[發明專利]基于CRISPR檢測腦卒中相關TYMS基因的試劑盒在審
| 申請號: | 202210128252.7 | 申請日: | 2022-02-10 |
| 公開(公告)號: | CN114438192A | 公開(公告)日: | 2022-05-06 |
| 發明(設計)人: | 肖以磊;于福華;孫漢宇;劉岳飛;周杰;邢曉輝;李中辰;程誠;姚杰 | 申請(專利權)人: | 江蘇博嘉生物醫學科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/686 |
| 代理公司: | 武漢智嘉聯合知識產權代理事務所(普通合伙) 42231 | 代理人: | 姜婷 |
| 地址: | 226000 江蘇省南通市崇川區*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 crispr 檢測 腦卒中 相關 tyms 基因 試劑盒 | ||
1.一種檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括突變型crDNA或突變型crRNA;
所述突變型crDNA包括:
rs699517突變型crDNA,其序列如SEQ ID NO.1所示;
和/或rs2790突變型crDNA,其序列如SEQ ID NO.2所示;
所述突變型crRNA包括:
rs699517突變型crRNA,其序列如SEQ ID NO.3所示;
和/或rs2790突變型crRNA,其序列如SEQ ID NO.4所示。
2.根據權利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括用于特異性擴增TYMS基因上rs699517位點的引物對:rs699517-F,其序列如SEQ ID NO.5所示,rs699517-R,其序列如SEQ ID NO.6所示;和/或用于特異性擴增TYMS基因上rs2790位點的引物對:rs2790-F,其序列如SEQ ID NO.7所示;rs2790-R,其序列如SEQ ID NO.8所示。
3.根據權利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括cas12a蛋白。
4.根據權利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括熒光探針,所述熒光探針的5’端標記有熒光報告基團,所述熒光探針的3’端標記有熒光猝滅基團。
5.根據權利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒包括DNA酶抑制劑。
6.根據權利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒中包括陰性對照品,所述陰性對照品為野生型crDNA或野生型crRNA:
所述野生型crDNA包括:
rs699517野生型crDNA,其序列如SEQ ID NO.9所示;
和/或rs2790野生型crDNA,其序列如SEQ ID NO.10所示;
所述野生型crRNA包括:
rs699517野生型crRNA,其序列如SEQ ID NO.11所示;
和/或rs2790野生型crRNA,其序列如SEQ ID NO.12所示。
7.如權利要求1所述檢測試劑盒在檢測與腦卒中相關TYMS基因突變中的應用。
8.根據權利要求7所述的應用,其特征在于,所述應用的過程具體為:對待測DNA樣品進行PCR擴增,擴增完成后加入檢測混合液反應,并采集熒光變化;所述檢測混合液含有熒光探針和權利要求1所述突變型crRNA;所述突變型crDNA在T7 RNA聚合酶作用下生成RNA,經回收純化得到對應的crRNA。
9.根據權利要求8所述的應用,其特征在于,所述PCR擴增的程序為:95℃3min進行預變性;95℃10s,60℃20s,循環30次;最后降溫至25℃,反應結束。
10.根據權利要求8所述的應用,其特征在于,所述檢測混合液共50uL,具體為:250~500nM純化的cas12a蛋白,250~500nM突變型crRNA,1~5μL熒光探針,2μL DNA酶抑制劑,無酶水余量。
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