/113
• 分類號: C12N15/113
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務(wù)所(普通合伙) 42001
• 代理人: 龔瑩瑩

1.一種基于核心區(qū)二級結(jié)構(gòu)改造提高啟動(dòng)子活性的方法，包括下述步驟：

1）對待改造的啟動(dòng)子區(qū)域序列的二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測；

2）基于步驟1）中所得的二級結(jié)構(gòu)，分別替換和/或增添堿基以改變啟動(dòng)子核心區(qū)的-35區(qū)和-10區(qū)的位置，使啟動(dòng)子核心區(qū)的-35區(qū)和-10區(qū)在莖環(huán)結(jié)構(gòu)的環(huán)上或是遠(yuǎn)離莖環(huán)結(jié)構(gòu)的核酸鏈上以利于和RNA聚合酶結(jié)合，既得新的核心區(qū)序列。

2.權(quán)利要求1所述的方法在提高地衣芽胞桿菌啟動(dòng)子活性中的應(yīng)用。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，所述的地衣芽胞桿菌為地衣芽孢桿菌DW2。

4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，應(yīng)用過程中，提高活性后的啟動(dòng)子，是將P43啟動(dòng)子中的核心區(qū)序列：gtgaaaaaaagcgcgcgattatgtaaaat替換為P43^D核心區(qū)序列：ttgacaaaaagcgcgcgattatgtaaaat；

或?qū)5啟動(dòng)子中的核心區(qū)序列：ttctcaccttgacaaagcgcgctaaaatttataatgtaaaaagccattgacattctcatattatatatttataattaaaat替換為R5^D核心區(qū)序列：ttctcaccttgacaaagcgcgctaaaatttataatccccccccccgtaaaaagccattgacattctcatattatatatttataattaaaat；

或?qū)bacA啟動(dòng)子中的核心區(qū)序列：gtaaaagagcaactacagaccaatattat替換為PbacA^D核心區(qū)序列：gtaaaagagcaactgcagaccaatattat。