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[發明專利]一種侵襲性牙周炎的檢測方法在審

專利信息
申請號: 202210074921.7 申請日: 2022-01-21
公開(公告)號: CN114350790A 公開(公告)日: 2022-04-15
發明(設計)人: 金幼虹;王雪;熊雨;鄭欣欣;陳敬林;陳麗珍 申請(專利權)人: 南昌大學附屬口腔醫院(江西省口腔醫院)
主分類號: C12Q1/6883 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/686;C12Q1/6869;C12N15/11
代理公司: 湖北創融藍圖知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 42276 代理人: 黃太林
地址: 330006*** 國省代碼: 江西;36
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 侵襲 牙周炎 檢測 方法
【權利要求書】:

1.檢測人基因組中ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97的多態性或基因型的試劑盒在篩查牙周炎患者中的應用。

2.如權利要求1所述的應用,其特征在于,所述試劑盒包括:特異性擴增ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97核苷酸序列中單核苷酸多態性位點的引物對。

3.如權利要求2所述的應用,其特征在于,所述引物對為三對,其中一個引物對的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;另一個引物對的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.4所示;再一個引物對的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。

4.如權利要求2所述的應用,其特征在于,所述試劑盒還包括PCR反應液,所述PCR反應液包括dNTP混合液、Taq DNA聚合酶和PCR緩沖液。

5.一種與牙周炎易感相關的ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因單核苷酸多態位點的檢測方法,其特征在于:它包括以下步驟:

步驟一,確定ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因的單核苷酸多態位點(rs147285461、rs750306056和rs781830688)的核苷酸;

步驟二,采用聚合酶鏈式反應(PCR)的分子生物學技術擴增ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因片段。

步驟三,應用測序技術檢測步驟二擴增片段中的ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因是否存在單核苷酸多態性以及單核苷酸多態的類型。

6.根據權利要求5所述的一種與牙周炎易感相關的ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因單核苷酸多態位點的檢測方法,其特征在于:

所述步驟二中,所述聚合酶鏈式反應體系為:每個所述樣品進行一個總體積為25ul體系的擴增反應,體系中包含制備的基因組DNA 1ul,10mMdNTP混合液1ul,擴增引物各1ul,10×Taq Buffer(with MgCl2)2.5ul,5U/μl Taq DNA聚合酶0.2ul,最后加入ddH2O將總體積配為25ul;

所述聚合酶鏈式反應程序為:94℃起始5min,94℃變性30s,63℃退火30s,72℃延伸30s,退火溫度每個循環降0.5℃,循環10次;95℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,循環30次;72℃延伸10min。

7.根據權利要求5所述的一種與牙周炎易感相關的ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因單核苷酸多態位點的檢測方法,其特征在于:所述步驟三中,測序技術可以是Sanger測序或二代測序技術。

8.與牙周炎易感相關的ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因的單核苷酸多態位點在對牙周炎的輔助診斷和對個體是否具有牙周炎易感性進行判斷的應用,其特征在于:

所述ANKRD36C、SREK1IP1和TMEM97基因的單核苷酸多態位點為rs147285461、rs750306056和rs781830688。

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