[發明專利]一種食管癌基因甲基化水平檢測試劑及其應用

有效

• 申請號: 202111344786.5
• 申請日: 2021-11-15
• 公開（公告）號: CN113789388B
• 公開（公告）日: 2022-03-25
• 發明（設計）人: 張良祿;周俊;董蘭蘭;吳志誠;熊楊輝;萬康康;李婷婷
• 申請（專利權）人: 蘇州艾米森生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 北京超凡宏宇專利代理事務所(特殊普通合伙) 11463
• 代理人: 黃燕

本發明公開了一種食管癌基因甲基化水平檢測試劑及其應用，涉及癌癥診斷技術領域。本發明提出了一種新的具有食管癌特異性的DNA甲基化分子標志物，通過檢測OTOP2基因的甲基化水平，可以對食管癌進行特異性診斷。對于提高食管癌早期診療效果和降低死亡率均有重要的臨床應用價值和社會意義。

技術領域

本發明涉及癌癥診斷技術領域，具體而言，涉及一種食管癌基因甲基化水平檢測試劑及其應用。

背景技術

食管癌是一種全球范圍內常見的惡性腫瘤，每年導致超過 40萬人死亡。食管癌分為兩種主要的組織病理學亞型：食管鱗狀細胞癌（鱗癌）和食管腺癌，二者具有不同的起源細胞、流行病學和腫瘤分子生物學。食管鱗狀細胞癌主要來源于食道的鱗狀上皮細胞，食管腺癌起源于胃食管交界處的腺細胞，并與食管下段胃酸反流有關。二者的流行病學特征也不同，全球約有 79% 的食管鱗狀細胞癌病例發生在東南亞和中亞，也存在于非洲東南部和南美洲，食管腺癌主要流行與歐洲、北美和大洋洲。食管鱗狀上皮內瘤變與食管鱗癌的發生密切相關，屬于鱗癌的癌前病變，Barrett食管相關異性增生則是腺癌的癌前病變。

目前，超過90%的食管癌患者確診時已發展至中晚期，總體5年生存率不到20%，而僅累及粘膜層和粘膜下淺層的早期食管癌通常可經內鏡下微創治療根治，患者的5年生存率可＞95%。因此，癌癥的早期發現、早期診斷和早期治療是降低死亡率、提高生存率的主要策略。

內鏡和活檢病理檢查是目前診斷早期食管癌的金標準，但內鏡檢查需要做鏡前準備，且操作復雜，需要專業的技術人員，有侵入性，可能會使用到麻醉劑，因此不適合大規模人群篩查，食管癌檢測亟需無創檢測方法。

人體血液中存在循環游離 DNA (cfDNA)，血液中cfDNA來源于凋亡、壞死的細胞或外泌體分泌等，研究發現，癌癥患者血液樣本中的cfDNA 含量高于健康個體的血液樣本，腫瘤來源的cfDNA，稱為循環腫瘤 DNA（ctDNA），ctDNA中含有腫瘤特異性的遺傳改變和表觀遺傳學改變，可以用作癌癥檢測的標志物。其中，DNA甲基化水平異常是癌癥發生的早期事件，可以用于早期食管癌檢測。由于cfDNA在血液中具有含量少、提取困難、存在周期短等缺點，且血液中的cfDNA 來源于全身各個組織，很多標記物在多種類型的癌癥中均會出現甲基化異常，因此尋求腫瘤特異性的甲基化標記物充滿挑戰，目前尚缺乏可用于食管癌檢測的血液甲基化標志物。

鑒于此，特提出本發明。

發明內容

本發明的目的在于提供一種食管癌基因甲基化水平檢測試劑及其應用以解決上述技術問題。

DNA甲基化是基因上重要的一種化學修飾，影響著基因轉錄的調控過程和細胞核結構。DNA甲基化的改變是癌癥發展的早期事件和伴隨事件，主要體現在腫瘤組織上抑癌基因的高甲基化和原癌基因的低甲基化等。而且DNA甲基化較穩定，如果可以發現腫瘤特異的血液DNA甲基化分子標志物則有巨大的臨床應用價值。

基于此，本發明特提出了一種新的具有食管癌特異性的DNA甲基化分子標志物，通過檢測OTOP2基因的甲基化水平，可以對食管癌進行特異性診斷。對于提高食管癌早期診療效果和降低死亡率均有重要的臨床應用價值和社會意義。

本發明是這樣實現的：

本發明提供了一種用于檢測OTOP2基因甲基化水平的物質在制備產品中的應用，產品的用途為如下中的至少一種：

診斷或輔助診斷食管癌或癌前病變；

區分食管癌樣本和非癌樣本。

OTOP2基因編碼Otopetrin-2蛋白，目前關于OTOP2基因CpG島甲基化與食管癌的關系尚未被現有技術報道。僅有研究表明Otopetrin-2蛋白在結直腸癌組織中的表達下調。