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[發(fā)明專利]基于酶DNA修復(fù)級(jí)聯(lián)驅(qū)動(dòng)熒光團(tuán)編碼/去編碼的生物傳感器及其在端粒酶檢測(cè)中的應(yīng)用在審

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 202210043048.5 申請(qǐng)日: 2022-01-14
公開(公告)號(hào): CN114507706A 公開(公告)日: 2022-05-17
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 張春陽;劉明昊;于宛彤 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 山東師范大學(xué)
主分類號(hào): C12Q1/48 分類號(hào): C12Q1/48;C12Q1/682;C12Q1/6825
代理公司: 濟(jì)南圣達(dá)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 37221 代理人: 宋海海
地址: 250014 山*** 國(guó)省代碼: 山東;37
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 基于 dna 修復(fù) 級(jí)聯(lián) 驅(qū)動(dòng) 熒光 編碼 生物 傳感器 及其 端粒 檢測(cè) 中的 應(yīng)用
【權(quán)利要求書】:

1.一種基于酶DNA修復(fù)級(jí)聯(lián)驅(qū)動(dòng)熒光團(tuán)編碼/去編碼的生物傳感器,其特征在于,所述生物傳感器至少包括AP探針,TS引物,無嘌呤/無嘧啶核酸內(nèi)切酶,熒光基團(tuán)修飾的dATP,末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶以及鏈霉親和素包被的磁珠;

其中,所述AP探針為一個(gè)單鏈的DNA,所述AP探針含有無嘌呤/無嘧啶位點(diǎn);且所述AP探針可以與端粒酶延伸產(chǎn)物完全雜交形成包含AP位點(diǎn)的雙鏈DNA,而與未能發(fā)生反應(yīng)的TS引物只會(huì)部分雜交。

2.如權(quán)利要求1所述的生物傳感器,其特征在于,所述AP探針5'末端和3'末端分別修飾有生物素和磷酸基團(tuán);

優(yōu)選的,所述AP探針長(zhǎng)度為30nt,所述AP探針的堿基序列為:5'-Biotin-CCTCCC TAAXCC TAA CTC TGC TCG ACG GAT-PO4-3',其中下劃線標(biāo)出的堿基序列即為磁珠捕獲的后續(xù)進(jìn)行TdT擴(kuò)增的序列,下劃線標(biāo)出的X即無嘌呤/無嘧啶位點(diǎn)。

3.如權(quán)利要求1所述的生物傳感器,其特征在于,所述熒光基團(tuán)修飾的dATP中,所述熒光基團(tuán)為Cy5;

優(yōu)選的,所述Cy5 dATPs在總dATPs中占比少于50%,進(jìn)一步少于30%,優(yōu)選為20%。

4.如權(quán)利要求1所述的生物傳感器,其特征在于,所述生物傳感器還包括核酸外切酶,優(yōu)選為核酸外切酶I。

5.權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述生物傳感器在檢測(cè)端粒酶中的應(yīng)用。

6.一種檢測(cè)端粒酶的方法,其特征在于,所述方法包括采用權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述生物傳感器進(jìn)行檢測(cè)。

7.如權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于,所述方法包括:

S1、將待測(cè)樣品加入反應(yīng)溶液I中,進(jìn)行端粒酶延伸以及酶切反應(yīng),然后高溫滅活處理并進(jìn)行磁珠捕獲,構(gòu)建MB單鏈DNA納米結(jié)構(gòu);

S2、向步驟S1制得的MB單鏈DNA納米結(jié)構(gòu)中加入TdT酶,dATPs和熒光基團(tuán)修飾的dATP,進(jìn)行延伸反應(yīng),得到熒光基團(tuán)標(biāo)記的多尾單鏈DNA鏈;

S3、向步驟S2中熒光基團(tuán)標(biāo)記的多尾單鏈DNA鏈中加入核酸外切酶進(jìn)行反應(yīng);

優(yōu)選的,所述步驟S1中,反應(yīng)溶液I中至少包括TS引物、APE1酶和AP探針;

進(jìn)一步優(yōu)選的,所述反應(yīng)溶液I中還可以包括dNTPs、RNA酶抑制劑以及反應(yīng)buffer等,從而有助于反應(yīng)的順利進(jìn)行;

優(yōu)選的,端粒酶延伸以及酶切反應(yīng)具體反應(yīng)條件為:在30-45℃(優(yōu)選為37℃),反應(yīng)30-60min(優(yōu)選為30min);高溫滅活的溫度為60℃以上,優(yōu)選為65℃;

優(yōu)選的,所述磁珠為鏈霉親和素包被的磁珠,磁珠使用濃度控制為1-10mg mL-1,優(yōu)選為5mg mL-1

優(yōu)選的,所述步驟S2中,延伸反應(yīng)具體條件為:在30-45℃(優(yōu)選為37℃),反應(yīng)0.5-2h(優(yōu)選為1h);

優(yōu)選的,所述步驟S3中,反應(yīng)具體條件為:在30-45℃(優(yōu)選為37℃),反應(yīng)10-60min(優(yōu)選為15min);

8.如權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,所述方法還包括對(duì)步驟S3獲得的反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)分析;優(yōu)選的,所述檢測(cè)分析包括熒光檢測(cè)分析和單分子成像檢測(cè)分析。

優(yōu)選的,待測(cè)樣品是生物樣品,所述生物樣品包括離體的血液、體液、組織和細(xì)胞。

9.權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述生物傳感器和/或權(quán)利要求6-8任一項(xiàng)所述檢測(cè)方法在端粒酶相關(guān)藥物篩選和/或生物樣品端粒酶檢測(cè)分析中的應(yīng)用。

10.如權(quán)利要求9所述應(yīng)用,其特征在于,所述端粒酶相關(guān)藥物包括端粒酶促進(jìn)劑和端粒酶抑制劑;

所述生物樣品包括離體的血液、體液、組織和細(xì)胞。

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