[發明專利]一種基于遺傳因素的肺癌預后分期檢測試劑、系統及應用在審
| 申請號: | 202111285733.0 | 申請日: | 2021-11-02 |
| 公開(公告)號: | CN113817834A | 公開(公告)日: | 2021-12-21 |
| 發明(設計)人: | 歐陽錦;黃邵鑫;楊勇;杜博賈;陳希;韓強強 | 申請(專利權)人: | 譜度眾合(武漢)生命科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 武漢臻誠專利代理事務所(普通合伙) 42233 | 代理人: | 胡星馳 |
| 地址: | 430070 湖北省武漢市*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 遺傳 因素 肺癌 預后 分期 檢測 試劑 系統 應用 | ||
1.一種肺癌預后分期檢測試劑,其特征在于,包括SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表達水平檢測試劑一種或多種的組合。
2.如權利要求1所述的肺癌預后分期檢測試劑,其特征在于,包括SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表達水平檢測試劑。
3.如權利要求1和2任意一項所述的肺癌預后分期檢測試劑,其特征在于,所述基因標量檢測試劑為基因mRNA表達水平檢測試劑。
4.如權利要求3所述的肺癌預后分期檢測試劑,其特征在于,所述基因mRNA表達水平檢測試劑包括GSE30219、GSE37745和GSE50081芯片。
5.一種肺癌預后分期檢測系統,其特征在于,包括基因表達水平獲取模塊、判斷模塊;
所述基因表達水平獲取模塊用于獲取SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因中一個或多個基因表達水平,并提交給判斷模塊;
所述判斷模塊,以SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因一個或多個基因表達水平為分類器的輸入,判斷樣本是否來自肺癌預后高風險患者。
6.如權利要求5所述的肺癌預后分期檢測系統,其特征在于,所述判斷模塊采用的判斷值指標為:
PRS=0.1223*Exp(SPP1)+0.1862*EXp(SLC20A1)-0-0909*Exp(TRIM68)-0.1693*Exp(CYB5D2)+0.1954*Exp(CENPH)-0.2869*Exp(MAGEE1)-0.1069*Exp(C16ORF54)
其中,Exp()為表達量函數。
7.一種如權利要求1至4任意一項所述的肺癌預后分期檢測試劑的應用,其特征在于,SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表達水平檢測試劑一種或多種的組合應用于制備肺癌早期預后定量檢測試劑。
8.如權利要求7所述的肺癌預后分期檢測試劑的應用,其特征在于,SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表達水平檢測試劑的組合應用于制備肺癌早期預后定量檢測試劑。
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