[發(fā)明專利]一種慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型及其建立方法和應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202111324679.6
• 申請(qǐng)日: 2021-11-09
• 公開（公告）號(hào): CN113782087B
• 公開（公告）日: 2022-01-18
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 張婭;王欣;田箏
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 山東第一醫(yī)科大學(xué)附屬省立醫(yī)院（山東省立醫(yī)院）
• 主分類號(hào): G16B5/00
• 分類號(hào): G16B5/00;G16B40/10;G16B50/00;G16H50/20;G16H50/30;G16H50/50;C12Q1/6886
• 代理公司: 濟(jì)南圣達(dá)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 37221
• 代理人: 宋海海

1.一種慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型在慢性淋巴細(xì)胞白血病預(yù)后評(píng)估系統(tǒng)中的應(yīng)用，所述慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型，其具體為基因表達(dá)量SORL1×-1.378+基因表達(dá)量SGK1×-0.8055+基因表達(dá)量CYBB×1.094+基因表達(dá)量RPL22L1×2.251；

所述慢性淋巴細(xì)胞白血病預(yù)后評(píng)估系統(tǒng)用于對(duì)慢性淋巴細(xì)胞白血病患者總生存期和首次治療時(shí)間進(jìn)行評(píng)估。

2.如權(quán)利要求1所述應(yīng)用，其特征在于，所述慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型的建立方法包括：

S1、數(shù)據(jù)采集：采集人類CLL樣本的單細(xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)和批量RNA測(cè)序數(shù)據(jù)；

S2、單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)處理：采用Seurat包和Monocle包對(duì)步驟S1獲得的CLL細(xì)胞相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理；

S3、軌跡分析：選擇用于聚類判定的標(biāo)記基因，根據(jù)擬時(shí)間對(duì)細(xì)胞進(jìn)行排序，并用軌跡描述CLL細(xì)胞所經(jīng)歷的生物過程；進(jìn)行了分支表達(dá)分析，鑒定具有分支依賴性表達(dá)的基因即CLL細(xì)胞分化相關(guān)基因；

S4、構(gòu)建慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型：將CLL細(xì)胞分化相關(guān)基因進(jìn)行回歸分析，并構(gòu)建慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型。

3.一種慢性淋巴細(xì)胞白血病預(yù)后評(píng)估系統(tǒng)，其特征在于，所述系統(tǒng)包括：

i)分析單元，所述分析單元包含：用于確定受試者的待測(cè)樣品中選自CLL細(xì)胞分化相關(guān)基因表達(dá)水平的檢測(cè)物質(zhì)，以及；

ii)評(píng)估單元，所述評(píng)估單元包含：根據(jù)i)中確定的所述CLL細(xì)胞分化相關(guān)基因的表達(dá)水平對(duì)所述受試者進(jìn)行預(yù)后評(píng)估；

所述步驟i)分析單元中，所述CLL細(xì)胞分化相關(guān)基因選自SORL1、SGK1、CYBB和RPL22L1組成的組；

所述步驟ii)評(píng)估單元具體評(píng)估流程包括：根據(jù)i)中確定的所述CLL細(xì)胞分化相關(guān)基因表達(dá)水平，基于慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型進(jìn)行預(yù)后評(píng)估；

其中，所述慢性淋巴細(xì)胞白血病SSCR風(fēng)險(xiǎn)模型，其計(jì)算公式=基因表達(dá)量SORL1×-1.378+基因表達(dá)量SGK1×-0.8055+基因表達(dá)量CYBB×1.094+基因表達(dá)量RPL22L1×2.251。

4.如權(quán)利要求3所述的慢性淋巴細(xì)胞白血病預(yù)后評(píng)估系統(tǒng)，其特征在于，所述預(yù)后評(píng)估包括對(duì)慢性淋巴細(xì)胞白血病患者總生存期和首次治療時(shí)間的評(píng)估；

在用于對(duì)慢性淋巴細(xì)胞白血病患者總生存期進(jìn)行評(píng)估時(shí)；

受試者SSCR指數(shù)高于閾值時(shí)為高表達(dá)，則指示受試者總生存期較短；

受試者SSCR指數(shù)低于閾值時(shí)為低表達(dá)，則指示受試者總生存期較長(zhǎng)；

在用于對(duì)慢性淋巴細(xì)胞白血病患者首次治療時(shí)間進(jìn)行評(píng)估時(shí)；

受試者SSCR指數(shù)高于閾值時(shí)為高表達(dá)，則指示受試者首次治療時(shí)間較短；

受試者SSCR指數(shù)低于閾值時(shí)為低表達(dá)，則指示受試者首次治療時(shí)間較長(zhǎng)。