[發明專利]與牛血小板生成相關的SNP標記位點與應用

在審

• 申請號: 202210026013.0
• 申請日: 2022-01-11
• 公開（公告）號: CN114606325A
• 公開（公告）日: 2022-06-10
• 發明（設計）人: 茍瀟;孔小艷;楊舒黎;朱莉;展亞楠;唐琳;張曉燕;張光榮;李昕鵬
• 申請（專利權）人: 佛山科學技術學院;云南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京隆達恒晟知識產權代理有限公司 11899
• 代理人: 李寧

1.與牛血小板生成相關的SNP標記位點，其特征在于：所述的SNP標記位點位于牛第1號染色體THPO基因第4內含子1316bp處，G1316T位點（chr1：83431707），堿基變異信息為T G；該位點GG基因型個體血小板數（PLT）極顯著高于GT或TT基因型個體，GG基因型個體的低氧耐受和高原適應能力顯著高于GT或TT基因型個體。

2.權利要求1所述的SNP標記位點在檢測牛高原適應能力或選育耐高原低氧環境的牛中的應用。

3.權利要求1所述的SNP標記位點在制備檢測牛高原低氧環境適應性或選育耐高原低氧環境牛的試劑盒中的應用。

4.一種檢測牛低氧環境適應性的方法，其特征在于：以待測牛的全基因組DNA為模板，檢測權利要求1若該位點為GG基因型，則待測牛的低氧耐受和高原適應能力較好，判定為低氧耐受優勢型；若該位點為GT或TT基因型，則待測牛的低氧耐受和高原適應能力較弱，判定為低氧耐受劣勢型。

5.一種選育耐高原低氧環境牛的方法，其特征在于：通過檢測權利要求1所述的SNP標記位點，選擇THPO基因G1316T位點基因型為GG型的個體作為育種親本。

6.用于檢測權利要求1中所述的SNP標記位點的PCR引物，其特征在于：上游引物THPO-F為CCAGGGACAGAAGAGAC；下游引物THPO-R為GGCGAACTCAGAGATTG。

7.如權利要求6所述的PCR引物，其特征在于：引物PCR擴增反應條件如下：95℃預變性5min；95℃變性 45s，59℃退火 45s，72℃延伸45s，35個循環；72℃后延伸8min。

8.一種輔助選育耐高原低氧環境牛的試劑盒，其特征在于：包含權利要求6或7所述的PCR引物。