[發明專利]用于睪丸癌篩查的標志物、探針組合物及其應用

在審

• 申請號: 202210117048.5
• 申請日: 2022-02-07
• 公開（公告）號: CN114703281A
• 公開（公告）日: 2022-07-05
• 發明（設計）人: 吳寧寧;韓曉亮;連明;王小奇;張聰;魏闖;李永君
• 申請（專利權）人: 博爾誠（北京）科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/6837;C12N15/11
• 代理公司: 北京彩和律師事務所 11688
• 代理人: 閆桑田

1.一種用于檢測睪丸癌的標志物，所述標志物對應的基因為CMAHP。

2.根據權利要求1所述的標志物，其中，所述標志物包含如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列，優選所述標志物為甲基化后的標志物。

3.一種探針組合物，所述探針組合物包含靶向權利要求1或2所述標志物甲基化狀態的探針。

4.根據權利要求3所述的探針組合物，其中，所述探針組合物包含靶向高甲基化的所述標志物的第一探針組合物和靶向低甲基化的所述標志物的第二探針組合物，所述第一探針組合物用于與經重亞硫酸鹽轉化的高甲基化的標志物區域雜交，所述第二探針組合物用于與經重亞硫酸鹽轉化的低甲基化的標志物區域雜交；

優選的，所述第一探針組合物包括n個探針，所述n個探針與經重亞硫酸鹽轉化的高甲基化的標志物區域的正義鏈和/或反義鏈的每個核苷酸雜交；

優選的，所述第二探針組合物包括m個探針，所述m個探針與經重亞硫酸鹽轉化的低甲基化的標志物區域的正義鏈和/或反義鏈的每個核苷酸雜交；

優選的，n和m均是1-10中的任意整數；

優選的，第n-1個探針和第n個探針之間有x₁個核苷酸重疊，優選的，x₁為0-100中的任意整數；

優選的，第m-1個探針和第m個探針之間有x₂個核苷酸重疊，優選的，x₂為0-100中的任意整數；

進一步優選的，所述第一探針組合物包括如SEQ ID NO:2-3中的一種或兩種，所述第二探針組合物包括如SEQ ID NO:4-5中的一種或兩種。

5.標志物在制備用于檢測睪丸癌的試劑盒中的用途，所述標志物對應的基因為CMAHP。

6.根據權利要求5所述的用途，其中，所述標志物的核苷酸序列包含如SEQ ID NO:1中所示的序列，優選所述標志物為甲基化后的標志物；

優選的，所述探針組合物用于靶向睪丸癌的甲基化后的標志物；

優選的，所述探針組合物為權利要求3或4所述的探針組合物。

7.一種用于睪丸癌檢測的組合物，所述組合物包括用于檢測CMAHP的甲基化狀態的核酸。

8.根據權利要求7所述的組合物，其中，所述標志物包含如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列。

9.根據權利要求7或8所述的組合物，其中，所述核酸包括權利要求3或4所述的探針組合物；

優選的，所述核酸包括：

引物，所述引物為所述標志物中的至少9個核苷酸的片段，所述片段包含至少一個CpG二核苷酸序列；

優選的，所述核酸還包括：

探針，所述探針在中等嚴緊或嚴緊條件下與所述標志物中的至少15個核苷酸片段雜交，所述片段包含至少一個CpG二核苷酸序列；

優選的，所述組合物還包括將標志物的5位未甲基化的胞嘧啶堿基轉化為尿嘧啶的試劑；

優選的，所述用于檢測標志物甲基化的核酸還包括：

優先與處于非甲基化狀態的靶序列結合的阻斷劑。

10.一種試劑盒，其包含用于檢測權利要求1或2所述的標志物的試劑或者權利要求3或4所述的探針組合物或者權利要求7-9中任一項所述的組合物。

11.一種芯片，其包含權利要求1或2所述的標志物或者權利要求3或4所述的探針組合物或者權利要求7或8所述的組合物。