[發(fā)明專(zhuān)利]基于秋石斛轉(zhuǎn)錄組序列開(kāi)發(fā)的EST-SSR標(biāo)記及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202111383204.4
• 申請(qǐng)日: 2021-11-22
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN113981128B
• 公開(kāi)（公告）日: 2023-10-20
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 易雙雙;陸順教;黃明忠;廖易;李崇暉;羅小燕;張志群
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶作物品種資源研究所
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 海口翔翔專(zhuān)利事務(wù)有限公司 46001
• 代理人: 張耀婷

1.基于秋石斛轉(zhuǎn)錄組序列開(kāi)發(fā)的EST-SSR標(biāo)記，其特征在于：微衛(wèi)星標(biāo)記編號(hào)為：Den2、Den7、Den12、Den17、Den18、Den19、Den24、Den27、Den38、Den46、Den47、Den51、Den57、Den60、Den63、Den72、Den75、Den82、Den94和Den95；其核苷酸序列分別如SEQ ID NO.1～SEQ IDNO.20所示。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于秋石斛轉(zhuǎn)錄組序列開(kāi)發(fā)的EST-SSR標(biāo)記，其特征在于：包括20對(duì)引物組，分別為DenSSR2、DenSSR7、DenSSR12、DenSSR17、DenSSR18、DenSSR19、DenSSR24、DenSSR27、DenSSR38、DenSSR46、DenSSR47、DenSSR51、DenSSR57、DenSSR60、DenSSR63、DenSSR72、DenSSR75、DenSSR82、DenSSR94和DenSSR95，其引物序列分別為：

DenSSR2 F：AGAGGAGAGGAGTTCGAAGAGAC

DenSSR2 R：TGTTCTCAACGGTTACTACTGCC

DenSSR7 F：GTAACGCTGGTATTTGCTCTCAG

DenSSR7 R：AGCTTGACGTATTTGAGCTTCAC

DenSSR12F：GTACCCGCCTTATAATGGTCTCT

DenSSR12R：GAGTGAGGATGCTAAGTACCCAA

DenSSR17 F：CGGCCAGTGGAACAGTTTATATT

DenSSR17R：CACTTGCTGTTGATTTCCATACA

DenSSR18 F：GTTGATTACTCGCCAAATAGCTC

DenSSR18R：GCTTTGTCTTCGTAGCTGTTCAT

DenSSR19 F：TTTTTATTTTGGGGAATGACAAC

DenSSR19R：AGTTAGCTTTCTATTGCGCGAG

DenSSR24 F：TTGATAATAGACCTAGCCAAGCA

DenSSR24R：ATTAATCAAAAGTCGTAGCACCG

DenSSR27F：AGGGAATAGAGACGTGAGCTTCT

DenSSR27R：GAAGATTCGCAGATCAATGAAGA

DenSSR38 F：GGAATTTTTGTCATGCAGCTTAT

DenSSR38R：TTTGAAGACGAGGAGCATAACTC

DenSSR46 F：AGCTAAAAGTGCACAGAAGACCA

DenSSR46R：ATACATGTTGCACTCGCTCTTGT

DenSSR47 F：AGTGGAAAACTTTCCTTCTCCCT

DenSSR47R：GGATCTTCCCATCTTCTCTCATC

DenSSR51F：CCAACGGCATTGTTGTGAT

DenSSR51R：CCTCCCAACTATCGCTCTTCTAC

DenSSR57F：TTGTAGGAGGTATTGGACTGAGG

DenSSR57R：AGACGAAGAAACCAATGATGCTA

DenSSR60F：CTTAAAACCGGCATCGCTATATT

DenSSR60R：CTCTTTCTCATCTATTTGCTCCG

DenSSR63F：TCTTTCTCTTTCATCGCTAGTGC

DenSSR63R：CCAGTAGAGGACGTAAGAACCTG

DenSSR72F：GCTCATGTTGTTCCATTCCTG

DenSSR72R：AGGAAAAAGAGAGGAAAGAGCAG

DenSSR75F：GGGAAACTCTGTGGATTGGAAG

DenSSR75R：AAGTCTGTTAATCGCAAGGACAA

DenSSR82F：TTCCCATCATCAAAATGTCTAGC

DenSSR82R：GGAGAATGATGCTTGAGAAGATG

DenSSR94F：TCCTTCACACGCAAGGATAAGTA

DenSSR94R：CATGACTGAGTTAACTGTGGACG

DenSSR95F：AATTCGTAAAGCACCAAGTGAAA

DenSSR95R：ACCTTCATGCAAATCCTAGATCA。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的基于秋石斛轉(zhuǎn)錄組序列開(kāi)發(fā)的EST-SSR標(biāo)記中的引物在構(gòu)建秋石斛遺傳圖譜、秋石斛種質(zhì)鑒定、秋石斛育種、在秋石斛遺傳多樣性分析、秋石斛親緣關(guān)系分析、秋石斛分子標(biāo)記輔助育種、石斛屬親緣關(guān)系分析、石斛屬遺傳多樣性分析中的應(yīng)用。