[發明專利]一種微孔陣列芯片的數字PCR實時分析方法

在審

• 申請號: 202111145791.3
• 申請日: 2021-09-28
• 公開（公告）號: CN113846149A
• 公開（公告）日: 2021-12-28
• 發明（設計）人: 夏江;高鵬
• 申請（專利權）人: 領航基因科技（杭州）有限公司
• 主分類號: C12Q1/686
• 分類號: C12Q1/686;B01L7/00;G16B20/30;G06K9/62
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 陸惠中

1.一種微孔陣列芯片的數字PCR實時分析方法，其特征在于，包括以下步驟：

S1:微孔的傾斜矯正；

S2:圖片的偏移矯正；

S3:提取熒光值；

S4:基于隨機森林計算預測CT值。

2.根據權利要求1所述的數字PCR實時分析方法，其特征在于，S1包括：

S11假設第i個循環中微孔圖片表示為Micro_imgⁱ,Micro_imgⁱ包括的微孔的數量為NUM_micro,微孔的中心坐標位置表示point(posx^k，posy^k)，其中0k≤NUM_micro；0i≤NUM_loop,NUM_loop表示循環次數；

S12新建一張與微孔圖片Micro_imgⁱ尺寸相同的圖片，記為Gray_cpimgⁱ,Gray_cpimgⁱ像素值為0；

S13遍歷Micro_imgⁱ中的微孔單元，如果微孔point(posx^m，posy^m)與微孔point(posxⁿ，posyⁿ)滿足：abs(posx^m-(posxⁿ)≤20abs(posy^m-posyⁿ)≤7,則以point(posx^m，posy^m)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為255；

S14以point(posx^m，posy^m-1)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ-1)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為200；

S15以point(posx^m，posy^m+1)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ+1)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為200；

S16以point(posx^m，posy^m-2)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ-2)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為200；

S17以point(posx^m，posy^m+2)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ+2)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為200；

S18以point(posx^m，posy^m-3)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ-3)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為150；

S19以point(posx^m，posy^m+3)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ+3)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為150；

S110以point(posx^m，posy^m-4)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ-4)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為150；

S111以point(posx^m，posy^m+4)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ+4)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為150；

S112以point(posx^m，posy^m-5)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ-5)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為100；

S113以point(posx^m，posy^m+5)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ+5)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為100；

S114以point(posx^m，posy^m-6)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ-6)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為100；

S115以point(posx^m，posy^m+6)為起始點，point(posxⁿ，posyⁿ+6)為終點，在圖片Gray_cpimgⁱ對應位置連接兩坐標點，直線的像素值大小為100；

S116設置圖片Gray_cpimgⁱ起始旋轉角度為first_angleⁱ＝-5和終止選擇角度為end_angleⁱ＝5,選擇步長設置為step_angleⁱ＝0.02；Gray_cpimgⁱ的中心坐標為point_center(poscenx,posceny)，其中

For rorate_angle first_angleⁱ:end_angleⁱ步長為step_angleⁱ

Gray_cpimgⁱ以point_center(poscenx,posceny)為中心點，旋轉角度rorate_angle；

每次旋轉后，計算圖像每一行的像素值之和，且把像素值之和賦予img_graycolssumⁱ(u,v),其中0≤uimg_height,0≤vrorate_sizeⁱ,

S117計算img_graycolssumⁱ(u,v)每一行的最大值，且對最大值對應的旋轉角度進行統計。如果旋轉角度出現的次數最多，那么設置為圖片Micro_imgⁱ矯正角度。