[發明專利]整合多個脂肪酸代謝基因評價急性髓細胞白血病臨床預后的系統在審
| 申請號: | 202210076154.3 | 申請日: | 2022-01-21 |
| 公開(公告)號: | CN114300140A | 公開(公告)日: | 2022-04-08 |
| 發明(設計)人: | 陳苗;顏曉菁;陶圓;岳鵬杰;沈帥 | 申請(專利權)人: | 中國醫科大學附屬第一醫院 |
| 主分類號: | G16H50/30 | 分類號: | G16H50/30;G16H50/20;G06F17/18 |
| 代理公司: | 沈陽亞泰專利商標代理有限公司 21107 | 代理人: | 史力伏 |
| 地址: | 110001 遼寧*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 整合 脂肪酸 代謝 基因 評價 急性 細胞 白血病 臨床 預后 系統 | ||
本發明屬于生物醫學專業領域,具體涉及基于9個脂肪酸代謝相關基因預測AML患者的總體生存率的預后模型。本發明分析了來自TCGA和VIZOME中354例AML患者的基因表達譜,基于TCGA數據集的脂肪酸代謝相關基因,使用單變量Cox回歸分析和生存分析確定了預后相關的基因,建立了具有9個脂肪酸相關基因的預后模型,這一模型可以較特異和敏感地評價AML患者的預后情況。然后,利用諾模圖將脂肪酸代謝基因預后模型和年齡,細胞遺傳學風險度整合成一個評分系統,更精確地預測AML患者的生存情況,具有廣闊的臨床應用全景。
技術領域
本發明屬于生物醫學專業領域,具體涉及基于9個脂肪酸代謝相關基因預測急性髓系白血病患者的總體生存率的預后模型。
背景技術
急性髓細胞性白血病(AML)是一種造血來源的腫瘤,其特征在于克隆增殖,分化阻滯和抑制惡性干細胞或祖細胞的凋亡。AML具有較差的臨床預后,死亡率高,其總的5年生存率不足50%。標準化療方案是主要的治療手段,但有時無法達到完全緩解(CR),并且CR后還可能會復發。盡管目前提出了去甲基化藥物,BCL2抑制劑等新型靶向藥的治療方案,但治療效果仍不是十分理想。因此,對于急性髓細胞白血病患者,臨床急需有效的預后判斷指標和疾病監測指標,以提供有效的治療和預后預測方案。
近年來,代謝重編程已經被公認為腫瘤的基本特征。早先提出的Warburg效應表明,癌細胞主要通過有氧糖酵解的方式來為其提供快速增殖的能量;近期的研究發現,線粒體代謝對腫瘤的生長同樣有著至關重要的作用,而脂肪酸作為線粒體代謝的主要原料發揮著關鍵作用。已有研究表明,脂肪酸代謝在AML細胞,尤其是白血病干細胞中對細胞生存及對BCL2抑制劑等靶向藥的耐藥起到關鍵作用。脂肪酸代謝相關基因與AML的發生發展密切相關,但在AML中尚未有以脂肪酸代謝相關基因來構建模型,進而對AML患者進行預后分層的報道。
現有研究大多是以單基因為預后指標,在AML中構建多基因預后模型的較少。尤其是脂肪酸預后模型在AML中并沒有相關研究,并且我們將脂肪酸代謝模型與經典預后因子(年齡和細胞遺傳學風險度)進行進一步整合,更準確的綜合評價AML患者的預后情況。
發明內容
針對上述問題,本發明提供一種檢測9種脂肪酸代謝基因表達水平的試劑盒在制備急性髓細胞白血病(AML)患者總體生存率診斷或輔助診斷產品中的應用。基于9個脂肪酸代謝基因的風險評分可以很好地將AML患者分為高危、低危人群,這可能有助于臨床治療方案的選擇。
為了實現上述目的,本發明提供了如下技術方案。
本發明提供了一種急性髓細胞白血病患者總體生存率預后模型,其特征在于,所述模型基于9種脂肪酸代謝基因。
進一步地,所述9種脂肪酸代謝基因為MLYCD、CYP4F2、SLC25A1、PLA2G4A、ACBD4、ACOT7、ACSF2、CBR1和ACSL5。
進一步地,所述預后模型通過檢測急性髓細胞白血病患者的樣品中9種脂肪酸代謝基因的表達水平進行風險評分:風險評分=(0.299 * SLC25A1的表達水平) - (1.090 *MLYCD的表達水平) - (0.394 * CYP4F2A的表達水平) + (0.474 * PLA2G4A的表達水平)+ (0.488 * ACBD4的表達水平) + (0.538 * ACOT7的表達水平) + (0.566 * ACSF2的表達水平) + (0.632 * CBR1的表達水平) + (0.750 * ACSL5的表達水平)。
進一步地,上述急性髓細胞白血病患者總體生存率預后模型在制備急性髓細胞白血病患者總體生存率診斷或輔助診斷產品中的應用。
本發明還提供了一種基于9種脂肪酸代謝基因預后模型、年齡和細胞遺傳學風險度的急性髓細胞白血病的諾模圖構建方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:
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