[發明專利]一種ACOT7-NPHP4融合基因及其應用和檢測試劑盒

在審

• 申請號: 202111544652.8
• 申請日: 2021-12-16
• 公開（公告）號: CN114107350A
• 公開（公告）日: 2022-03-01
• 發明（設計）人: 縱鑫;閆金松;王海娜;盧瑩
• 申請（專利權）人: 大連醫科大學附屬第二醫院;上海交通大學醫學院附屬新華醫院
• 主分類號: C12N15/62
• 分類號: C12N15/62;C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11
• 代理公司: 上海盈盛知識產權代理事務所(普通合伙) 31294
• 代理人: 孫佳胤

本發明提供一種ACOT7?NPHP4融合基因及其應用和檢測試劑盒，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。本發明首先發現、鑒定了急性淋巴細胞白血病中存在新融合基因ACOT7?NPHP4，評估認為ACOT7?NPHP4可以作為急性淋巴細胞白血病的特異性分子標志物，進而開發了一款臨床上可用于診斷、檢測患者微小殘留病(MRD)的試劑盒。試劑盒利用Taqman探針實時熒光PCR對急性淋巴細胞白血病患者體內ACOT7?NPHP4融合基因進行絕對定量，其檢測特異性好、靈敏度高、方法簡便高效、成本低廉，能夠滿足臨床上的診療需求。

技術領域

本發明涉及生物醫學技術領域，尤其涉及一種急性淋巴細胞白血病融合基因及其應用和檢測試劑盒。

背景技術

急性淋巴細胞白血病(ALL)是臨床常見的血液惡性腫瘤，大多數ALL患者通過臨床多藥化療誘導獲得緩解，但半數還是會復發。而通過監測微小殘留病灶(MRD)，即治療后持續存在的白血病原始細胞數低于常規形態學檢測的限度，越來越多地用于評估治療效果，是聯合化療后最有效的評判標準，對改善患者預后至關重要。并且多項研究表明，MRD是兒童和成人ALL的獨立預后因素。因此，幾乎所有兒童ALL和大部分成人ALL的治療方案均與監測MRD結合來評估治療后的反應。

現如今，監測MRD的方法是利用白血病細胞特有的特征來將它們與正常細胞區分開來，篩選出腫瘤細胞的分子標志物，包括融合基因(例如通過聚合酶鏈反應(PCR)方法檢測BCR/ABL1是篩選費城染色體陽性B-ALL(ph⁺-ALL)患者的首選方法)、T細胞受體(TCR)基因重排和異常白血病相關免疫表型(LAIP)等。但如今仍然有很大比例的ALL患者缺乏分子標志來監測MRD，從而為評估治療療效，預防復發和治療預后帶來較大困難。因此發現并監測與ALL相關的新融合基因對于病情診斷、治療方案制定、療效評價、預后評估及病變復發具有重要的臨床意義。

ACOT7又稱Acyl-CoA Thioesterase 7，編碼酰基輔酶A硫酯酶，可將?；o酶A水解為游離脂肪酸和輔酶A(CoASH)，具有調節細胞內?；o酶A、游離脂肪酸和CoASH水平的能力，可能在大腦中發揮重要的生理功能。有文章已經表明ACOT7表達水平高的急性髓性白血病(AML)患者通常預后較差，即使已經接受了異基因干細胞移植治療。而NPHP4即Nephrocystin4，其編碼的蛋白質參與腎小管發育，其突變與腎病有關。上述兩個基因在該ALL患者里形成了一種新融合基因ACOT7-NPHP4，并且是至今未見文獻報道的分子標志物。

發明內容

本發明的第一個目的在于，提供一種急性淋巴細胞白血病融合基因ACOT7-NPHP4。

本發明的第二個目的在于，提供融合基因ACOT7-NPHP4在制備急性淋巴細胞白血病診斷和/或監測制劑或試劑盒中的應用。

本發明的第三個目的在于，提供一種急性淋巴細胞白血病診斷和/或監測試劑盒。

本發明第四個目的在于，提供一種非疾病診斷目的的檢測ACOT7-NPHP4融合基因的方法。

為了實現上述第一個目的，本發明提供了一種ACOT7-NPHP4融合基因，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。

為了實現上述第二個目的，本發明提供了ACOT7-NPHP4融合基因在制備急性淋巴細胞白血病診斷和/或監測制劑或試劑盒中的應用。部分急性淋巴細胞白血病患者攜帶融合基因ACOT7-NPHP4，其可以作為患者特異性的分子標志物，并應用于臨床診斷、定期監測患者的微小殘留病變。

為了實現上述第三個目的，本發明提供了一種急性淋巴細胞白血病診斷和/或監測試劑盒，所述試劑盒含有檢測ACOT7-NPHP4融合基因或檢測其表達產物的試劑

作為一個優選方案，所述試劑盒包括上游引物、下游引物、Taqman探針、內參、PCR反應緩沖液、陽性對照和陰性對照；