[發明專利]在染色質靶點處DNA鏈斷裂的誘導

在審

• 申請號: 202180008284.7
• 申請日: 2021-01-15
• 公開（公告）號: CN114981424A
• 公開（公告）日: 2022-08-30
• 發明（設計）人: 邁克爾·羅德尼·羅恩特里;詹姆斯·M·斯塔福德
• 申請（專利權）人: 尼祖姆貝公司
• 主分類號: C12N9/22
• 分類號: C12N9/22;C07K19/00;A61P35/00
• 代理公司: 上海瀚橋專利代理事務所(普通合伙) 31261
• 代理人: 曹芳玲

本公開的一個方面涉及物質組合物，所述物質組合物包括編碼肽的核苷酸構建體，所述肽至少包括：被配置為與具有降低的表觀遺傳抑制模式的染色質結合的靶向結構域；以及DNA鏈斷裂誘導結構域。當通過在染色質位點結合而積累時，鏈斷裂誘導結構域可能導致DNA的特異性雙鏈斷裂，誘導表現出表觀遺傳抑制模式的細胞中的細胞死亡。

相關申請的交叉引用

本申請要求于 2020 年 1 月 17 日提交的美國臨時申請號 62/962,766 的優先權，其全部內容通過引用并入本文作為參考。

背景技術

許多癌癥類型與異常的表觀遺傳調節有關。腫瘤抑制基因通常通過表觀遺傳學下調而受到抑制，而生長和復制促進基因被上調。許多癌細胞類型發展出相似的表觀遺傳模式，導致不受控制的生長和失調。

發明內容

提供本發明內容以便以簡化的形式介紹將在下面的詳細描述中進一步描述的一些概念。本發明內容并非旨在標識所要求保護的主題的關鍵特征或必要特征，也不旨在用于限制所要求保護的主題的范圍。此外，要求保護的主題不限于解決在本公開的任意部分中提到的任意或所有缺點的實現。

本公開的一個方面涉及物質組合物。該物質組合物包含編碼肽的核苷酸構建體。所述肽至少包括被配置成結合至具有降低的表觀遺傳抑制模式的染色質的靶向結構域，和DNA鏈斷裂誘導結構域。當通過結合染色質位點而累積時，鏈斷裂誘導結構域可能會導致DNA 的特定雙鏈斷裂，從而誘導表現出降低的表觀遺傳抑制模式的細胞中的細胞死亡。

附圖說明

圖1示意性地說明了允許和抑制染色質包裝的示例。

圖2示出了包括與DNA鏈斷裂誘導結構域偶聯的甲基化敏感DNA結合結構域的示例性構建體。

圖3示出了包含與DNA鏈斷裂誘導結構域偶聯的修飾敏感組蛋白結合結構域的示例性構建體。

圖4示意性地示出了靶向癌細胞的物質的示例性組合物。

圖5示出了用于治療攜帶腫瘤的哺乳動物的示例性方法。

圖6示出了通過低甲基化LINE-1元件的靶向誘導DNA損傷的實驗數據。

具體實施方式

該具體實施方式提出了一種針對在許多癌癥中發生的常見表觀遺傳變化的治療方法，所述表觀遺傳變化包括組蛋白修飾的變化和重復 DNA 元件處胞嘧啶甲基化的喪失（“低甲基化”）。利用表觀遺傳抑制的這種喪失，可以進行精確影響異常細胞中的功能的治療，而在健康的、適當調節的細胞中具有有限的活性。

典型的化療劑，雖然通常對癌細胞有效，但經常受到對正常的、健康的細胞的“脫靶”不利影響的困擾。因此，開發新的化療劑的主要目標是消除或最小化這些“脫靶”效應。實現這一目標的一種方法是通過靶向區分癌細胞與正常細胞的生物化學過程和/或事件。這種差異的一個例子是破壞大多數癌癥中的正常 DNA 甲基化模式。這種失調可能表現為在基因組中特定位置處胞嘧啶甲基化的獲得（高甲基化）和喪失（低甲基化）。

癌癥中的基因特異性的高甲基化通常在與腫瘤抑制基因 (TSG) 的啟動子相關的DNA 序列中發現。異常的高甲基化被認為是導致高甲基化 TSG 的轉錄被關閉或“沉默” 事件的表觀遺傳級聯的重要部分。 TSG的沉默在腫瘤發生中起著顯著和直接的作用。