[發明專利]一種胰腺癌早期診斷標志物及其組織篩選方法和應用

在審

• 申請號: 202210064784.9
• 申請日: 2022-01-20
• 公開（公告）號: CN114720615A
• 公開（公告）日: 2022-07-08
• 發明（設計）人: 王紅霞;俞思薇
• 申請（專利權）人: 上海市第一人民醫院
• 主分類號: G01N30/88
• 分類號: G01N30/88;G01N30/72;G01N30/86
• 代理公司: 上海元好知識產權代理有限公司 31323
• 代理人: 賈慧琴;包姝晴

本發明公開了一種胰腺癌早期診斷標志物及其組織篩選方法和應用，該組織篩選方法包含以下步驟：步驟1，分別取未接受過治療的I?IV期胰腺癌病人臨床組織PDAC、與其配對的正常組織PNT；步驟2，通過色譜質譜聯用代謝組學分析方法，分析鑒定胰腺癌組織與正常組織之間的初步差異性代謝物；步驟3，通過質譜成像可視化示出所述的初步差異性代謝物的空間分布，找到胰腺癌組織區域中異常分布的代謝物；步驟4，對所述的異常分布的代謝物進行輔助篩選：基于組織活檢，構建基于代謝組學的胰腺癌診斷Lasso模型，從所述的異常分布的代謝物中篩選出胰腺癌組織中的早期診斷標志物，根據該方法得到的早期診斷標志物可用于胰腺癌早期的篩查和診斷。

技術領域

本發明涉及生物醫學領域，具體涉及一種胰腺癌早期診斷標志物及其組織篩選方法和應用。

背景技術

胰腺導管腺癌(PDAC,Pancreatic ductal adenocarcinoma)占胰腺惡性腫瘤的90％以上，是最具侵襲性和致命性的癌癥，5年生存率小于10％。而由于發病率上升、診斷延遲以及在治療方面缺乏重大進展，PDAC的死亡率在過去十年中上升，中位生存時間小于7個月。目前，影像學成像技術，如MRI、ERCP、EUS、CT等在臨床實踐中常規應用于PDAC患者的篩查、診斷和分期評估。然而，由于缺乏早期癥狀和診斷標志物，超過80％的PDAC 患者在診斷時存在晚期或轉移性疾病，錯過了根治性手術的機會。

由于PDAC缺乏早期癥狀和診斷標志物，使用現有技術給人們帶來了早期診斷和發現的困難。然而，盡管人們在針對患者血液中潛在的PDAC相關代謝物方面做了大量的努力，但這類分子很少被投入臨床實踐的前線，至少部分原因是缺乏低成本和高通量的分析工具。

發明內容

本發明的目的是針對現有技術中的不足，提供一種基于CPSI-MS和 DESI-MSI的代謝組學，并針對PDAC代謝全景概述的表征工具，為快速分子診斷和篩查提供了強有力的方法，以輔助臨床實踐。

為了達到上述目的，本發明提供了一種胰腺癌早期診斷標志物的組織篩選方法，包含以下步驟：步驟1，分別取胰腺癌病人臨床組織PDAC、與其配對的正常組織PNT；步驟2，通過色譜質譜聯用代謝組學分析方法，分析鑒定胰腺癌組織與正常組織之間的初步差異性代謝物；步驟3，通過質譜成像可視化示出所述的初步差異性代謝物的空間分布，找到胰腺癌組織區域中異常分布的代謝物；步驟4，對所述的異常分布的代謝物進行輔助篩選：基于組織活檢，構建基于代謝組學的胰腺癌診斷Lasso模型，從所述的異常分布的代謝物中篩選出胰腺癌組織中的早期診斷標志物。

較佳地，步驟2中，所述的色譜質譜聯用代謝組學是導電聚合物噴霧電離質譜CPSI-MS聯用代謝組學。

較佳地，步驟2中，所述的分析鑒定胰腺癌組織與正常組織之間的初步差異性代謝物包含以下步驟：

步驟2.1，以VIP大于1.0為標準保留樣本離子；

步驟2.2，對步驟2.1中得到的樣本離子進行T檢驗，以FDR0.05為標準進一步保留樣本離子；

步驟2.3，對步驟2.2中得到的樣本離子進行差異倍數分析，以差異倍數大于2.0或小于0.5為標準再進一步保留樣本離子；

步驟2.4，將步驟2.3得到的樣本離子與代謝組數據庫進行比對，得到組織中76種初步差異性代謝物。

較佳地，步驟3中，所述的質譜成像技術為解吸電噴霧電離質譜成像 DESI-MSI，可視化示出每個所述的初步差異性代謝物的空間分布圖進行原位驗證。

較佳地，步驟4中，所述的輔助篩選包含以下步驟：

步驟4.1，將n＝150個組織樣本點作為訓練集，n＝90個組織樣本點作為測試集，用于評估預先訓練的Lasso模型的表現；