[發明專利]一種侵襲性牙周炎的檢測方法

在審

• 申請號: 202210074921.7
• 申請日: 2022-01-21
• 公開（公告）號: CN114350790A
• 公開（公告）日: 2022-04-15
• 發明（設計）人: 金幼虹;王雪;熊雨;鄭欣欣;陳敬林;陳麗珍
• 申請（專利權）人: 南昌大學附屬口腔醫院（江西省口腔醫院）
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/686;C12Q1/6869;C12N15/11
• 代理公司: 湖北創融藍圖知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 42276
• 代理人: 黃太林

本發明涉及生物技術牙周炎相關基因技術領域，具體涉及三個與牙周炎易感相關的基因及其單核苷酸多態位點的檢測方法及引物、特異性探針、試劑盒和應用。本發明提供了一種與牙周炎的基因ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97及其多態位點及檢測該多態位點的方法，以及在牙周炎的預防、輔助診斷與治療等方面的用途。利用本發明提供的與牙周炎的基因及其多態位點的核酸序列，構建對牙周炎進行遺傳學診斷的試劑盒，可應用于對牙周炎的輔助診斷和對個體是否具有牙周炎的易感性進行評判，有利于牙周炎的預防、早期診斷和治療。

技術領域

本發明涉及生物技術領域中單核苷酸多態性rs147285461、rs750306056和rs781830688在篩查牙周炎患者中的應用。

背景技術

侵襲性牙周炎(AgP)是一種發生在牙齒周圍組織的、快速發展的炎癥，多發于臨床健康的個體中，表現為早期發生的快速附著喪失和骨破壞。由于牙槽骨的大量丟失，致大多數牙齒松動、移位，從而影響咀嚼功能、妨礙飲食。典型的局限性AgP發生在青春期后，而廣泛性AgP發生在30歲以下。目前公認的AgP流行率是：全球人口總流行趨勢為1.6％，其中非洲和南美洲發病率最高，分別為4.2％和4.0％；亞洲的綜合患病率為1.2％；歐洲最低，只有0.1％。上海市青少年侵襲性牙周炎患病率為0.81％。侵襲性牙周炎是人體基因發生突變或基因呈現多態性后，導致機體對細菌的抵抗力下降，從而引起牙槽骨的大面積破壞。目前已知家系組織蛋白酶C(CTSC)基因突變致侵襲性牙周炎發病，但由于人種、生活環境和所處地球緯度的不同，還有許多致病基因并不為人知曉。

隨著基因測序技術發展，人們對基因功能的研究不斷深入。發現人類基因組的DNA序列中每600個堿基中便有一個堿基具有多態性，即單核苷酸多態性(single nucleotidepolymorphisms，SNP)。SNP所表現的多態性涉及到單個堿基的變異，這種變異可由單個堿基的轉換或顛換所引起，也可由堿基的插入或缺失所致。

有研究表明，IL-6-572位點上的基因多態性與慢性牙周炎有顯著關聯，但也存在例如捷克人在該位點上不具有多態性以及對照組有32.3％的IL-6-572G等位基因攜帶者未發生慢性牙周炎。(管澤民，劉京津，馬欣，吳東紅，魚潔，黃國強。白細胞介素6基因-572位點多態性與重度慢性牙周炎易感性的相關分析，中華口腔醫學雜志2008年7月底43卷第7期)。基于此，開發一種具有更高準確性的用于判斷侵襲性牙周炎的檢測方法對于臨床診斷具有重要意義。

鑒于此，特提出本發明。

發明內容

本發明的目的之一在于針對現有技術的不足，提供與牙周炎易感相關的ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因。

本發明的目的之二為克服現有技術中的缺陷，提供一種侵襲性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測用引物及其試劑盒。

本發明首先提供了一組侵襲性牙周炎相關單核苷酸多態性檢測引物，包括單核苷酸多態性位點rs147285461、rs750306056和rs781830688的特異性擴增引物對。

其中，rs147285461的特異性擴增引物對包括：

上游引物：5'-TGGCAGACTTGAGGTTTGAATCTAC-3'(SEQ ID NO:1)

下游引物：5'-TGGCAAGTGAATAAAGCATGGGA-3'(SEQ ID NO:2)；

rs750306056的特異性擴增引物對包括：

上游引物：5'-ATACCCATCAAACCACTGGCCTT-3'(SEQ ID NO:3)

下游引物：5'-TCCTAAACTCATAGGCCTGCTTTG-3'(SEQ ID NO:4)

rs781830688的特異性擴增引物對包括：