[發明專利]應用于紅細胞超分辨成像及單分子追蹤的綜合分析方法在審
| 申請號: | 202111207994.0 | 申請日: | 2021-10-18 |
| 公開(公告)號: | CN113945549A | 公開(公告)日: | 2022-01-18 |
| 發明(設計)人: | 楊薇;葉智偉;肖義 | 申請(專利權)人: | 國科溫州研究院(溫州生物材料與工程研究所);大連理工大學 |
| 主分類號: | G01N21/64 | 分類號: | G01N21/64 |
| 代理公司: | 大連星海專利事務所有限公司 21208 | 代理人: | 楊翠翠 |
| 地址: | 325000 浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 應用于 紅細胞 分辨 成像 分子 追蹤 綜合分析 方法 | ||
1.應用于紅細胞超分辨成像及單分子追蹤的綜合分析方法,其特征在于,包括以下步驟:
S1、樣品的制備
采指尖血,加入等比例抗凝血劑及適宜濃度的細胞膜熒光染料染色,待染色完畢后,使用等滲溶液洗去多余染料,得到熒光染料標記的血紅細胞樣品。
S2、紅細胞的固定
將熒光染色后的血紅細胞樣品注入到高通量微流控芯片中,芯片中紅細胞固定腔室的高度不超過紅細胞線度的一倍,紅細胞被吸入紅細胞固定腔室后被單層固定;
S3、基于單分子定位的超分辨成像
載有紅細胞的微流控芯片置于超分辨顯微鏡上進行成像觀察,高密度單分子信號疊加后得到紅細胞的超分辨重構圖;
S4、單分子追蹤分析
低密度單分子信號疊加后進行單顆粒的追蹤分析;
在超分辨成像中通過點擴散函數PSF獲得的單分子定位信息,得到細胞的定位坐標可以直接應用于單分子追蹤分析;
r2是單分子在Δt時間內運動的平方位移,計算如下:
r2(t,Δt)=(xt-xt+Δt)2+(yt-yt+Δt)2 (1)
其中:Δt是成像拍攝的曝光時間,t為該分子定位的時刻,xt為t時刻的該分子的x坐標值,xt+Δt為為t+Δt時刻的該分子的x坐標值;yt為t時刻的該分子的y坐標值,yt+Δt為為t+Δt時刻的該分子的y坐標值;
細胞膜表面單個分子的均方位移MSD,計算如下:
其中:N為該分子追蹤軌跡中Δt時間間隔出現次數;
單條追蹤軌跡的累計密度分布CDF,計算如下:
其中:D是單分子軌跡的擴散系數。
而對整個細胞進行擴散動力學分析,擴散系數概率密度PDF,計算如下:
其中,μ為平均數,σ為標準差;
根據對數正態分布,單細胞的平均擴散系數,計算如下:
如果細胞中包含兩種擴散形式或兩種擴散分布,使用雙指數方程進行擬合:
其中:w是擴散系數為的組分比例,與分別為兩種組分的擴散系數
紅細胞表面的單分子運動瞬時速度,也間接的反映了細胞膜的流動性,計算如下:
其中,r(t,Δt)是單分子在Δt時間內運動的位移。
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