[發明專利]一種檢測BRAF基因突變的引物探針組合物、試劑盒及其使用方法和應用在審
| 申請號: | 202210426209.9 | 申請日: | 2022-04-21 |
| 公開(公告)號: | CN114634987A | 公開(公告)日: | 2022-06-17 |
| 發明(設計)人: | 鄧微;蘭玲;茍默;周美岑;魏星 | 申請(專利權)人: | 北京積水潭醫院;北京華諾奧美基因生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 成都頂峰專利事務所(普通合伙) 51224 | 代理人: | 錢學宇 |
| 地址: | 100000 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 braf 基因突變 引物 探針 組合 試劑盒 及其 使用方法 應用 | ||
1.一種檢測BRAF基因突變的引物探針組合物,其特征在于,所述引物探針組合物包括檢測BRAF基因突變位點c.1919A>C的實時熒光PCR引物和檢測探針;
所述實時熒光PCR引物包括SEQ ID No.1~2所示的氨基酸序列;
所述檢測探針包括SEQ ID No.3所示的氨基酸序列。
2.根據權利要求1所述檢測BRAF基因突變的引物探針組合物,其特征在于,所述探針為Taqman探針,所述Taqman探針的5’端標記有熒光報告基團,3’端標記有熒光淬滅基團;
所述熒光報告基團包括FAM、Cy5、ROX、VIC和NED中的任一種;所述熒光淬滅基團包括MGB、NFQ、QSY、MGB和BHQ1中的任一種。
3.根據權利要求2所述檢測BRAF基因突變的引物探針組合物,其特征在于,所述熒光報告基團為VIC;所述熒光淬滅基團為MGB。
4.一種檢測BRAF基因突變的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求1~3任一項所述的引物探針組合物。
5.根據權利要求4所述的檢測BRAF基因突變的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括針對人類CFTR基因保守序列特異性的內參引物和內參探針;
所述內參引物包括SEQ ID No.4~5所示的的核苷酸序列;所述內參探針包括SEQ IDNo.6所示的的核苷酸序列。
6.根據權利要求5所述的檢測BRAF基因突變的試劑盒,其特征在于,所述內參探針的5’端標記有熒光報告基團,3’端標記有熒光淬滅基團;
所述內參探針的熒光報告基團與所述檢測探針的熒光報告基團不同;
優選地,所述內參探針的熒光報告基團為NED,所述內參探針的熒光淬滅基團為MGB。
7.一種根據權利要求4~6任一項所述的試劑盒以非疾病診斷和/或治療為目的的使用方法,其特征在于,其包括:
提取待測樣本的基因組,使用所述試劑盒對所述待測樣本的基因組進行擴增,檢測熒光信號,將熒光信號的閾值限設置為0.15,分析Ct值。
8.根據權利要求7所述的使用方法,其特征在于,所述擴增的程序包括:
預變性:95℃、30sec,1個循環;
循環擴增:95℃、10sec,60℃、30sec;
所述循環擴增的次數為45次。
9.一種根據權利要求4~6任一項所述的試劑盒在制備BRAF基因突變相關的癌癥診斷試劑中的應用。
10.根據權利要求9所述的應用,其特征在于,所述癌癥包括甲狀腺乳頭狀癌、結直腸癌和黑色素瘤。
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