[發(fā)明專(zhuān)利]整合多個(gè)脂肪酸代謝基因評(píng)價(jià)急性髓細(xì)胞白血病臨床預(yù)后的系統(tǒng)

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202210076154.3
• 申請(qǐng)日: 2022-01-21
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN114300140A
• 公開(kāi)（公告）日: 2022-04-08
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 陳苗;顏曉菁;陶?qǐng)A;岳鵬杰;沈帥
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院
• 主分類(lèi)號(hào): G16H50/30
• 分類(lèi)號(hào): G16H50/30;G16H50/20;G06F17/18
• 代理公司: 沈陽(yáng)亞泰專(zhuān)利商標(biāo)代理有限公司 21107
• 代理人: 史力伏

1.一種急性髓細(xì)胞白血病患者總體生存率預(yù)后模型，其特征在于，所述模型基于9種脂肪酸代謝基因。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述一種急性髓細(xì)胞白血病患者總體生存率預(yù)后模型，其特征在于，所述9種脂肪酸代謝基因?yàn)镸LYCD、CYP4F2、SLC25A1、PLA2G4A、ACBD4、ACOT7、ACSF2、CBR1和ACSL5。

3. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種急性髓細(xì)胞白血病患者總體生存率預(yù)后模型，其特征在于，所述預(yù)后模型通過(guò)檢測(cè)急性髓細(xì)胞白血病患者的樣品中9種脂肪酸代謝基因的表達(dá)水平進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分：風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分=(0.299 * SLC25A1的表達(dá)水平) - (1.090 * MLYCD的表達(dá)水平) - (0.394 * CYP4F2A的表達(dá)水平) + (0.474 * PLA2G4A的表達(dá)水平) + (0.488 *ACBD4的表達(dá)水平) + (0.538 * ACOT7的表達(dá)水平) + (0.566 * ACSF2的表達(dá)水平) +(0.632 * CBR1的表達(dá)水平) + (0.750 * ACSL5的表達(dá)水平)。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種急性髓細(xì)胞白血病患者總體生存率預(yù)后模型在制備急性髓細(xì)胞白血病患者總體生存率診斷或輔助診斷產(chǎn)品中的應(yīng)用。

5.一種基于9種脂肪酸代謝基因預(yù)后模型、年齡和細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)度的急性髓細(xì)胞白血病的諾模圖構(gòu)建方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：

S1篩選急性髓細(xì)胞白血病有預(yù)后價(jià)值的9種脂肪酸代謝基因：MLYCD、CYP4F2、SLC25A1、PLA2G4A、ACBD4、ACOT7、ACSF2、CBR1和ACSL5；

S2根據(jù)S1中所述的9種脂肪酸代謝基因表達(dá)水平建立急性髓細(xì)胞白血病總體生存率預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型：風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分=(0.299 * SLC25A1的表達(dá)水平) - (1.090 * MLYCD的表達(dá)水平) - (0.394 * CYP4F2A的表達(dá)水平) + (0.474 * PLA2G4A的表達(dá)水平) + (0.488 *ACBD4的表達(dá)水平) + (0.538 * ACOT7的表達(dá)水平) + (0.566 * ACSF2的表達(dá)水平) +(0.632 * CBR1的表達(dá)水平) + (0.750 * ACSL5的表達(dá)水平)；

S3根據(jù)每個(gè)患者的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分、年齡和細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)度所對(duì)應(yīng)的分?jǐn)?shù)相加后得到總評(píng)分生成諾模圖。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于9種脂肪酸代謝基因預(yù)后模型、年齡和細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)度的急性髓細(xì)胞白血病諾模圖構(gòu)建方法，其特征在于，所述S1中篩選急性髓細(xì)胞白血病有預(yù)后價(jià)值的9種脂肪酸代謝基因的方法包括如下步驟：

（1）下載TCGA AML數(shù)據(jù)庫(kù)和VIZOME AML數(shù)據(jù)庫(kù)的RNA sequencing數(shù)據(jù)集和臨床數(shù)據(jù)；

（2）從Gene Set Enrichment Analysis獲取脂肪酸代謝相關(guān)基因，使用Cox回歸分析和生存分析對(duì)脂肪酸代謝相關(guān)基因進(jìn)行預(yù)后分析，P0.05作為篩選預(yù)后相關(guān)基因的截止值，篩選到有預(yù)后價(jià)值的9個(gè)脂肪酸代謝基因。

7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于9種脂肪酸代謝基因預(yù)后模型、年齡和細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)度的急性髓細(xì)胞白血病諾模圖構(gòu)建方法，其特征在于，所述S2中建立急性髓細(xì)胞白血病總體生存率預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型的方法包括如下步驟：

在訓(xùn)練集TCGA中使用S1中篩選出的9個(gè)脂肪酸代謝基因的回歸系數(shù)計(jì)算個(gè)體化的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分，并通過(guò)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分將AML患者的分為高風(fēng)險(xiǎn)組與低風(fēng)險(xiǎn)組；使用ROC計(jì)算在多個(gè)時(shí)間點(diǎn)曲線下面積AUC，以評(píng)估預(yù)后模型辨別能力；然后在測(cè)試集VIZOME中使用相同風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分公式和臨界值驗(yàn)證模型的準(zhǔn)確性。

8.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于9種脂肪酸代謝基因預(yù)后模型、年齡和細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)度的急性髓細(xì)胞白血病諾模圖構(gòu)建方法，其特征在于，S3中所述諾模圖總評(píng)分對(duì)應(yīng)的1年、2年和3年生存率即分別為AML患者1年、2年和3年的預(yù)測(cè)生存率。

9.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種基于9種脂肪酸代謝基因預(yù)后模型、年齡和細(xì)胞遺傳學(xué)風(fēng)險(xiǎn)度的急性髓細(xì)胞白血病諾模圖構(gòu)建方法構(gòu)建，其特征在于，所述方法構(gòu)建的諾模圖在制備急性髓細(xì)胞白血病患者總體生存率診斷或輔助診斷產(chǎn)品中的應(yīng)用。