[發明專利]一種慢性淋巴細胞白血病SSCR風險模型及其建立方法和應用

有效

• 申請號: 202111324679.6
• 申請日: 2021-11-09
• 公開（公告）號: CN113782087B
• 公開（公告）日: 2022-01-18
• 發明（設計）人: 張婭;王欣;田箏
• 申請（專利權）人: 山東第一醫科大學附屬省立醫院（山東省立醫院）
• 主分類號: G16B5/00
• 分類號: G16B5/00;G16B40/10;G16B50/00;G16H50/20;G16H50/30;G16H50/50;C12Q1/6886
• 代理公司: 濟南圣達知識產權代理有限公司 37221
• 代理人: 宋海海

本發明提供一種慢性淋巴細胞白血病SSCR風險模型及其建立方法和應用，屬于疾病預后和分子生物學技術領域。本發明采用高通量測序的慢性淋巴細胞白血病(CLL)表達譜，進一步證實CLL的異質性，驗證基于CLL細胞分化的CLL患者分類，預測患者預后。本發明將CLL細胞按分化狀態分為兩組，并對CLL細胞分化相關基因進行鑒定。最后，選擇4個最具預后意義的CLL細胞分化相關基因，建立基于CLL細胞分化相關基因的SSCR風險評分模型，經驗證該風險評分模型對CLL患者總生存期及首次治療時間預測具有良好的可靠性。該評分系統可以幫助醫生根據CLL細胞分化狀況預測患者的預后，選擇最佳的治療方案，具有良好的實際應用價值。

技術領域

本發明屬于疾病預后和分子生物學技術領域，具體涉及一種慢性淋巴細胞白血病SSCR風險模型及其建立方法和應用。

背景技術

公開該背景技術部分的信息僅僅旨在增加對本發明的總體背景的理解，而不必然被視為承認或以任何形式暗示該信息構成已經成為本領域一般技術人員所公知的現有技術。

慢性淋巴細胞白血病(CLL)是一種惡性淋巴系統腫瘤，臨床過程和生物學行為呈高度異質性。大多數患者經歷惰性病程，而一些患者經歷侵襲性病程，并需要早期給藥。研究人員已經確定了一些預后生物標志物和評分系統，以指導CLL患者的臨床管理。IGHV突變狀態、染色體畸變和基因突變被證明是有效的預后生物標志物。然而，現有的風險模型難以精準判斷患者預后情況。隨著新型測序技術的發展，基于CLL患者基因組改變的生物標志物在CLL預后評估中的作用及應用仍有待進一步研究。

近年來，測序技術的進步，包括批量RNA測序和單細胞RNA測序技術的不斷進展，使得識別CLL的新驅動因素成為可能。腫瘤內CLL的異質性促進了CLL的克隆進化，從而導致對治療的耐藥性。CLL譜系樹顯示，CLL細胞從正常B細胞轉化后基因表達情況具有快速變化的特點。

單細胞轉錄組學分析為描述CLL基因狀態的改變提供了機會。通過根據偽時序對CLL細胞進行排序，研究者可以揭示癌癥進化的生物學過程。Monocle是一種用于R的軟件包，它被用于單細胞RNA測序的偽時序分析，即根據生物過程的進展對單細胞進行排序。因此，將單細胞RNA測序與軌跡分析相結合，有望幫助研究者識別處于不同分化狀態的腫瘤細胞，完善對患者的分類方法，進而改善患者的治療及預后。

發明內容

本發明提供一種慢性淋巴細胞白血病SSCR風險模型及其建立方法和應用。本發明采用高通量測序的CLL基因表達譜，進一步證實CLL的異質性，驗證基于CLL細胞分化狀態的CLL患者分群，以細化患者危險度分層。本發明將CLL細胞按分化狀態分為兩組，并鑒定了與CLL細胞分化狀態相關的CLL細胞分化相關基因。然后，對CLL細胞分化相關基因的特性進行了探討。最后，選擇4個最具預后意義的CLL細胞分化相關基因，建立基于CLL細胞分化相關基因的SSCR風險評分模型，揭示并驗證了SSCR風險評分模型的預后價值。

具體的，本發明涉及以下技術方案：

本發明的第一個方面，提供一種用于慢性淋巴細胞白血病預后評估的標志物，所述標志物包括選自下列基因中的任意一種或多種：SORL1、SGK1、CYBB和RPL22L1。

其中，所述預后評估具體包括對慢性淋巴細胞白血病患者總生存期(OS)和首次治療時間(TTFT)的評估。

本發明的第二個方面，提供檢測上述標志物的表達水平的試劑在制備產品中的應用，所述產品用于慢性淋巴細胞白血病預后評估。

本發明的第三個方面，提供一種慢性淋巴細胞白血病SSCR風險模型(SSCR)，所述慢性淋巴細胞白血病SSCR風險模型，其具體為基因表達量(SORL1)×(-1.378)+基因表達量(SGK1)×(-0.8055)+基因表達量(CYBB)×1.094+基因表達量(RPL22L1)×2.251。

本發明的第四個方面，提供上述慢性淋巴細胞白血病SSCR風險模型的建立方法，所述建立方法包括：