[發明專利]克羅恩病進展風險相關評估基因集、試劑盒、應用和系統

在審

• 申請號: 202210426312.3
• 申請日: 2022-04-22
• 公開（公告）號: CN114645088A
• 公開（公告）日: 2022-06-21
• 發明（設計）人: 陳浩;沙衛紅;吳慧歡;曾瑞杰;卓澤偉;郭科航
• 申請（專利權）人: 廣東省人民醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;G16H50/30;G16B35/00;G16B20/20;G06K9/62;G06N20/00
• 代理公司: 珠海市君佳知識產權代理事務所(普通合伙) 44644
• 代理人: 朱本利;劉戰勝

本發明提供了一種克羅恩病進展風險相關評估基因集、試劑盒、應用和系統。其中克羅恩病中NLRP3炎癥小體相關基因的評估基因集，用于評估克羅恩病進展的高風險表型或低風險表型，評估基因集包括14個基因，14個基因為CARD8、CASP1、GBP5、HSP90AB1、MEFV、NFKB1、NFKB2、NLRC3、DHX33、PANX1、PSTPIP1、RELA、TXN和TLR6。本發明能更可靠地應用到臨床實踐中，相較于現有技術，可以更準確地評估克羅恩病進展的高風險表型或低風險表型，同時能夠為醫療決策提供科學依據。

技術領域

本發明涉及一種克羅恩病中NLRP3炎癥小體相關基因的評估基因集、 用于評估克羅恩病進展的高風險表型或低風險表型的試劑盒、應用以及用 于評估個體是否處于克羅恩病進展的高風險或低風險的系統。

背景技術

克羅恩病是炎癥性腸病(IBD)的兩種主要形式之一，可導致復發和緩解 消化道炎癥。據估計，在歐洲和北美分別有超過200萬和150萬人患有IBD； 雖然在西方國家，IBD的發病率相對穩定，但在西方化社會較多的新工業 化國家，克羅恩病的發病率仍在上升。盡管治療取得了進展，但克羅恩病 的發病率很高，醫療費用也很高。

在過去的20年里，在克羅恩病的治療領域取得了重大進展。對克羅恩 病發病機制中所必需的炎癥級聯反應、細胞因子和粘附分子的深入了解在 很大程度上促進了藥理設備的發展，例如，抗腫瘤壞死因子(TNF)藥物英夫 利昔單抗對治療克羅恩病有效，具有良好的安全性(帕帕米克爾等，2019 年)。然而，相當比例的患者證明生物制劑沒有臨床益處，反應可能隨著時 間的推移而消失(Danese等人，2019年；帕帕邁克爾等人，2019年)。確定 新的靶點和開發新的治療方法對幫助治療克羅恩病至關重要。

克羅恩病的病因仍然很大程度上是未知的，因此，明確其發病機制是 重要的。眾所周知，炎癥小體參與了各種系統中的炎癥性疾病(Huangetal.， 2021)，nod樣受體家族，含pyrin結構域3(NLRP3)炎癥小體，作為檢測廣泛 信號的細胞內傳感器，在所有類型的炎癥小體中研究最為廣泛(Swansonetal.， 2019)。據報道NLRP3炎癥小體參與了克羅恩病的發病機制、進展和治療反 應(Shaoetal.，2019)，但是克羅恩病中NLRP3炎癥小體及其相關分子的相關 性仍為清晰，需要進一步研究。

發明內容

本發明的目的在于提供克羅恩病中NLRP3炎癥小體相關基因的評估基 因集、試劑盒、應用和系統，以用于評估克羅恩病進展的高風險表型或低 風險表型。

本發明的第一目的是提供一種克羅恩病中NLRP3炎癥小體相關基因的 評估基因集，其用于評估克羅恩病進展的高風險表型或低風險表型，評估 基因集包括14個基因，14個基因為CARD8、CASP1、GBP5、HSP90AB1、 MEFV、NFKB1、NFKB2、NLRC3、DHX33、PANX1、PSTPIP1、RELA、 TXN和TLR6。

其中評估基因集中的14個基因選自25個NLRP3炎癥小體相關基因， 25個NLRP3炎癥小體相關基因分別為GBP5、CASP1、CARD8、TLR4、TLR4、 PANX1、NLRP1、NLRP3、TLR6、PSTPIP1、NFKB1、NFKB2、HSP90AB1、 NLRB3、RELA、MEFV、DHX33、TXN、APP、SIRT2、SUGT1、P2RX7、 EIF2AK2、CD36、TXNIP、GSDMD和PYCARD。

本發明的第二目的是提供一種用于評估克羅恩病進展的高風險表型或 低風險表型的試劑盒，其包括檢測前述評估基因集中14個基因表達水平的 試劑，具體的，14個基因為CARD8、CASP1、GBP5、HSP90AB1、MEFV、 NFKB1、NFKB2、NLRC3、DHX33、PANX1、PSTPIP1、RELA、TXN和 TLR6。