[發明專利]一種食管癌基因甲基化水平檢測試劑及其應用

有效

• 申請號: 202111344786.5
• 申請日: 2021-11-15
• 公開（公告）號: CN113789388B
• 公開（公告）日: 2022-03-25
• 發明（設計）人: 張良祿;周俊;董蘭蘭;吳志誠;熊楊輝;萬康康;李婷婷
• 申請（專利權）人: 蘇州艾米森生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 北京超凡宏宇專利代理事務所(特殊普通合伙) 11463
• 代理人: 黃燕

1.一種試劑，其特征在于，其包括如下至少一種的核酸組合：核酸組合1、核酸組合2、核酸組合3、核酸組合4、核酸組合5和核酸組合6；

所述核酸組合1的堿基序列如SEQ ID NO.1-3所示，所述核酸組合2的堿基序列如SEQID NO.4-6所示，所述核酸組合3的堿基序列如SEQ ID NO.7-9所示，所述核酸組合4的堿基序列如SEQ ID NO.10-12所示，所述核酸組合5的堿基序列如SEQ ID NO.13-15所示，所述核酸組合6的堿基序列如SEQ ID NO.16-18所示；區域所在位置參考的人類基因組版本號為GRCh38.p13。

2.根據權利要求1所述的試劑，其特征在于，所述試劑包括如下至少一種的核酸組合：核酸組合2和核酸組合4。

3.一種試劑盒，其特征在于，其包括權利要求1或2所述的試劑。

4.根據權利要求3所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒的檢測樣本為組織樣本、血液樣本或食管來源的細胞樣本；

所述血液樣本選自血漿樣本、血清樣本或全血樣本。

5.用于檢測OTOP2基因CpG島甲基化水平的核酸組合在制備產品中的應用，其特征在于，所述產品的用途為如下中的至少一種：

診斷或輔助診斷食管癌或癌前病變；

區分食管癌樣本和非癌樣本；所述產品選自如下產品中的至少一種：試劑、試劑盒、芯片和測序文庫；

所述OTOP2基因甲基化水平為OTOP2基因中如下至少一種CpG島區域的甲基化水平：區域1、區域2、區域3、區域4、區域5和區域6；

其中，所述區域1選自Chr17:74923881-74924015正鏈，所述區域2選自Chr17:74924159-74924335正鏈，所述區域3選自Chr17:74924422-74924581正鏈，所述區域4選自Chr17:74924603-74924449負鏈，所述區域5選自Chr17:74924425-74924297負鏈，所述區域6選自Chr17:74924080-74923981負鏈；區域所在位置參考的人類基因組的版本號為GRCh38.p13。

6.根據權利要求5所述的應用，其特征在于，所述OTOP2基因甲基化水平為OTOP2基因中如下至少一種CpG島區域的甲基化水平：區域2和區域4。

7.根據權利要求5所述的應用，其特征在于，所述核酸組合選自如下核酸組合中的至少一種：用于檢測所述區域1的核酸組合1、用于檢測所述區域2的核酸組合2、用于檢測所述區域3的核酸組合3、用于檢測所述區域4的核酸組合4、用于檢測所述區域5的核酸組合5和用于檢測所述區域6的核酸組合6；

所述核酸組合1的堿基序列如SEQ ID NO.1-3所示，所述核酸組合2的堿基序列如SEQID NO.4-6所示，所述核酸組合3的堿基序列如SEQ ID NO.7-9所示，所述核酸組合4的堿基序列如SEQ ID NO.10-12所示，所述核酸組合5的堿基序列如SEQ ID NO.13-15所示，所述核酸組合6的堿基序列如SEQ ID NO.16-18所示。