[發明專利]基于多重熒光定量ARMS-PCR技術的新冠病毒奧密克戎突變序列檢測技術及其應用在審
| 申請號: | 202111497771.2 | 申請日: | 2021-12-09 |
| 公開(公告)號: | CN113943838A | 公開(公告)日: | 2022-01-18 |
| 發明(設計)人: | 孔祥賓;李萬帥;湯麗麗 | 申請(專利權)人: | 常州國藥醫學檢驗實驗室有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 常州市權航專利代理有限公司 32280 | 代理人: | 黃晶晶 |
| 地址: | 213000 江蘇省常*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 多重 熒光 定量 arms pcr 技術 病毒 奧密克戎 突變 序列 檢測 及其 應用 | ||
1.一種用于檢測新冠病毒核酸S基因突變類型的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括以下任一種或幾種引物和探針,其中每組中的引物都包含正向引物和反向引物,每個所述探針的兩端分別標記有熒光報告基團/熒光淬滅基團:
a.用于檢測S基因突變類型:序列位置23599,序列變化TG的引物和探針;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.1所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,其中探針的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;
b.用于檢測S基因突變類型:序列位置23048,序列變化GA的引物和探針;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.4所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,其中探針的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示;
c.用于檢測S基因突變類型:序列位置23202,序列變化CA的引物和探針;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.7所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示,其中探針的核苷酸序列如SEQ ID No.9所示;
d.用于檢測S基因突變類型:序列位置22898,序列變化GA的引物和探針;其中正向引物的核苷酸序列如:SEQ ID No.10所示,反向引物的核苷酸序列如SEQ ID No.11所示,其中探針的核苷酸序列如SEQ ID No.12所示。
2.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述熒光報告基團/熒光淬滅基團選自選自FAM、VIC或HEX、ROX、NED、CY3或CY5熒光報告基團/MGB或非MGB的BHQ1、BHQ2、BHQ3、Dabcy1、Tamra和Quencher熒光淬滅基團且試劑盒中各個所述探針上熒光報告基團互不相同。
3.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括以下組分中的任一種或幾種:PCR反應液、酶混合液、陽性對照、陰性對照。
4.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述PCR反應液包括緩沖液、MgCl2、dUTP和dNTPs;所述酶混合液包括Taq酶、反轉錄酶和UNG酶。
5.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述陽性對照為含有新冠病毒突變序列的假病毒。
6.根據權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述陰性對照為含有部分新冠病毒的基因序列的假病毒。
7.根據權利要求1所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括用于檢測內標的探針。
8.根據權利要求7所述的試劑盒,其特征在于,所述探針包括核苷酸序列如SEQ IDNo.13、SEQ ID No.14、SEQ ID No.15所示的多核苷酸中的任一種或幾種。
9.如權利要求1-8任一項所述試劑盒用于檢測以下任一種或幾種新冠病毒核酸S基因突變類型中的用途:a,S基因突變類型:序列位置23599,序列變化TG;b.S基因突變類型:序列位置23048,序列變化GA;c.S基因突變類型:列位置23202,序列變化CA;d.S基因突變類型:序列位置22898,序列變化GA。
10.如權利要求1-8任一項所述試劑盒在制備檢測以下任一種或幾種新冠病毒核酸S基因突變類型的產品中的用途:a.S基因突變類型:序列位置23599,序列變化TG;b.S基因突變類型:序列位置23048,序列變化GA;c.S基因突變類型:序列位置23202,序列變化CA;d.S基因突變類型:序列位置22898,序列變化GA。
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