[發(fā)明專利]與疆南絨山羊羊絨纖維直徑及其變異系數(shù)相關(guān)的分子標(biāo)記及特異性引物對(duì)和應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202210024306.5
• 申請(qǐng)日: 2022-01-07
• 公開（公告）號(hào): CN114350816A
• 公開（公告）日: 2022-04-15
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 付雪峰;吳翠玲;秦崇凱;石剛;薛多雄;何軍敏;劉靜;毛靜藝
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 新疆畜牧科學(xué)院畜牧研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/6858;C12Q1/6806
• 代理公司: 烏魯木齊合縱專利商標(biāo)事務(wù)所 65105
• 代理人: 周星瑩;譚南

本發(fā)明涉及動(dòng)物分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，是一種與疆南絨山羊羊絨纖維直徑及其變異系數(shù)相關(guān)的分子標(biāo)記及特異性引物對(duì)和應(yīng)用，該與疆南絨山羊羊絨纖維直徑及纖維直徑變異系數(shù)相關(guān)的分子標(biāo)記位于疆南絨山羊1號(hào)染色體的KRTAP27?1基因上，KRTAP27?1基因位于1號(hào)染色體核苷酸序列的第3968645bp?3969193bp處，所述分子標(biāo)記位于1號(hào)染色體核苷酸序列的3968799bp處，突變堿基為A或G。本發(fā)明所述分子標(biāo)記能夠?qū)崿F(xiàn)羊絨纖維直徑及纖維直徑變異系數(shù)性狀優(yōu)良品種種羊的早期選種，出生后即可進(jìn)行選留，從而降低選育成本，加速高品質(zhì)超細(xì)型絨山羊的育種進(jìn)程，為疆南絨山羊的遺傳改良提供理論基礎(chǔ)和指導(dǎo)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及動(dòng)物分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，是一種與疆南絨山羊羊絨纖維直徑及其變異系數(shù)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其特異性引物對(duì)，所述變異系數(shù)是指纖維直徑變異系數(shù)，所述特異性引物對(duì)在制備體外檢測(cè)與疆南絨山羊羊絨纖維直徑及纖維直徑變異系數(shù)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記的試劑或試劑盒的應(yīng)用，以及所述分子標(biāo)記在疆南絨山羊羊絨纖維直徑及纖維直徑變異系數(shù)性狀選擇中的應(yīng)用。

背景技術(shù)

隨著人民生活水平日益提高，越來越多的人不僅注重服飾的款式與舒適感，更注重其生態(tài)與保健性。集華麗、高貴、輕薄、柔軟、舒適與保健為一體的羊絨制品無疑會(huì)受到更多人的青睞。

2020年，疆南絨山羊是經(jīng)歷40年的培育而形成的絨山羊新品種，擁有生產(chǎn)性能高、耐粗飼等優(yōu)良特性。疆南絨山羊生態(tài)壞境惡劣，核心育種基地(新疆阿克蘇綜合試驗(yàn)站)位于東經(jīng)79°47′，北緯41°23′，海拔2000米的干旱荒漠、半荒漠草場(chǎng)上。年均氣溫6.5℃，降雨量200毫米。90％的草場(chǎng)為荒漠草場(chǎng)，植被覆蓋率約10％至30％。

但近幾年隨著羊肉價(jià)格的沖擊和基層育種工作的懈怠，疆南絨山羊存在原有細(xì)絨資源流失的現(xiàn)象，嚴(yán)重影響了羊絨品質(zhì)，影響絨銷售價(jià)格。而這些絨山羊養(yǎng)殖是當(dāng)?shù)啬撩裰饕慕?jīng)濟(jì)來源。山羊絨的價(jià)格受到絨色澤和細(xì)度的影響，在同色系的羊絨中，纖維直徑越細(xì)價(jià)格越高。年齡、性別和飼養(yǎng)管理均能影響絨山羊絨纖維直徑。但除了這些因素外，遺傳才是左右羊絨細(xì)度的根本原因。種業(yè)是現(xiàn)代羊產(chǎn)業(yè)發(fā)展的基石，遺傳改良是提高羊產(chǎn)業(yè)競(jìng)爭(zhēng)力的關(guān)鍵。絨山羊新品種的育成和推廣應(yīng)用成為這些人民群眾立足當(dāng)?shù)刭Y源脫貧致富的重要途徑。選育適應(yīng)新疆等極端地方氣候的超細(xì)型絨山羊是當(dāng)?shù)仄惹屑毙璧娜蝿?wù)。因此尋求一種有效、便捷，并且能夠在短時(shí)間內(nèi)加速絨山羊育種進(jìn)程的育種手段便顯得尤為重要。

經(jīng)典的育種方法主要是通過雜交，但該方法遺傳進(jìn)展較慢、育種周期較長(zhǎng)。隨著分子生物學(xué)理論和技術(shù)的快速發(fā)展，分子遺傳學(xué)和基因工程方法與傳統(tǒng)的標(biāo)記輔助選擇方法相結(jié)合，為育種問題提供了更好的解決方案。尋找羊絨性狀相關(guān)的遺傳標(biāo)記是我們最先關(guān)注的方向。

目前針對(duì)纖維直徑性狀，在中國(guó)主要的絨山羊品種，如遼寧絨山羊、內(nèi)蒙古絨山羊和西藏絨山羊都進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究?；蚪M方面，主要采取全基因組關(guān)聯(lián)性分析、候選基因多態(tài)性分析等研究策略挖掘絨山羊絨纖維直徑相關(guān)的基因和分子標(biāo)記。而疆南絨山羊新品種審定后，關(guān)于羊絨性狀的研究鮮有報(bào)道。

角蛋白和角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白是構(gòu)成毛發(fā)的主要蛋白質(zhì)。在毛發(fā)皮質(zhì)中，毛發(fā)角蛋白中間絲嵌在由毛發(fā)角蛋白相關(guān)蛋白(KRTAP)組成的絲間基質(zhì)中，該蛋白通過其廣泛的二硫鍵與毛發(fā)角蛋白中豐富的半胱氨酸殘基交聯(lián)，對(duì)形成堅(jiān)硬且有抗性的毛干至關(guān)重要。KRTAP13、KRTAP15、KRTAP24，和KRTAP27屬于HS族the high sulphur(HS；≤30mol％cysteine)。由于HS蛋白在毛發(fā)中首先表達(dá)，因此大多數(shù)學(xué)者集中研究HS蛋白。有研究表明氨基酸的改變可能影響蛋白質(zhì)在翻譯后修飾過程中磷酸化位點(diǎn)的丟失與否，同時(shí)導(dǎo)致蛋白質(zhì)的凈電荷發(fā)生改變。

編碼角蛋白關(guān)聯(lián)的基因通常較為豐富突變，這些變異可能與絨山羊的產(chǎn)絨性能有關(guān)。目前，KRTAP15-，KRTAP13.1，KRTAP27-1和KRTAP24-1等基因多態(tài)性在綿、山羊中已被證實(shí)能夠影響羊絨性狀。但這些基因是否能夠影響疆南絨山羊的羊絨纖維直徑還不清楚。因此本研究分析疆南絨山羊KRTAP27-1基因多態(tài)性對(duì)羊絨纖維直徑的影響，旨在為培育超細(xì)型絨山羊提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。